Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSH3

NICN1, Nicolin-1, humanhuman

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NICN1Q9BSH3 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
NICN1Q9BSH3 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
NICN1Q9BSH3 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
NICN1Q9BSH3 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
NICN1Q9BSH3 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
NICN1Q9BSH3 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
NICN1Q9BSH3 FAM153C-201ENST00000398106 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
NICN1Q9BSH3 PRR3-202ENST00000376560 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NICN1Q9BSH3 FBLN1-208ENST00000442170 2531 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NICN1Q9BSH3 NLRP7-202ENST00000340844 3250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NICN1Q9BSH3 PDE1B-203ENST00000538346 1711 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
NICN1Q9BSH3 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
NICN1Q9BSH3 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
NICN1Q9BSH3 NDUFAF7-201ENST00000002125 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NICN1Q9BSH3 TSC22D1-203ENST00000458659 4820 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NICN1Q9BSH3 RBMY1E-203ENST00000382659 1921 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NICN1Q9BSH3 RBMY1D-202ENST00000382680 1921 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NICN1Q9BSH3 RBMY1A1-203ENST00000382707 1921 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NICN1Q9BSH3 RBMY1B-202ENST00000383020 1921 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NICN1Q9BSH3 DDC-212ENST00000615193 1674 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
NICN1Q9BSH3 RALGDS-203ENST00000372062 3596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
NICN1Q9BSH3 DCAF16-201ENST00000382247 4548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
NICN1Q9BSH3 CEP78-205ENST00000424347 11198 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
NICN1Q9BSH3 ALDOA-202ENST00000395240 1447 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
NICN1Q9BSH3 HARS-207ENST00000504156 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NICN1Q9BSH3 CCDC149-208ENST00000635206 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
NICN1Q9BSH3 TROVE2-206ENST00000400968 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NICN1Q9BSH3 HNRNPH1-216ENST00000510411 2105 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
NICN1Q9BSH3 TRIM80P-201ENST00000455685 2848 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
NICN1Q9BSH3 DSG1-202ENST00000462981 1857 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
NICN1Q9BSH3 PEX5-201ENST00000266563 3252 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NICN1Q9BSH3 PLB1-205ENST00000422425 5115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NICN1Q9BSH3 LAIR1-209ENST00000434277 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
NICN1Q9BSH3 MTUS2-206ENST00000612955 7430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
NICN1Q9BSH3 SLC4A2-201ENST00000392826 3947 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
NICN1Q9BSH3 AC009093.1-201ENST00000566070 2099 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NICN1Q9BSH3 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
NICN1Q9BSH3 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
NICN1Q9BSH3 STX16-NPEPL1-202ENST00000530122 3433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
NICN1Q9BSH3 NBPF1-203ENST00000430580 5932 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
NICN1Q9BSH3 GRHL2-201ENST00000251808 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NICN1Q9BSH3 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NICN1Q9BSH3 RAB8B-201ENST00000321437 4943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NICN1Q9BSH3 AC134772.2-202ENST00000634384 3585 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
NICN1Q9BSH3 TRNAU1AP-201ENST00000373830 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NICN1Q9BSH3 GRIK5-202ENST00000301218 3310 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NICN1Q9BSH3 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NICN1Q9BSH3 CCDC163-203ENST00000626657 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NICN1Q9BSH3 PES1P2-201ENST00000449745 1735 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
NICN1Q9BSH3 ENTPD3-204ENST00000456402 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NICN1Q9BSH3 GNPNAT1-201ENST00000216410 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NICN1Q9BSH3 ARHGAP33-203ENST00000314737 3858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
NICN1Q9BSH3 ZNF287-202ENST00000395825 3208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NICN1Q9BSH3 MAP3K9-205ENST00000554752 11169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NICN1Q9BSH3 WDR66-202ENST00000397454 3420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NICN1Q9BSH3 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NICN1Q9BSH3 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NICN1Q9BSH3 ITGB2-201ENST00000302347 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NICN1Q9BSH3 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NICN1Q9BSH3 FAM163B-201ENST00000356873 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NICN1Q9BSH3 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
NICN1Q9BSH3 LINC02015-202ENST00000436078 2957 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
NICN1Q9BSH3 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
NICN1Q9BSH3 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NICN1Q9BSH3 C3orf35-206ENST00000452017 513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
NICN1Q9BSH3 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
NICN1Q9BSH3 PDCD2-205ENST00000537445 1114 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
NICN1Q9BSH3 DNM1P51-201ENST00000558149 522 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
NICN1Q9BSH3 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
NICN1Q9BSH3 CHD3-203ENST00000380358 7356 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
NICN1Q9BSH3 CELF2-216ENST00000637215 2724 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
NICN1Q9BSH3 CACNA1F-203ENST00000376265 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NICN1Q9BSH3 JDP2-203ENST00000435893 5401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NICN1Q9BSH3 RBM10-202ENST00000345781 3108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
NICN1Q9BSH3 API5-208ENST00000531273 1868 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
NICN1Q9BSH3 AL450468.2-201ENST00000565955 1889 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
NICN1Q9BSH3 NRXN1-233ENST00000630543 4500 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
NICN1Q9BSH3 MYRF-201ENST00000265460 5745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NICN1Q9BSH3 VWA5B2-201ENST00000273794 3486 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
NICN1Q9BSH3 STARD13-202ENST00000336934 5917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NICN1Q9BSH3 REST-208ENST00000619101 7114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NICN1Q9BSH3 VIPAS39-208ENST00000556412 1832 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
NICN1Q9BSH3 HDAC8-207ENST00000373573 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NICN1Q9BSH3 AC068580.3-201ENST00000449248 2015 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NICN1Q9BSH3 IP6K3-201ENST00000293756 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NICN1Q9BSH3 SCP2-203ENST00000371514 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NICN1Q9BSH3 MEF2D-204ENST00000464356 5598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
NICN1Q9BSH3 MYRIP-203ENST00000425621 2981 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
NICN1Q9BSH3 CNTROB-203ENST00000565740 2783 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
NICN1Q9BSH3 ITFG2-201ENST00000228799 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NICN1Q9BSH3 RNF111-201ENST00000348370 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NICN1Q9BSH3 HNF1A-208ENST00000541395 3332 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
NICN1Q9BSH3 YTHDF3-201ENST00000517371 3122 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
NICN1Q9BSH3 DDX12P-201ENST00000432996 2947 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
NICN1Q9BSH3 ACO2-201ENST00000216254 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
NICN1Q9BSH3 TRPV1-201ENST00000310522 2340 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
NICN1Q9BSH3 APLP2-202ENST00000278756 3687 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
NICN1Q9BSH3 MBP-208ENST00000397866 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
NICN1Q9BSH3 LINC01624-203ENST00000607074 3265 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
NICN1Q9BSH3 SPINT1-201ENST00000344051 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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