Protein–RNA interactions for Protein: P16410

CTLA4, Cytotoxic T-lymphocyte protein 4, humanhuman

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Length 223 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTLA4P16410 AC007998.2-201ENST00000589258 455 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
CTLA4P16410 GHRHR-212ENST00000611037 923 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
CTLA4P16410 HIST1H4I-201ENST00000615353 1294 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
CTLA4P16410 MDM1-201ENST00000303145 2918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
CTLA4P16410 PLOD2-201ENST00000282903 3732 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
CTLA4P16410 KDM5C-208ENST00000452825 6096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
CTLA4P16410 TTN-AS1-209ENST00000456053 2033 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
CTLA4P16410 TRAF3-208ENST00000560371 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
CTLA4P16410 AL357060.2-202ENST00000606998 1959 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
CTLA4P16410 VENTXP1-201ENST00000569334 2716 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
CTLA4P16410 RBMY1E-203ENST00000382659 1921 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
CTLA4P16410 RBMY1D-202ENST00000382680 1921 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
CTLA4P16410 RBMY1A1-203ENST00000382707 1921 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
CTLA4P16410 RBMY1B-202ENST00000383020 1921 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
CTLA4P16410 HPGD-204ENST00000504433 1910 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
CTLA4P16410 ZFYVE27-205ENST00000370613 2669 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
CTLA4P16410 PSG8-AS1-201ENST00000425668 1873 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
CTLA4P16410 DGKD-201ENST00000264057 6297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
CTLA4P16410 ARHGAP25-216ENST00000497079 1843 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
CTLA4P16410 TXNRD1-214ENST00000526691 3974 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
CTLA4P16410 GMPPB-203ENST00000480687 6108 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
CTLA4P16410 BIVM-202ENST00000448849 3198 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
CTLA4P16410 ACOX2-201ENST00000302819 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
CTLA4P16410 CTAGE10P-201ENST00000318353 2408 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
CTLA4P16410 ETNPPL-206ENST00000510706 1692 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
CTLA4P16410 LPO-201ENST00000262290 2979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
CTLA4P16410 FAM131B-204ENST00000409578 4286 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
CTLA4P16410 SRP54-201ENST00000216774 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
CTLA4P16410 BRAP-202ENST00000419234 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
CTLA4P16410 ART3-201ENST00000341029 1517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
CTLA4P16410 ANKDD1A-202ENST00000395720 1518 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
CTLA4P16410 SIRPA-204ENST00000622179 4570 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
CTLA4P16410 ERVK13-1-207ENST00000569465 3321 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
CTLA4P16410 NR3C1-204ENST00000394466 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
CTLA4P16410 LEPROTL1-201ENST00000321250 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
CTLA4P16410 CLCNKB-202ENST00000375679 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
CTLA4P16410 LTA-213ENST00000418386 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
CTLA4P16410 CERCAM-214ENST00000613052 1429 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
CTLA4P16410 AL805961.2-201ENST00000642139 4817 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
CTLA4P16410 CRY2-212ENST00000616623 4204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
CTLA4P16410 FAM168A-204ENST00000450446 1364 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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CTLA4P16410 ABLIM2-206ENST00000447017 2902 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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CTLA4P16410 ZNF667-201ENST00000292069 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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CTLA4P16410 KRT18P62-201ENST00000446618 1287 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
CTLA4P16410 ANKRD2-204ENST00000455090 1072 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
CTLA4P16410 DMKN-229ENST00000467637 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
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CTLA4P16410 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
CTLA4P16410 AC034231.1-201ENST00000507251 537 ntTSL 4 BASIC11.96□□□□□ -0.49
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CTLA4P16410 AC020934.2-201ENST00000592400 456 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
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CTLA4P16410 USP2-AS1-202ENST00000500970 1784 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
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CTLA4P16410 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
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CTLA4P16410 SH3PXD2B-201ENST00000311601 7777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
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CTLA4P16410 ANKRA2-201ENST00000296785 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
CTLA4P16410 DDX54-201ENST00000306014 4377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
CTLA4P16410 PICART1-201ENST00000499842 2533 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
CTLA4P16410 FBXO5-201ENST00000229758 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
CTLA4P16410 CFAP36-204ENST00000406691 1575 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
CTLA4P16410 GPHN-203ENST00000478722 4297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
CTLA4P16410 CACNA1G-233ENST00000515765 6981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
CTLA4P16410 ATP6V0D1-218ENST00000602876 1554 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
CTLA4P16410 SPCS3-201ENST00000503362 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
CTLA4P16410 NOX5-202ENST00000388866 2804 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
CTLA4P16410 DCST2-202ENST00000368424 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
CTLA4P16410 LAMB3-201ENST00000356082 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
CTLA4P16410 PRDM15-207ENST00000447207 4928 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
CTLA4P16410 GUCY2EP-203ENST00000531117 1918 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
CTLA4P16410 FGFRL1-202ENST00000398484 3639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
CTLA4P16410 FBRSL1-205ENST00000542061 3175 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
CTLA4P16410 IRAK3-201ENST00000261233 8663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CTLA4P16410 NAGK-202ENST00000418807 2343 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
CTLA4P16410 AC109460.1-201ENST00000567209 1478 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
CTLA4P16410 C1QTNF1-203ENST00000354124 2714 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.95□□□□□ -0.5
CTLA4P16410 BCL2L11-221ENST00000621302 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
CTLA4P16410 STRAP-202ENST00000419869 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CTLA4P16410 PRIMPOL-201ENST00000314970 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CTLA4P16410 TGM2-201ENST00000361475 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
CTLA4P16410 PCK2-208ENST00000559250 1804 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
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