Protein–RNA interactions for Protein: P38435

GGCX, Vitamin K-dependent gamma-carboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 758 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGCXP38435 TMEM25-208ENST00000524725 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
GGCXP38435 PSMG2-201ENST00000317615 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
GGCXP38435 SKP2-209ENST00000620197 3255 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
GGCXP38435 TNFSF13-203ENST00000380535 2195 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
GGCXP38435 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
GGCXP38435 CCDC3-202ENST00000378839 3180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
GGCXP38435 RGMA-203ENST00000542321 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
GGCXP38435 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
GGCXP38435 PES1-205ENST00000405677 2708 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
GGCXP38435 CHIT1-201ENST00000255427 1598 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
GGCXP38435 AL139158.3-201ENST00000641212 1562 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
GGCXP38435 WDR66-202ENST00000397454 3420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
GGCXP38435 CAB39L-204ENST00000409130 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
GGCXP38435 MPP4-203ENST00000396886 2250 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
GGCXP38435 CCL19-201ENST00000311925 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
GGCXP38435 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
GGCXP38435 SLC13A3-205ENST00000417157 876 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
GGCXP38435 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
GGCXP38435 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
GGCXP38435 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
GGCXP38435 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
GGCXP38435 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
GGCXP38435 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
GGCXP38435 LINC01154-201ENST00000548617 454 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
GGCXP38435 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
GGCXP38435 TMF1P1-201ENST00000576058 373 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
GGCXP38435 MIR4522-201ENST00000584932 87 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
GGCXP38435 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
GGCXP38435 PXK-210ENST00000479241 2817 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
GGCXP38435 DHX34-201ENST00000328771 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
GGCXP38435 OSBPL2-203ENST00000439951 3886 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
GGCXP38435 SIRPA-203ENST00000400068 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
GGCXP38435 ELN-204ENST00000357036 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
GGCXP38435 MOCS1-204ENST00000373188 3358 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
GGCXP38435 ERLIN1-202ENST00000407654 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
GGCXP38435 AC061965.1-201ENST00000560524 1465 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
GGCXP38435 TMOD1-202ENST00000375175 2516 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
GGCXP38435 FAM13B-203ENST00000425075 3098 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
GGCXP38435 FAM86C1-201ENST00000346333 2010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
GGCXP38435 ENKUR-202ENST00000376363 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
GGCXP38435 CNTROB-203ENST00000565740 2783 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
GGCXP38435 WDSUB1-201ENST00000358147 1535 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
GGCXP38435 NR1H3-201ENST00000395397 1501 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
GGCXP38435 PCGF2-203ENST00000616129 1534 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
GGCXP38435 TMUB2-201ENST00000319511 2418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
GGCXP38435 PSME3-217ENST00000622892 3183 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
GGCXP38435 RERG-201ENST00000256953 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
GGCXP38435 ELP2-221ENST00000542824 2288 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
GGCXP38435 UBE2V1-224ENST00000625172 2297 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
GGCXP38435 ELP5-203ENST00000396627 1389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GGCXP38435 NSD2-204ENST00000382891 7534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GGCXP38435 AC015712.2-201ENST00000560351 3688 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GGCXP38435 MEIKIN-205ENST00000616644 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GGCXP38435 KRT17P4-205ENST00000579946 2555 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GGCXP38435 CSF2RB-202ENST00000403662 4863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GGCXP38435 ARFIP1-203ENST00000405727 1601 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GGCXP38435 AC068580.3-201ENST00000449248 2015 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GGCXP38435 DDX5-210ENST00000578804 2021 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GGCXP38435 FLNC-201ENST00000325888 9188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GGCXP38435 ACTR3-201ENST00000263238 6718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GGCXP38435 ANAPC7-203ENST00000455511 3045 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GGCXP38435 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GGCXP38435 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GGCXP38435 FMR1NB-201ENST00000370467 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GGCXP38435 PBDC1-201ENST00000373357 977 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GGCXP38435 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GGCXP38435 PHACTR2-204ENST00000397980 745 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GGCXP38435 AL139339.1-201ENST00000411906 657 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GGCXP38435 DUTP3-201ENST00000450025 415 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
GGCXP38435 CCDC18-AS1-219ENST00000451302 1212 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GGCXP38435 AC011247.2-201ENST00000457097 233 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GGCXP38435 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GGCXP38435 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GGCXP38435 CHCHD2P2-201ENST00000503744 321 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
GGCXP38435 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GGCXP38435 CEP95-212ENST00000581056 903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GGCXP38435 AC005498.2-204ENST00000590613 413 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GGCXP38435 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GGCXP38435 EXOSC5-204ENST00000596905 826 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GGCXP38435 AC121493.1-201ENST00000602316 450 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
GGCXP38435 AC068631.1-255ENST00000608173 588 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GGCXP38435 LINC00969-294ENST00000627609 992 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GGCXP38435 KCNMA1-210ENST00000404771 4014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GGCXP38435 ATP6V0A1-206ENST00000585525 2679 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GGCXP38435 ANKHD1-203ENST00000360839 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GGCXP38435 ZBTB20-211ENST00000471418 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GGCXP38435 AC010096.1-201ENST00000443897 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GGCXP38435 HLA-DQB1-202ENST00000399079 1501 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
GGCXP38435 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GGCXP38435 TMEM30A-203ENST00000475111 2791 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GGCXP38435 ESPNL-202ENST00000409169 4441 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GGCXP38435 TMPRSS13-202ENST00000445164 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GGCXP38435 DYNC1I2-204ENST00000409317 2196 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GGCXP38435 EPN2-202ENST00000347697 4664 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GGCXP38435 AC020917.4-201ENST00000623994 1999 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
GGCXP38435 TRAPPC9-201ENST00000389328 4474 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GGCXP38435 CATSPERE-202ENST00000366533 3019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GGCXP38435 AC093797.1-201ENST00000411847 1789 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GGCXP38435 HERC3-203ENST00000407637 2634 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GGCXP38435 FCHO1-221ENST00000597512 2934 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.1 ms