Protein–RNA interactions for Protein: P0DP42

TMEM225B, Transmembrane protein 225B, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM225BP0DP42 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 DEFB123-201ENST00000376309 467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 C20orf141-201ENST00000380589 730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 MOCS1-207ENST00000432280 1071 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 PRKCZ-AS1-202ENST00000444529 622 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 CCDC18-AS1-219ENST00000451302 1212 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 AC011247.2-201ENST00000457097 233 ntTSL 4 BASIC11.69□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 AC008723.1-201ENST00000506922 207 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 NFATC2IP-206ENST00000568148 1157 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 MIR4265-201ENST00000582152 99 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 SLC12A5-216ENST00000626701 617 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 NEXN-201ENST00000330010 3195 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 DCAF11-204ENST00000446197 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 DRD3-201ENST00000295881 1541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 NR1H3-201ENST00000395397 1501 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 VAPB-202ENST00000395802 1834 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 HSPA8-221ENST00000533540 1826 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 ZNF473-205ENST00000595661 4828 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 OR1I1-202ENST00000641398 5984 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 GOLGA8UP-201ENST00000527159 1755 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 DRD2-204ENST00000538967 1493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 WDR47-201ENST00000357672 4144 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 AL390066.1-201ENST00000456414 2302 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 SLC5A4-201ENST00000266086 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 ZSCAN32-203ENST00000396852 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 AL022238.4-201ENST00000639722 4563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 ACER1-201ENST00000301452 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 MEIS2-215ENST00000559561 1442 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 SNAPC2-206ENST00000597584 1413 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 CDC42-202ENST00000344548 2256 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 SLC6A6-210ENST00000622186 6528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 C17orf53-203ENST00000585683 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 GPR39-201ENST00000329321 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 PPM1K-201ENST00000295908 1940 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 FAM86JP-201ENST00000467239 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 SLCO2A1-208ENST00000493729 1918 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 CDK5RAP1-203ENST00000357886 2164 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 C1GALT1-205ENST00000436587 6235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 RIPK4-202ENST00000352483 4016 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 C1R-209ENST00000542285 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 HECW2-202ENST00000409111 6692 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 DNAJB12-202ENST00000394903 3198 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 STAT3-202ENST00000389272 2615 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 TPO-202ENST00000345913 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 EDRF1-201ENST00000337623 4387 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 ARHGAP30-201ENST00000368013 4394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 HNRNPA1-201ENST00000330752 1294 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 EEF1DP2-201ENST00000433698 843 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 NDUFC1-209ENST00000539002 1198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 ALG10B-203ENST00000551464 571 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 PHBP15-201ENST00000574228 665 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 AC095350.1-204ENST00000585405 616 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 TMEM205-210ENST00000588560 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 HPX-213ENST00000615166 826 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 AMHR2-204ENST00000550311 1787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 HOXA1-202ENST00000355633 2016 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 COX18-201ENST00000295890 6846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 C5orf56-206ENST00000612967 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 MYADM-201ENST00000336967 3047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 AC092117.1-201ENST00000621230 3250 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 MTHFR-202ENST00000376583 7044 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 IWS1-201ENST00000295321 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 DNAJB8-201ENST00000319153 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 VAMP4-201ENST00000236192 5159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 AMACR-201ENST00000335606 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 P2RY8-201ENST00000381297 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 USP5-201ENST00000229268 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 KCNV1-202ENST00000524391 6979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 DMBX1-201ENST00000360032 2880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 SNX12-202ENST00000374274 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 AGAP12P-202ENST00000603888 2141 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 ZFC3H1-201ENST00000378743 7285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 CYB561-202ENST00000392975 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 KCNH1-209ENST00000639952 8075 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 TRMT61A-202ENST00000389749 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 ZC3HAV1-201ENST00000242351 7100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 OR2B11-202ENST00000641149 6414 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TMEM225BP0DP42 ELP5-203ENST00000396627 1389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.1 ms