Protein–RNA interactions for Protein: P21675

TAF1, Transcription initiation factor TFIID subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,872 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1P21675 CYP2F2P-201ENST00000437853 1056 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TAF1P21675 AC010997.1-201ENST00000447646 350 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TAF1P21675 HAX1-204ENST00000457918 914 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TAF1P21675 SCOC-209ENST00000512749 841 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TAF1P21675 AACSP1-202ENST00000521412 1095 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TAF1P21675 LAMTOR1-208ENST00000545249 965 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TAF1P21675 AC010319.4-201ENST00000593957 691 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TAF1P21675 LINC02140-202ENST00000566649 2017 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TAF1P21675 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TAF1P21675 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TAF1P21675 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TAF1P21675 PTPRH-202ENST00000376350 3877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TAF1P21675 AC100774.1-201ENST00000565581 1603 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TAF1P21675 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TAF1P21675 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TAF1P21675 FAM13B-203ENST00000425075 3098 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TAF1P21675 EGR2-201ENST00000242480 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TAF1P21675 DEGS1-202ENST00000391877 1345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TAF1P21675 AC099689.1-201ENST00000624383 1302 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TAF1P21675 EHMT2-202ENST00000375530 3856 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TAF1P21675 TMEM123-201ENST00000361236 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TAF1P21675 SOX30-203ENST00000519442 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TAF1P21675 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TAF1P21675 POTEB3-201ENST00000611217 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TAF1P21675 PPP1R11-205ENST00000376772 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TAF1P21675 GRIN1-206ENST00000371559 3577 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TAF1P21675 TPT1-201ENST00000309246 1008 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TAF1P21675 MKL1-204ENST00000402630 747 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TAF1P21675 CDCA4P3-201ENST00000442572 689 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TAF1P21675 CDK2AP2P2-201ENST00000478512 367 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TAF1P21675 ZNF268-208ENST00000539248 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TAF1P21675 ZNF268-212ENST00000542711 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TAF1P21675 NEMF-210ENST00000556672 590 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TAF1P21675 ZG16B-204ENST00000572863 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TAF1P21675 AC131274.3-201ENST00000578745 1271 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TAF1P21675 AL589743.3-201ENST00000604121 517 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TAF1P21675 AC097634.2-201ENST00000615819 604 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TAF1P21675 C20orf96-203ENST00000400269 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TAF1P21675 AL109615.2-201ENST00000455005 1608 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TAF1P21675 AL137077.2-201ENST00000635124 1608 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TAF1P21675 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TAF1P21675 AC073548.1-201ENST00000624088 1882 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TAF1P21675 LINC02465-203ENST00000513875 1777 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TAF1P21675 SCFD1-203ENST00000458591 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TAF1P21675 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TAF1P21675 LINC01873-201ENST00000428647 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TAF1P21675 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TAF1P21675 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TAF1P21675 EFEMP1-201ENST00000355426 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TAF1P21675 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TAF1P21675 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TAF1P21675 AP000229.1-201ENST00000608591 1979 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TAF1P21675 POTEC-201ENST00000358970 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TAF1P21675 IMPDH1P5-201ENST00000439688 1540 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TAF1P21675 AC004884.1-201ENST00000393647 319 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TAF1P21675 AL450322.2-201ENST00000421629 759 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TAF1P21675 AC004910.1-201ENST00000433493 787 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TAF1P21675 RPL7AP53-201ENST00000468834 793 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TAF1P21675 ALG10-202ENST00000538927 571 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TAF1P21675 NPTN-205ENST00000563691 1214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TAF1P21675 AC106774.4-201ENST00000600799 409 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TAF1P21675 AC127002.1-201ENST00000619123 455 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TAF1P21675 AC020763.2-201ENST00000623155 1255 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TAF1P21675 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TAF1P21675 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TAF1P21675 LINC01801-202ENST00000590963 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TAF1P21675 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TAF1P21675 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TAF1P21675 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TAF1P21675 OSER1-AS1-202ENST00000437730 1563 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TAF1P21675 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TAF1P21675 CYB561D1-206ENST00000496961 3424 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TAF1P21675 MCRIP1-207ENST00000574190 2775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TAF1P21675 XRRA1-207ENST00000527087 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TAF1P21675 CLPB-209ENST00000538039 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TAF1P21675 CEBPZOS-203ENST00000397226 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TAF1P21675 ZNF772-203ENST00000425074 1601 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TAF1P21675 DDC-206ENST00000431062 1620 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TAF1P21675 SPATA20-227ENST00000634597 2587 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TAF1P21675 CENPBD1-201ENST00000314994 2744 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TAF1P21675 TRAF3IP3-204ENST00000367026 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TAF1P21675 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TAF1P21675 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TAF1P21675 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TAF1P21675 PSMA1-201ENST00000396394 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TAF1P21675 NHP2-201ENST00000274606 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TAF1P21675 VSTM1-202ENST00000366170 654 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TAF1P21675 NAA10-205ENST00000393712 908 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TAF1P21675 AL137077.1-201ENST00000442115 528 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TAF1P21675 AC084262.1-201ENST00000567818 751 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TAF1P21675 AC093072.1-201ENST00000589196 602 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TAF1P21675 AC148476.1-201ENST00000622182 705 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TAF1P21675 SQSTM1-201ENST00000360718 2253 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TAF1P21675 TACC1-209ENST00000520611 1550 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TAF1P21675 GRIA4-210ENST00000527669 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TAF1P21675 NEK11-202ENST00000383366 2914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TAF1P21675 SLC45A2-201ENST00000296589 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TAF1P21675 ABCG8-201ENST00000272286 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TAF1P21675 LSM14A-201ENST00000433627 3424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TAF1P21675 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms