Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 BRD7P5-201ENST00000299197 1822 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
HMGB1P1B2RPK0 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HMGB1P1B2RPK0 PM20D1-201ENST00000367136 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HMGB1P1B2RPK0 FAM131B-202ENST00000409346 4295 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HMGB1P1B2RPK0 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HMGB1P1B2RPK0 ZMAT5-201ENST00000344318 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HMGB1P1B2RPK0 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HMGB1P1B2RPK0 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HMGB1P1B2RPK0 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HMGB1P1B2RPK0 FLJ37035-201ENST00000419400 446 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HMGB1P1B2RPK0 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HMGB1P1B2RPK0 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HMGB1P1B2RPK0 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HMGB1P1B2RPK0 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HMGB1P1B2RPK0 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HMGB1P1B2RPK0 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
HMGB1P1B2RPK0 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HMGB1P1B2RPK0 IFI27L1-212ENST00000557218 413 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HMGB1P1B2RPK0 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HMGB1P1B2RPK0 AC090971.1-201ENST00000559302 510 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HMGB1P1B2RPK0 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HMGB1P1B2RPK0 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HMGB1P1B2RPK0 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
HMGB1P1B2RPK0 BTBD9-201ENST00000314100 8486 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HMGB1P1B2RPK0 AC007598.3-201ENST00000623077 1678 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
HMGB1P1B2RPK0 RAB3IP-212ENST00000550536 9646 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HMGB1P1B2RPK0 UBP1-204ENST00000447368 3669 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HMGB1P1B2RPK0 AC008806.1-201ENST00000624962 2443 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
HMGB1P1B2RPK0 STK11IP-204ENST00000456909 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HMGB1P1B2RPK0 LIN28A-202ENST00000326279 4008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HMGB1P1B2RPK0 ARSD-202ENST00000381154 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HMGB1P1B2RPK0 ZKSCAN3-203ENST00000377255 4799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HMGB1P1B2RPK0 TSPEAR-203ENST00000613245 3524 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HMGB1P1B2RPK0 ENDOU-201ENST00000229003 2332 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HMGB1P1B2RPK0 DNAH10OS-201ENST00000514254 5040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HMGB1P1B2RPK0 ZNF606-201ENST00000341164 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HMGB1P1B2RPK0 CMC2-201ENST00000219400 10301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HMGB1P1B2RPK0 ATP11A-202ENST00000375645 8795 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
HMGB1P1B2RPK0 ZFP1-201ENST00000332307 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HMGB1P1B2RPK0 C2orf69-201ENST00000319974 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HMGB1P1B2RPK0 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
HMGB1P1B2RPK0 IP6K2-210ENST00000431721 2174 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HMGB1P1B2RPK0 LIPA-205ENST00000456827 2527 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HMGB1P1B2RPK0 CD38-201ENST00000226279 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HMGB1P1B2RPK0 RFX5-202ENST00000368870 2459 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HMGB1P1B2RPK0 ZNF630-206ENST00000442455 2829 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HMGB1P1B2RPK0 CACNA2D2-206ENST00000479441 3453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HMGB1P1B2RPK0 CDC6-201ENST00000209728 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HMGB1P1B2RPK0 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HMGB1P1B2RPK0 DDX11L2-201ENST00000437401 1398 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
HMGB1P1B2RPK0 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HMGB1P1B2RPK0 C10orf90-201ENST00000284694 3076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HMGB1P1B2RPK0 C10orf105-201ENST00000398786 4730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HMGB1P1B2RPK0 ZNF606-204ENST00000547828 2680 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HMGB1P1B2RPK0 PGGHG-203ENST00000409548 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HMGB1P1B2RPK0 FBLN1-203ENST00000340923 2348 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HMGB1P1B2RPK0 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HMGB1P1B2RPK0 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HMGB1P1B2RPK0 JAM3-201ENST00000299106 3912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HMGB1P1B2RPK0 GREB1-201ENST00000234142 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HMGB1P1B2RPK0 RGS6-203ENST00000402788 5400 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HMGB1P1B2RPK0 BCL2L11-202ENST00000337565 720 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HMGB1P1B2RPK0 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HMGB1P1B2RPK0 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HMGB1P1B2RPK0 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
HMGB1P1B2RPK0 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HMGB1P1B2RPK0 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HMGB1P1B2RPK0 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HMGB1P1B2RPK0 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HMGB1P1B2RPK0 CD81-209ENST00000492627 886 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HMGB1P1B2RPK0 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HMGB1P1B2RPK0 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HMGB1P1B2RPK0 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HMGB1P1B2RPK0 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
HMGB1P1B2RPK0 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HMGB1P1B2RPK0 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HMGB1P1B2RPK0 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
HMGB1P1B2RPK0 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
HMGB1P1B2RPK0 TRERF1-202ENST00000354325 4138 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HMGB1P1B2RPK0 WDR47-201ENST00000357672 4144 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HMGB1P1B2RPK0 SPTLC1-201ENST00000262554 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HMGB1P1B2RPK0 TBC1D26-201ENST00000437605 1868 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HMGB1P1B2RPK0 ALK-205ENST00000618119 4646 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HMGB1P1B2RPK0 GNB5-201ENST00000261837 8906 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HMGB1P1B2RPK0 RAB6A-202ENST00000336083 3085 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HMGB1P1B2RPK0 EPB41L2-205ENST00000445890 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HMGB1P1B2RPK0 AQP2-201ENST00000199280 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HMGB1P1B2RPK0 TBC1D3I-203ENST00000621034 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HMGB1P1B2RPK0 ZNF331-201ENST00000253144 5042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HMGB1P1B2RPK0 DYNC1I1-205ENST00000447467 2947 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HMGB1P1B2RPK0 PTPRN2-202ENST00000389416 4692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HMGB1P1B2RPK0 TP53TG3B-201ENST00000341305 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HMGB1P1B2RPK0 RNF150-206ENST00000515673 9805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HMGB1P1B2RPK0 POLR1B-201ENST00000263331 4558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
HMGB1P1B2RPK0 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
HMGB1P1B2RPK0 PER1-211ENST00000581082 4521 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HMGB1P1B2RPK0 TSPYL2-201ENST00000375442 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HMGB1P1B2RPK0 AP000229.1-201ENST00000608591 1979 ntTSL 4 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HMGB1P1B2RPK0 SLC4A1AP-206ENST00000618046 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HMGB1P1B2RPK0 TRAF3IP3-203ENST00000367025 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.1 ms