Protein–RNA interactions for Protein: A4UGR9

XIRP2, Xin actin-binding repeat-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 3,374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XIRP2A4UGR9 TMEM106A-204ENST00000588659 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
XIRP2A4UGR9 SF1-202ENST00000334944 3094 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
XIRP2A4UGR9 NUP98-204ENST00000397004 3923 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
XIRP2A4UGR9 CCRL2-202ENST00000399036 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
XIRP2A4UGR9 EHMT2-202ENST00000375530 3856 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
XIRP2A4UGR9 RGS6-202ENST00000355512 1564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
XIRP2A4UGR9 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
XIRP2A4UGR9 TEPP-201ENST00000290871 1079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
XIRP2A4UGR9 IGLV1-44-201ENST00000390297 467 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
XIRP2A4UGR9 TEPP-202ENST00000441824 998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
XIRP2A4UGR9 LINC02182-201ENST00000569362 498 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
XIRP2A4UGR9 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
XIRP2A4UGR9 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
XIRP2A4UGR9 NAMA-207ENST00000605707 1748 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
XIRP2A4UGR9 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
XIRP2A4UGR9 LAIR1-204ENST00000391743 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
XIRP2A4UGR9 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
XIRP2A4UGR9 MIR22HG-208ENST00000574306 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
XIRP2A4UGR9 ZSCAN32-203ENST00000396852 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
XIRP2A4UGR9 RASA4CP-203ENST00000446874 3193 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
XIRP2A4UGR9 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
XIRP2A4UGR9 AC109326.1-201ENST00000624705 1321 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
XIRP2A4UGR9 PMS1-204ENST00000409823 2795 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
XIRP2A4UGR9 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
XIRP2A4UGR9 ATG13-215ENST00000529655 2566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
XIRP2A4UGR9 APTX-206ENST00000379825 2023 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
XIRP2A4UGR9 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
XIRP2A4UGR9 KRT8P5-201ENST00000592443 1458 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
XIRP2A4UGR9 CNGA3-204ENST00000409937 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
XIRP2A4UGR9 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
XIRP2A4UGR9 RTFDC1-201ENST00000023939 1745 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
XIRP2A4UGR9 OR2A14-201ENST00000408899 1012 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
XIRP2A4UGR9 CHIA-207ENST00000451398 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
XIRP2A4UGR9 LINC01287-203ENST00000454441 1007 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
XIRP2A4UGR9 AC011444.2-201ENST00000587759 567 ntTSL 4 BASIC13.53□□□□□ -0.24
XIRP2A4UGR9 Metazoa_SRP.198-201ENST00000610617 323 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
XIRP2A4UGR9 UROD-221ENST00000636293 1102 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
XIRP2A4UGR9 KIF9-208ENST00000452770 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
XIRP2A4UGR9 PRPSAP1-206ENST00000446526 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
XIRP2A4UGR9 FAM214B-205ENST00000488109 2999 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
XIRP2A4UGR9 HRC-203ENST00000595625 2044 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
XIRP2A4UGR9 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
XIRP2A4UGR9 HEBP1-203ENST00000536942 2056 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
XIRP2A4UGR9 LINGO1-AS1-201ENST00000558691 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
XIRP2A4UGR9 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
XIRP2A4UGR9 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
XIRP2A4UGR9 DAGLB-201ENST00000297056 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
XIRP2A4UGR9 TRIM10-204ENST00000449742 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
XIRP2A4UGR9 CXorf40A-203ENST00000422892 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
XIRP2A4UGR9 SUCLG2P2-201ENST00000307241 1296 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
XIRP2A4UGR9 GMNN-202ENST00000356509 1133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
XIRP2A4UGR9 IGLV3-21-201ENST00000390308 602 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.24
XIRP2A4UGR9 PRKCE-202ENST00000394874 996 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.24
XIRP2A4UGR9 AL139412.1-201ENST00000441085 523 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
XIRP2A4UGR9 AC008676.2-201ENST00000519499 741 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.24
XIRP2A4UGR9 ODF3-203ENST00000525282 764 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
XIRP2A4UGR9 AC005086.1-201ENST00000566572 801 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
XIRP2A4UGR9 AC011306.1-201ENST00000606639 1275 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
XIRP2A4UGR9 INF2-209ENST00000617571 2956 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
XIRP2A4UGR9 HIST2H2BF-201ENST00000369167 1954 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.24
XIRP2A4UGR9 GHRL-201ENST00000287656 1313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
XIRP2A4UGR9 PECR-201ENST00000265322 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
XIRP2A4UGR9 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
XIRP2A4UGR9 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
XIRP2A4UGR9 ARHGEF26-202ENST00000465093 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
XIRP2A4UGR9 OTUD6B-AS1-202ENST00000524003 2171 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
XIRP2A4UGR9 SLC26A6-202ENST00000337000 2317 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
XIRP2A4UGR9 NDRG1-222ENST00000522476 1385 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
XIRP2A4UGR9 PTCHD3-201ENST00000438700 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
XIRP2A4UGR9 ZNF816-201ENST00000270457 582 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
XIRP2A4UGR9 SNAPC5-203ENST00000395589 749 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
XIRP2A4UGR9 IGKV1-8-201ENST00000495489 398 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
XIRP2A4UGR9 PRDM2-213ENST00000503842 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
XIRP2A4UGR9 AC142391.1-201ENST00000515823 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
XIRP2A4UGR9 AP001107.8-201ENST00000530805 479 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
XIRP2A4UGR9 SNAPC5-205ENST00000563480 920 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
XIRP2A4UGR9 MIR4296-201ENST00000581038 88 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
XIRP2A4UGR9 MIR4689-201ENST00000582517 70 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
XIRP2A4UGR9 AC012442.3-201ENST00000636053 940 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
XIRP2A4UGR9 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
XIRP2A4UGR9 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
XIRP2A4UGR9 CLUHP3-207ENST00000563678 1303 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
XIRP2A4UGR9 C17orf75-202ENST00000577809 1642 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
XIRP2A4UGR9 SLCO2A1-208ENST00000493729 1918 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
XIRP2A4UGR9 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
XIRP2A4UGR9 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
XIRP2A4UGR9 PPP1R11-204ENST00000376769 1689 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
XIRP2A4UGR9 IGLV3-22-201ENST00000390307 409 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
XIRP2A4UGR9 THUMPD1P1-201ENST00000400014 1041 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
XIRP2A4UGR9 C2orf70-202ENST00000409392 764 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
XIRP2A4UGR9 HNRNPA1P33-201ENST00000421426 561 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
XIRP2A4UGR9 Metazoa_SRP.82-201ENST00000611637 265 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
XIRP2A4UGR9 SPATA12-201ENST00000334325 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
XIRP2A4UGR9 CCDC175-201ENST00000281581 2487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
XIRP2A4UGR9 SFI1-208ENST00000432498 4162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
XIRP2A4UGR9 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
XIRP2A4UGR9 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
XIRP2A4UGR9 PPIG-208ENST00000462903 1516 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
XIRP2A4UGR9 C16orf46-202ENST00000378611 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
XIRP2A4UGR9 USF1-202ENST00000368020 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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