Protein–RNA interactions for Protein: P48681

NES, Nestin, humanhuman

Predictions only

Length 1,621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NESP48681 AC099804.1-201ENST00000623105 714 ntBASIC22■■□□□ 1.11
NESP48681 PRSS2-204ENST00000632805 807 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NESP48681 AC137936.2-201ENST00000636329 620 ntBASIC22■■□□□ 1.11
NESP48681 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NESP48681 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NESP48681 TP53TG3B-201ENST00000341305 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NESP48681 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NESP48681 FAM86JP-201ENST00000467239 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NESP48681 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NESP48681 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NESP48681 PSMC4-201ENST00000157812 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NESP48681 THEMIS3P-201ENST00000416112 1586 ntBASIC22■■□□□ 1.11
NESP48681 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NESP48681 PRR3-202ENST00000376560 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NESP48681 ABI2-213ENST00000424558 2240 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NESP48681 TGM5-207ENST00000622115 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NESP48681 NAP1L2-201ENST00000373517 2550 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NESP48681 RPL36AL-201ENST00000298289 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NESP48681 IGKV3D-20-201ENST00000390270 445 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NESP48681 OR10D5P-201ENST00000392760 915 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
NESP48681 BANF1P4-201ENST00000420029 270 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
NESP48681 U62317.1-201ENST00000434237 157 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NESP48681 HUNK-AS1-201ENST00000437109 616 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NESP48681 IGKV3-20-201ENST00000492167 400 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NESP48681 PRDM2-214ENST00000505823 568 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NESP48681 ACP2-209ENST00000530453 826 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NESP48681 MIR4418-201ENST00000581169 62 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
NESP48681 AC008686.1-201ENST00000586894 565 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NESP48681 AC079779.3-227ENST00000591927 860 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NESP48681 BX255925.2-201ENST00000605600 515 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
NESP48681 BPIFA1-204ENST00000618484 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NESP48681 GOLGA8IP-201ENST00000340249 1899 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NESP48681 CACNA1C-AS1-201ENST00000501371 2191 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NESP48681 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NESP48681 GNB5-203ENST00000396335 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NESP48681 PAXIP1-AS2-203ENST00000449486 2121 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NESP48681 IP6K3-202ENST00000451316 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NESP48681 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NESP48681 SLC16A7-216ENST00000552432 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NESP48681 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NESP48681 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NESP48681 UBA3-201ENST00000349511 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NESP48681 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NESP48681 PPP1R32-202ENST00000366212 488 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NESP48681 JPT2-202ENST00000382710 962 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NESP48681 AL031663.2-201ENST00000417630 355 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NESP48681 AC009404.1-202ENST00000439955 968 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NESP48681 CHCHD3P3-201ENST00000446783 640 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
NESP48681 DANT1-202ENST00000451869 444 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NESP48681 RN7SL164P-201ENST00000482613 303 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
NESP48681 MESTP2-201ENST00000559787 889 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
NESP48681 AC109446.3-201ENST00000567344 641 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NESP48681 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NESP48681 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NESP48681 LINC02140-202ENST00000566649 2017 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NESP48681 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NESP48681 SLC5A11-211ENST00000569071 1919 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NESP48681 LINC01532-202ENST00000591143 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NESP48681 NICN1-208ENST00000615713 1921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NESP48681 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NESP48681 ARMCX6-201ENST00000361910 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NESP48681 TARS2-214ENST00000606933 2162 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NESP48681 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NESP48681 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NESP48681 CD1C-201ENST00000368170 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NESP48681 AC095350.1-201ENST00000443685 1711 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NESP48681 COQ10A-203ENST00000546544 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NESP48681 MIR22HG-208ENST00000574306 2626 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NESP48681 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NESP48681 PSORS1C2-201ENST00000259845 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NESP48681 PHKA1P1-201ENST00000420457 621 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
NESP48681 PRDX2P2-201ENST00000451920 587 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
NESP48681 AP001266.1-201ENST00000531155 1044 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NESP48681 ACTG1P16-201ENST00000564713 1082 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
NESP48681 PRSS1-207ENST00000619214 787 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NESP48681 HEXA-209ENST00000567159 1582 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NESP48681 SAMMSON-221ENST00000641715 1546 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
NESP48681 NT5DC4-201ENST00000327581 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NESP48681 CRISP2-203ENST00000618917 1492 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NESP48681 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NESP48681 CALCOCO1-218ENST00000550804 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NESP48681 SLC26A8-202ENST00000394602 3144 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NESP48681 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
NESP48681 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NESP48681 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NESP48681 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NESP48681 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NESP48681 BPIFB9P-201ENST00000246222 1178 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
NESP48681 COX17-201ENST00000261070 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NESP48681 OR4C46-201ENST00000328188 930 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NESP48681 GSTM4-202ENST00000336075 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NESP48681 KRT8P40-201ENST00000392131 563 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
NESP48681 AL117329.2-201ENST00000413815 740 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
NESP48681 MGC32805-201ENST00000503529 579 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NESP48681 AC008514.1-203ENST00000518172 574 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NESP48681 PAX5-209ENST00000520154 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NESP48681 MIR4688-201ENST00000577966 83 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
NESP48681 RN7SL1-201ENST00000618786 299 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
NESP48681 LINC00694-202ENST00000634610 769 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NESP48681 GSTM4-213ENST00000638994 657 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.3 ms