Protein–RNA interactions for Protein: P55822

SH3BGR, SH3 domain-binding glutamic acid-rich protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 239 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BGRP55822 MROH7-TTC4-201ENST00000414150 5867 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 FRMD6-203ENST00000395718 4828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 ATG13-211ENST00000528494 2351 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 PLEC-201ENST00000322810 15249 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 KDM7A-201ENST00000397560 9272 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 MCM3AP-201ENST00000291688 6193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 C9orf3-201ENST00000277198 1966 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 BISPR-204ENST00000634675 1806 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 LINC01588-203ENST00000529902 4279 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 AP001046.1-201ENST00000435702 2816 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 ACVRL1-206ENST00000550683 4121 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 COIL-201ENST00000240316 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
SH3BGRP55822 SLC44A4-203ENST00000375562 2505 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SH3BGRP55822 CLTCL1-212ENST00000622493 1714 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SH3BGRP55822 PIWIL1-201ENST00000245255 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SH3BGRP55822 NFATC4-209ENST00000553879 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SH3BGRP55822 FAM227B-212ENST00000561064 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SH3BGRP55822 AC134772.2-202ENST00000634384 3585 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SH3BGRP55822 SLC35B4-201ENST00000378509 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SH3BGRP55822 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SH3BGRP55822 ABLIM3-203ENST00000356541 2290 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SH3BGRP55822 ABLIM3-211ENST00000517451 2287 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SH3BGRP55822 HAO1-201ENST00000378789 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SH3BGRP55822 NSF-201ENST00000398238 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SH3BGRP55822 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SH3BGRP55822 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SH3BGRP55822 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SH3BGRP55822 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SH3BGRP55822 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SH3BGRP55822 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SH3BGRP55822 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SH3BGRP55822 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SH3BGRP55822 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SH3BGRP55822 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SH3BGRP55822 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SH3BGRP55822 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SH3BGRP55822 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SH3BGRP55822 MRPS10-201ENST00000053468 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SH3BGRP55822 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SH3BGRP55822 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SH3BGRP55822 TMBIM6-227ENST00000552699 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SH3BGRP55822 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SH3BGRP55822 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
SH3BGRP55822 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SH3BGRP55822 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
SH3BGRP55822 KCNMA1-227ENST00000638203 3840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SH3BGRP55822 DPP8-204ENST00000358939 2822 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SH3BGRP55822 PARG-207ENST00000616448 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SH3BGRP55822 HSP90AA1-202ENST00000334701 3510 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SH3BGRP55822 PISD-202ENST00000382151 2669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SH3BGRP55822 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SH3BGRP55822 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SH3BGRP55822 ARRDC3-AS1-201ENST00000625713 2500 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SH3BGRP55822 PCDHGA7-201ENST00000518325 4605 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SH3BGRP55822 PPP6R2-209ENST00000612753 4104 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SH3BGRP55822 CYYR1-201ENST00000299340 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SH3BGRP55822 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SH3BGRP55822 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SH3BGRP55822 MYBPC3-204ENST00000545968 4226 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SH3BGRP55822 GLUL-204ENST00000417584 4065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SH3BGRP55822 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SH3BGRP55822 ADAMTS10-211ENST00000597188 3749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SH3BGRP55822 SLC20A2-207ENST00000520179 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SH3BGRP55822 TBC1D22A-203ENST00000380995 3934 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SH3BGRP55822 ARF3-201ENST00000256682 4105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SH3BGRP55822 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SH3BGRP55822 ESR1-201ENST00000206249 6458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SH3BGRP55822 ARHGEF11-201ENST00000361409 5788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SH3BGRP55822 CTRC-201ENST00000375943 3147 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SH3BGRP55822 MYT1-203ENST00000536311 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SH3BGRP55822 LINC01106-201ENST00000436665 2244 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SH3BGRP55822 C1orf216-201ENST00000270815 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SH3BGRP55822 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SH3BGRP55822 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SH3BGRP55822 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SH3BGRP55822 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SH3BGRP55822 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SH3BGRP55822 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SH3BGRP55822 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SH3BGRP55822 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SH3BGRP55822 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SH3BGRP55822 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SH3BGRP55822 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SH3BGRP55822 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SH3BGRP55822 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SH3BGRP55822 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SH3BGRP55822 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
SH3BGRP55822 ASNA1-205ENST00000611688 1214 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SH3BGRP55822 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SH3BGRP55822 SPATA2-201ENST00000289431 4022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SH3BGRP55822 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SH3BGRP55822 RHD-209ENST00000568195 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SH3BGRP55822 ALG8-202ENST00000376156 1677 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SH3BGRP55822 PGD-201ENST00000270776 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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