Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 TMUB2-205ENST00000587172 1598 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
HMGB1P1B2RPK0 SV2A-202ENST00000369146 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
HMGB1P1B2RPK0 AC091948.1-201ENST00000501695 2033 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
HMGB1P1B2RPK0 AL031708.1-201ENST00000454337 5326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
HMGB1P1B2RPK0 DGKH-202ENST00000337343 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
HMGB1P1B2RPK0 ZNF106-205ENST00000565611 5081 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
HMGB1P1B2RPK0 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
HMGB1P1B2RPK0 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
HMGB1P1B2RPK0 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
HMGB1P1B2RPK0 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
HMGB1P1B2RPK0 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
HMGB1P1B2RPK0 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
HMGB1P1B2RPK0 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
HMGB1P1B2RPK0 SERF2-206ENST00000409291 807 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
HMGB1P1B2RPK0 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
HMGB1P1B2RPK0 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
HMGB1P1B2RPK0 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
HMGB1P1B2RPK0 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
HMGB1P1B2RPK0 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
HMGB1P1B2RPK0 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
HMGB1P1B2RPK0 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
HMGB1P1B2RPK0 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
HMGB1P1B2RPK0 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
HMGB1P1B2RPK0 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
HMGB1P1B2RPK0 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
HMGB1P1B2RPK0 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
HMGB1P1B2RPK0 AC115099.1-201ENST00000570413 362 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
HMGB1P1B2RPK0 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
HMGB1P1B2RPK0 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
HMGB1P1B2RPK0 ANKRD36B-201ENST00000258459 5986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
HMGB1P1B2RPK0 RPS27L-201ENST00000330964 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
HMGB1P1B2RPK0 KRT26-201ENST00000335552 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
HMGB1P1B2RPK0 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
HMGB1P1B2RPK0 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
HMGB1P1B2RPK0 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
HMGB1P1B2RPK0 DDX19B-208ENST00000563392 1760 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
HMGB1P1B2RPK0 ST3GAL5-204ENST00000393808 2236 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
HMGB1P1B2RPK0 FGFR1-211ENST00000425967 5375 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
HMGB1P1B2RPK0 TIAM1-201ENST00000286827 7200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
HMGB1P1B2RPK0 MIGA2-201ENST00000358369 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
HMGB1P1B2RPK0 MYO1D-202ENST00000394649 5451 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
HMGB1P1B2RPK0 ACIN1-222ENST00000557515 2751 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
HMGB1P1B2RPK0 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
HMGB1P1B2RPK0 EHD1-213ENST00000621096 3336 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
HMGB1P1B2RPK0 ELN-205ENST00000358929 3967 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
HMGB1P1B2RPK0 SNX10-201ENST00000338523 2546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
HMGB1P1B2RPK0 MYO1C-201ENST00000359786 5145 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
HMGB1P1B2RPK0 CSAD-201ENST00000267085 2645 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
HMGB1P1B2RPK0 ADSL-201ENST00000216194 1620 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
HMGB1P1B2RPK0 SRGAP3-202ENST00000383836 8656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
HMGB1P1B2RPK0 RIPK4-202ENST00000352483 4016 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
HMGB1P1B2RPK0 DNAL1-201ENST00000311089 2312 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
HMGB1P1B2RPK0 NUP62-208ENST00000596217 3590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
HMGB1P1B2RPK0 JDP2-203ENST00000435893 5401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
HMGB1P1B2RPK0 MYBPC3-204ENST00000545968 4226 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
HMGB1P1B2RPK0 PRAMENP-201ENST00000337471 3038 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
HMGB1P1B2RPK0 TSNAXIP1-201ENST00000388833 2429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
HMGB1P1B2RPK0 ADD1-207ENST00000446856 3745 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
HMGB1P1B2RPK0 SLITRK3-201ENST00000241274 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
HMGB1P1B2RPK0 TOP3B-202ENST00000398793 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
HMGB1P1B2RPK0 MT1H-201ENST00000332374 397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
HMGB1P1B2RPK0 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
HMGB1P1B2RPK0 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
HMGB1P1B2RPK0 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
HMGB1P1B2RPK0 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
HMGB1P1B2RPK0 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
HMGB1P1B2RPK0 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC13.79□□□□□ -0.2
HMGB1P1B2RPK0 AL137779.3-201ENST00000553295 729 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
HMGB1P1B2RPK0 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC13.79□□□□□ -0.2
HMGB1P1B2RPK0 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
HMGB1P1B2RPK0 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
HMGB1P1B2RPK0 AL356417.2-202ENST00000608986 532 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
HMGB1P1B2RPK0 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
HMGB1P1B2RPK0 AC011511.5-201ENST00000589379 3219 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
HMGB1P1B2RPK0 AC018645.3-201ENST00000628855 2646 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
HMGB1P1B2RPK0 KLHL38-201ENST00000325995 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
HMGB1P1B2RPK0 LEPROT-201ENST00000371065 4622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
HMGB1P1B2RPK0 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
HMGB1P1B2RPK0 LINC00642-201ENST00000419459 2026 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
HMGB1P1B2RPK0 AC099521.2-201ENST00000619354 2036 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
HMGB1P1B2RPK0 ADCY7-201ENST00000254235 6138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
HMGB1P1B2RPK0 PSMD5-201ENST00000210313 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
HMGB1P1B2RPK0 L2HGDH-201ENST00000261699 1377 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
HMGB1P1B2RPK0 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
HMGB1P1B2RPK0 SLC37A4-201ENST00000330775 2102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
HMGB1P1B2RPK0 DAPK1-201ENST00000358077 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
HMGB1P1B2RPK0 LRRN2-201ENST00000367175 5036 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
HMGB1P1B2RPK0 LOXL4-201ENST00000260702 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
HMGB1P1B2RPK0 ZNF148-206ENST00000485866 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
HMGB1P1B2RPK0 RBM4-205ENST00000409406 2321 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
HMGB1P1B2RPK0 LIG1-221ENST00000613670 3949 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
HMGB1P1B2RPK0 TXNRD1-214ENST00000526691 3974 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
HMGB1P1B2RPK0 ZNF654-204ENST00000636215 6446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
HMGB1P1B2RPK0 MYO18B-202ENST00000407587 8090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
HMGB1P1B2RPK0 PRKCE-201ENST00000306156 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
HMGB1P1B2RPK0 SLC8B1-213ENST00000552014 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
HMGB1P1B2RPK0 COPS7A-201ENST00000229251 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
HMGB1P1B2RPK0 AKAP8-201ENST00000269701 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
HMGB1P1B2RPK0 HECW1-201ENST00000395891 9501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
HMGB1P1B2RPK0 PAK1-215ENST00000530617 3001 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.4 ms