Protein–RNA interactions for Protein: Q14C86

GAPVD1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPVD1Q14C86 AC010182.1-201ENST00000548943 2434 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
GAPVD1Q14C86 UROC1-201ENST00000290868 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GAPVD1Q14C86 TACC1-209ENST00000520611 1550 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GAPVD1Q14C86 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GAPVD1Q14C86 SNCAIP-222ENST00000542191 2729 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GAPVD1Q14C86 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GAPVD1Q14C86 OR4C46-201ENST00000328188 930 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GAPVD1Q14C86 C1QTNF9B-201ENST00000382137 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GAPVD1Q14C86 AL121983.2-204ENST00000430592 448 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GAPVD1Q14C86 RPSAP19-201ENST00000431241 880 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
GAPVD1Q14C86 WISP1-204ENST00000517423 716 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GAPVD1Q14C86 AC022733.2-201ENST00000520487 531 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GAPVD1Q14C86 CLNS1A-202ENST00000525064 1121 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GAPVD1Q14C86 RAD52-212ENST00000541619 560 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GAPVD1Q14C86 AC069234.1-201ENST00000542620 583 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GAPVD1Q14C86 TSHZ3-202ENST00000558569 441 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GAPVD1Q14C86 AC092368.1-201ENST00000568014 733 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
GAPVD1Q14C86 SH3GL1P2-201ENST00000582245 1082 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
GAPVD1Q14C86 SRGAP3-AS2-203ENST00000600323 1294 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GAPVD1Q14C86 GPM6B-203ENST00000356942 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GAPVD1Q14C86 FBXO39-201ENST00000321535 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GAPVD1Q14C86 CXorf40B-203ENST00000370406 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GAPVD1Q14C86 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GAPVD1Q14C86 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GAPVD1Q14C86 AP000229.1-201ENST00000608591 1979 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GAPVD1Q14C86 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GAPVD1Q14C86 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GAPVD1Q14C86 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GAPVD1Q14C86 GMPS-201ENST00000295920 2024 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GAPVD1Q14C86 STX3-207ENST00000633708 3111 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GAPVD1Q14C86 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GAPVD1Q14C86 GALM-202ENST00000410063 1023 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GAPVD1Q14C86 IGKV2-28-201ENST00000482769 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GAPVD1Q14C86 AC008040.3-201ENST00000493762 1232 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
GAPVD1Q14C86 ZBED3-AS1-206ENST00000508401 582 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GAPVD1Q14C86 AP001360.1-203ENST00000524708 464 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GAPVD1Q14C86 TRIAP1-202ENST00000546954 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GAPVD1Q14C86 TROAP-209ENST00000549275 348 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GAPVD1Q14C86 TROAP-210ENST00000549534 839 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GAPVD1Q14C86 AL118557.1-201ENST00000554408 440 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
GAPVD1Q14C86 AC017100.1-201ENST00000565978 1169 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
GAPVD1Q14C86 MIR4688-201ENST00000577966 83 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
GAPVD1Q14C86 ZNF223-202ENST00000585552 541 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GAPVD1Q14C86 AC123595.2-201ENST00000607854 549 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GAPVD1Q14C86 LINC01206-212ENST00000609168 988 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GAPVD1Q14C86 FURIN-208ENST00000640725 224 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GAPVD1Q14C86 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
GAPVD1Q14C86 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GAPVD1Q14C86 LILRB1-202ENST00000396315 2157 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GAPVD1Q14C86 AC023794.5-201ENST00000564380 2157 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
GAPVD1Q14C86 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GAPVD1Q14C86 NR1I2-207ENST00000640105 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GAPVD1Q14C86 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GAPVD1Q14C86 AC105219.4-201ENST00000529743 1809 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GAPVD1Q14C86 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GAPVD1Q14C86 MEG8-220ENST00000636052 1369 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GAPVD1Q14C86 SLC25A17-217ENST00000544408 2060 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GAPVD1Q14C86 NEK4-202ENST00000383721 2576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GAPVD1Q14C86 BCO2-202ENST00000361053 1868 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GAPVD1Q14C86 AC020928.1-201ENST00000590750 1850 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GAPVD1Q14C86 CATSPERE-203ENST00000366534 3333 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GAPVD1Q14C86 SOX30-203ENST00000519442 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GAPVD1Q14C86 CICP9-201ENST00000444451 1913 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
GAPVD1Q14C86 PCDHB19P-202ENST00000625133 2914 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
GAPVD1Q14C86 MED6-201ENST00000256379 1995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GAPVD1Q14C86 EFHC2-202ENST00000420999 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GAPVD1Q14C86 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GAPVD1Q14C86 YAE1D1-201ENST00000223273 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GAPVD1Q14C86 OR6N1-201ENST00000335094 1027 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GAPVD1Q14C86 HLA-U-204ENST00000418981 186 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
GAPVD1Q14C86 AL731577.1-201ENST00000449984 830 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GAPVD1Q14C86 GOLGA2-210ENST00000490628 428 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GAPVD1Q14C86 AC109830.1-203ENST00000506638 467 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GAPVD1Q14C86 HOPX-209ENST00000508121 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GAPVD1Q14C86 AC007992.1-201ENST00000513953 953 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
GAPVD1Q14C86 KRT16P1-202ENST00000577750 679 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GAPVD1Q14C86 OPN1MW-201ENST00000595290 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GAPVD1Q14C86 KXD1-210ENST00000599000 498 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GAPVD1Q14C86 AC245884.8-201ENST00000599382 880 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
GAPVD1Q14C86 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GAPVD1Q14C86 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GAPVD1Q14C86 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GAPVD1Q14C86 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GAPVD1Q14C86 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GAPVD1Q14C86 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GAPVD1Q14C86 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GAPVD1Q14C86 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
GAPVD1Q14C86 SEC13-203ENST00000383801 1479 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GAPVD1Q14C86 HEBP1-203ENST00000536942 2056 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GAPVD1Q14C86 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GAPVD1Q14C86 MPPE1-204ENST00000344987 1831 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GAPVD1Q14C86 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GAPVD1Q14C86 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GAPVD1Q14C86 CCDC70-201ENST00000242819 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GAPVD1Q14C86 TTLL1-202ENST00000331018 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GAPVD1Q14C86 LMO1-201ENST00000335790 1279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GAPVD1Q14C86 LYPD4-201ENST00000343055 1051 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GAPVD1Q14C86 HIST1H1C-201ENST00000343677 642 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GAPVD1Q14C86 PLP2-201ENST00000376322 620 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GAPVD1Q14C86 SUMF1-203ENST00000405420 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
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