Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

Predictions only

Length 1,337 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 ZNF33A-205ENST00000469037 1530 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PTPRJQ12913 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PTPRJQ12913 ALDH7A1-201ENST00000409134 4964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PTPRJQ12913 SLC37A4-202ENST00000357590 2356 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PTPRJQ12913 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PTPRJQ12913 SLC16A1-201ENST00000369626 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PTPRJQ12913 ATP5A1-201ENST00000282050 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PTPRJQ12913 DAO-201ENST00000228476 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PTPRJQ12913 ADAMTS13-202ENST00000356589 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PTPRJQ12913 ZNF772-203ENST00000425074 1601 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PTPRJQ12913 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PTPRJQ12913 KIZ-208ENST00000616848 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PTPRJQ12913 AC022364.1-202ENST00000617468 2409 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
PTPRJQ12913 SLC23A1-201ENST00000348729 2299 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PTPRJQ12913 GPR107-208ENST00000610997 2813 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PTPRJQ12913 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PTPRJQ12913 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PTPRJQ12913 PDK2-203ENST00000503176 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PTPRJQ12913 PLA2G2E-201ENST00000375116 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PTPRJQ12913 SH3BGR-202ENST00000380631 780 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PTPRJQ12913 AC016757.1-202ENST00000409376 892 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PTPRJQ12913 FAM126A-201ENST00000409763 616 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PTPRJQ12913 LRRC3-AS1-201ENST00000426578 784 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PTPRJQ12913 MKNK1-205ENST00000428112 1270 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PTPRJQ12913 RAB34-211ENST00000450529 1184 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PTPRJQ12913 AC092656.1-202ENST00000515843 998 ntTSL 4 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PTPRJQ12913 ZNF268-210ENST00000541211 781 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PTPRJQ12913 AC092862.1-201ENST00000541534 533 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
PTPRJQ12913 AC134312.2-201ENST00000563521 608 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PTPRJQ12913 RN7SL162P-201ENST00000579233 292 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
PTPRJQ12913 THY1-209ENST00000580275 578 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PTPRJQ12913 URAHP-205ENST00000610227 398 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
PTPRJQ12913 CR589904.1-202ENST00000611154 660 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PTPRJQ12913 NEAT1-204ENST00000612303 572 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PTPRJQ12913 Metazoa_SRP.127-201ENST00000614914 302 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
PTPRJQ12913 DNAJC17-212ENST00000627802 428 ntTSL 4 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PTPRJQ12913 CD1A-201ENST00000289429 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PTPRJQ12913 AL031728.1-201ENST00000449034 2479 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PTPRJQ12913 DAXX-213ENST00000620164 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PTPRJQ12913 RABGEF1-210ENST00000437078 4319 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PTPRJQ12913 UNC5CL-201ENST00000244565 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PTPRJQ12913 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PTPRJQ12913 GLT6D1-201ENST00000371763 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PTPRJQ12913 GLT6D1-202ENST00000613244 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PTPRJQ12913 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PTPRJQ12913 TMUB2-215ENST00000592825 2151 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PTPRJQ12913 FAM168A-202ENST00000356467 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PTPRJQ12913 HERPUD1-202ENST00000344114 1388 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PTPRJQ12913 COPS7B-201ENST00000350033 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PTPRJQ12913 FFAR4-202ENST00000371483 3653 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PTPRJQ12913 AP001999.1-201ENST00000513405 3684 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PTPRJQ12913 VDAC2-202ENST00000313132 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PTPRJQ12913 STIM1-201ENST00000300737 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PTPRJQ12913 DPP8-201ENST00000300141 3139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PTPRJQ12913 AC019205.2-203ENST00000421315 3362 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PTPRJQ12913 HNRNPH1-204ENST00000442819 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PTPRJQ12913 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PTPRJQ12913 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PTPRJQ12913 INVS-201ENST00000262456 2968 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PTPRJQ12913 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PTPRJQ12913 TUBB2A-201ENST00000333628 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PTPRJQ12913 LRP8-203ENST00000354412 2553 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PTPRJQ12913 SNCAIP-203ENST00000379538 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PTPRJQ12913 ZNF771-204ENST00000566625 2415 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PTPRJQ12913 NPNT-211ENST00000506666 2187 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PTPRJQ12913 ARF4-201ENST00000303436 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PTPRJQ12913 TMEM9B-202ENST00000525069 1433 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PTPRJQ12913 CTTN-201ENST00000301843 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PTPRJQ12913 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PTPRJQ12913 ARMC5-201ENST00000268314 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PTPRJQ12913 CGB7-203ENST00000597853 3386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PTPRJQ12913 AFG3L2P1-201ENST00000521792 1763 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
PTPRJQ12913 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PTPRJQ12913 TMEM14B-201ENST00000379530 787 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PTPRJQ12913 CHCHD2-201ENST00000395422 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PTPRJQ12913 KCNE1-203ENST00000399286 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PTPRJQ12913 CFAP36-203ENST00000403007 759 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PTPRJQ12913 CNRIP1-202ENST00000409559 644 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PTPRJQ12913 RN7SKP102-201ENST00000411186 315 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
PTPRJQ12913 AL513165.1-201ENST00000413915 289 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PTPRJQ12913 Z97652.1-201ENST00000415176 329 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PTPRJQ12913 AL080243.1-201ENST00000423293 1060 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
PTPRJQ12913 RPSAP12-201ENST00000435879 888 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
PTPRJQ12913 RPL35P1-201ENST00000450819 370 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
PTPRJQ12913 AL357140.1-201ENST00000454104 424 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PTPRJQ12913 TCEAL4-206ENST00000468024 1135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PTPRJQ12913 LINC00301-203ENST00000527161 749 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PTPRJQ12913 AC079336.3-201ENST00000577227 475 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PTPRJQ12913 AC010531.8-201ENST00000623341 685 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
PTPRJQ12913 SNORA50D-202ENST00000627561 132 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
PTPRJQ12913 AP000769.1-203ENST00000637245 208 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
PTPRJQ12913 AC139713.2-207ENST00000641556 1292 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
PTPRJQ12913 RIPOR1-204ENST00000428437 4152 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PTPRJQ12913 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PTPRJQ12913 STK24-201ENST00000376547 2492 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PTPRJQ12913 TNFRSF8-201ENST00000263932 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PTPRJQ12913 EGR2-202ENST00000411732 2824 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PTPRJQ12913 TMED7-201ENST00000456936 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PTPRJQ12913 ADPRH-202ENST00000465513 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PTPRJQ12913 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 126.2 ms