Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP64

ZCCHC17, Nucleolar protein of 40 kDa, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC17Q9NP64 AL121656.1-201ENST00000440786 482 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZCCHC17Q9NP64 LINC01502-203ENST00000447907 880 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZCCHC17Q9NP64 PSME2P2-201ENST00000453033 700 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ZCCHC17Q9NP64 PGAP2-207ENST00000463452 931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZCCHC17Q9NP64 AC022113.2-201ENST00000504935 704 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZCCHC17Q9NP64 CRYBB2P1-204ENST00000509460 701 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZCCHC17Q9NP64 AP000640.1-201ENST00000525337 879 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZCCHC17Q9NP64 MYL6-215ENST00000549566 685 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZCCHC17Q9NP64 AC142086.5-202ENST00000562500 217 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ZCCHC17Q9NP64 ABCC6P1-203ENST00000565566 1170 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ZCCHC17Q9NP64 RN7SL134P-201ENST00000579756 303 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ZCCHC17Q9NP64 LINC02081-201ENST00000586185 877 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZCCHC17Q9NP64 AC022098.2-201ENST00000590528 518 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZCCHC17Q9NP64 AP001462.1-201ENST00000594089 452 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ZCCHC17Q9NP64 CRABP2-204ENST00000621784 1033 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZCCHC17Q9NP64 SESN3-201ENST00000278499 1710 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZCCHC17Q9NP64 DDC-204ENST00000426377 1700 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZCCHC17Q9NP64 TAGLN-207ENST00000532870 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZCCHC17Q9NP64 GULP1-207ENST00000409843 2643 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZCCHC17Q9NP64 CCDC88C-201ENST00000331194 3104 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZCCHC17Q9NP64 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZCCHC17Q9NP64 RFESD-201ENST00000311364 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZCCHC17Q9NP64 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZCCHC17Q9NP64 SLC7A8-214ENST00000621729 1371 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZCCHC17Q9NP64 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZCCHC17Q9NP64 KRT8P38-201ENST00000441370 1430 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ZCCHC17Q9NP64 TRO-225ENST00000622017 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZCCHC17Q9NP64 AMIGO3-201ENST00000320431 2862 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZCCHC17Q9NP64 GATA2-201ENST00000341105 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZCCHC17Q9NP64 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZCCHC17Q9NP64 SLC52A1-203ENST00000512825 2989 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZCCHC17Q9NP64 TOR1AIP1-201ENST00000271583 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZCCHC17Q9NP64 ZFP64-203ENST00000361387 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZCCHC17Q9NP64 NR4A1-202ENST00000360284 2589 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ZCCHC17Q9NP64 TRIB1-201ENST00000311922 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ZCCHC17Q9NP64 LRSAM1-201ENST00000300417 3146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ZCCHC17Q9NP64 POLM-201ENST00000242248 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ZCCHC17Q9NP64 RAPGEFL1-202ENST00000456989 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ZCCHC17Q9NP64 MOGAT3-201ENST00000223114 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ZCCHC17Q9NP64 BAK1-202ENST00000374467 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ZCCHC17Q9NP64 MSH5-202ENST00000375740 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ZCCHC17Q9NP64 DNAJB6-204ENST00000429029 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ZCCHC17Q9NP64 AC023794.5-201ENST00000564380 2157 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
ZCCHC17Q9NP64 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ZCCHC17Q9NP64 HORMAD1-202ENST00000361824 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ZCCHC17Q9NP64 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ZCCHC17Q9NP64 GRAMD4-202ENST00000406902 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ZCCHC17Q9NP64 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ZCCHC17Q9NP64 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZCCHC17Q9NP64 TMEM25-201ENST00000313236 2409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZCCHC17Q9NP64 AAR2-201ENST00000320849 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZCCHC17Q9NP64 PROKR1-201ENST00000303786 4273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZCCHC17Q9NP64 GFI1B-207ENST00000636137 1870 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZCCHC17Q9NP64 PMM1-201ENST00000216259 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZCCHC17Q9NP64 FAU-201ENST00000279259 461 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZCCHC17Q9NP64 AC007391.1-201ENST00000433893 504 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZCCHC17Q9NP64 PLA2G15-203ENST00000444212 943 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZCCHC17Q9NP64 AL390961.2-201ENST00000454991 472 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZCCHC17Q9NP64 WWC2-208ENST00000508747 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZCCHC17Q9NP64 CDK7-211ENST00000514676 1164 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZCCHC17Q9NP64 C12orf73-204ENST00000546819 582 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZCCHC17Q9NP64 AC133555.4-201ENST00000569081 152 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ZCCHC17Q9NP64 AL080250.1-203ENST00000607799 747 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZCCHC17Q9NP64 AC123912.6-201ENST00000612657 315 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ZCCHC17Q9NP64 AC106782.5-201ENST00000616011 337 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ZCCHC17Q9NP64 LINC00969-253ENST00000625338 804 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZCCHC17Q9NP64 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZCCHC17Q9NP64 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZCCHC17Q9NP64 BPIFB6-201ENST00000349552 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZCCHC17Q9NP64 SULT1A1-203ENST00000395607 1386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZCCHC17Q9NP64 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZCCHC17Q9NP64 ECI2-202ENST00000380118 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZCCHC17Q9NP64 ZNF100-201ENST00000305570 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZCCHC17Q9NP64 NRADDP-202ENST00000641269 1585 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ZCCHC17Q9NP64 SCML4-203ENST00000369022 2377 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZCCHC17Q9NP64 PCDHB18P-202ENST00000526308 3197 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ZCCHC17Q9NP64 PARP1-203ENST00000366794 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZCCHC17Q9NP64 SLC4A7-211ENST00000445684 4061 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZCCHC17Q9NP64 AL121827.1-201ENST00000370257 3264 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZCCHC17Q9NP64 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZCCHC17Q9NP64 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZCCHC17Q9NP64 METAP1D-201ENST00000315796 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZCCHC17Q9NP64 IGHG4-202ENST00000641978 2597 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZCCHC17Q9NP64 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZCCHC17Q9NP64 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZCCHC17Q9NP64 C5orf56-206ENST00000612967 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZCCHC17Q9NP64 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZCCHC17Q9NP64 LINC01833-203ENST00000437916 2880 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZCCHC17Q9NP64 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZCCHC17Q9NP64 FCRL6-201ENST00000321935 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZCCHC17Q9NP64 ABLIM2-215ENST00000545242 1972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZCCHC17Q9NP64 AC005865.2-203ENST00000636557 2959 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZCCHC17Q9NP64 RMDN1-201ENST00000406452 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZCCHC17Q9NP64 AC008429.1-202ENST00000518818 2067 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZCCHC17Q9NP64 KLHL13-204ENST00000371882 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZCCHC17Q9NP64 BEND7-201ENST00000341083 2239 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZCCHC17Q9NP64 RNF121-211ENST00000530137 2202 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZCCHC17Q9NP64 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZCCHC17Q9NP64 KCTD7-201ENST00000275532 4795 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZCCHC17Q9NP64 LDHAL6A-201ENST00000280706 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms