Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
POLD1P28340 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
POLD1P28340 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
POLD1P28340 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
POLD1P28340 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
POLD1P28340 OPRM1-210ENST00000452687 1352 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
POLD1P28340 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
POLD1P28340 C6orf203-201ENST00000311381 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
POLD1P28340 CD300LB-201ENST00000314401 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
POLD1P28340 POLR1C-202ENST00000372344 1119 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
POLD1P28340 LINC00299-203ENST00000444688 537 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
POLD1P28340 TSACC-206ENST00000466306 477 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
POLD1P28340 AC025178.1-201ENST00000503441 834 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
POLD1P28340 AC097658.2-201ENST00000512715 624 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
POLD1P28340 AC090095.1-201ENST00000519275 871 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
POLD1P28340 CCDC42-202ENST00000539522 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
POLD1P28340 AC002347.2-201ENST00000584139 171 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
POLD1P28340 AP002414.5-201ENST00000591853 258 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
POLD1P28340 AC018695.2-201ENST00000602789 498 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
POLD1P28340 BAP1-211ENST00000615113 489 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
POLD1P28340 Metazoa_SRP.168-201ENST00000621608 264 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
POLD1P28340 LINC00969-321ENST00000629990 806 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
POLD1P28340 AC006581.2-201ENST00000631830 455 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
POLD1P28340 ATXN10-212ENST00000640901 1185 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
POLD1P28340 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
POLD1P28340 LINC01744-201ENST00000457698 2042 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
POLD1P28340 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
POLD1P28340 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
POLD1P28340 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
POLD1P28340 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
POLD1P28340 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
POLD1P28340 SERPINI1-202ENST00000446050 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
POLD1P28340 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
POLD1P28340 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
POLD1P28340 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
POLD1P28340 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
POLD1P28340 CATSPERE-202ENST00000366533 3019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
POLD1P28340 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
POLD1P28340 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
POLD1P28340 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
POLD1P28340 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
POLD1P28340 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
POLD1P28340 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
POLD1P28340 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
POLD1P28340 GOSR2-231ENST00000640007 1425 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
POLD1P28340 GALNT4-201ENST00000529983 5399 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
POLD1P28340 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
POLD1P28340 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
POLD1P28340 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
POLD1P28340 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
POLD1P28340 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
POLD1P28340 SRL-202ENST00000537996 1814 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
POLD1P28340 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
POLD1P28340 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
POLD1P28340 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
POLD1P28340 AKNA-203ENST00000312033 3334 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
POLD1P28340 OBP2A-203ENST00000371776 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
POLD1P28340 FAM126A-201ENST00000409763 616 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
POLD1P28340 AC007322.2-201ENST00000414540 605 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
POLD1P28340 LINC01508-201ENST00000425666 1013 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
POLD1P28340 LINC00700-202ENST00000438372 777 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
POLD1P28340 C2orf27AP2-201ENST00000438438 555 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
POLD1P28340 AC131097.4-201ENST00000442867 571 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
POLD1P28340 DMKN-244ENST00000480502 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
POLD1P28340 BBOX1-AS1-203ENST00000530430 879 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
POLD1P28340 BBOX1-AS1-204ENST00000531363 745 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
POLD1P28340 AC002351.1-201ENST00000546852 590 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
POLD1P28340 AC034102.3-201ENST00000551846 300 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
POLD1P28340 AL355075.5-201ENST00000553568 890 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
POLD1P28340 AC133539.1-201ENST00000562644 420 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
POLD1P28340 AC007608.2-201ENST00000569940 1146 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
POLD1P28340 AC012146.4-201ENST00000575546 271 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
POLD1P28340 AC010615.2-201ENST00000596705 566 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
POLD1P28340 FXYD3-212ENST00000605550 590 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
POLD1P28340 APOBEC3A-205ENST00000618553 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
POLD1P28340 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
POLD1P28340 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
POLD1P28340 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
POLD1P28340 ZNF669-204ENST00000448299 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
POLD1P28340 AS3MT-202ENST00000615257 1723 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
POLD1P28340 OR2A25-203ENST00000641663 1741 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
POLD1P28340 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
POLD1P28340 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
POLD1P28340 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
POLD1P28340 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
POLD1P28340 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
POLD1P28340 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
POLD1P28340 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
POLD1P28340 KLHDC2-211ENST00000557247 1565 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
POLD1P28340 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
POLD1P28340 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
POLD1P28340 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
POLD1P28340 CYP2B7P-201ENST00000541697 1476 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
POLD1P28340 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
POLD1P28340 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
POLD1P28340 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
POLD1P28340 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
POLD1P28340 PARVB-201ENST00000338758 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
POLD1P28340 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
POLD1P28340 LUC7L-203ENST00000397780 1335 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.4 ms