Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP64

ZCCHC17, Nucleolar protein of 40 kDa, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC17Q9NP64 AC093700.1-201ENST00000503348 717 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ZCCHC17Q9NP64 AC097381.2-201ENST00000510640 859 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZCCHC17Q9NP64 ISL1-203ENST00000511384 981 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZCCHC17Q9NP64 IGHVII-74-1-201ENST00000517572 241 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ZCCHC17Q9NP64 AC103736.1-201ENST00000524410 605 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZCCHC17Q9NP64 SLC25A3-206ENST00000547534 556 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZCCHC17Q9NP64 AC010202.1-201ENST00000551181 405 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ZCCHC17Q9NP64 LINC01490-202ENST00000551399 1260 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZCCHC17Q9NP64 ZNF175-204ENST00000596504 580 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZCCHC17Q9NP64 AC004466.2-201ENST00000614749 516 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ZCCHC17Q9NP64 AL353658.2-201ENST00000629794 519 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZCCHC17Q9NP64 FUT1-201ENST00000310160 4246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZCCHC17Q9NP64 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZCCHC17Q9NP64 AL121753.2-201ENST00000624581 1461 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ZCCHC17Q9NP64 NEK3-210ENST00000620675 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZCCHC17Q9NP64 ZNF23-203ENST00000393539 3242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZCCHC17Q9NP64 MIR497HG-202ENST00000572453 3838 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ZCCHC17Q9NP64 CLUL1-202ENST00000400606 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZCCHC17Q9NP64 CEP131-201ENST00000269392 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZCCHC17Q9NP64 PLD1-201ENST00000331659 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZCCHC17Q9NP64 AGAP5-201ENST00000374094 2394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZCCHC17Q9NP64 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZCCHC17Q9NP64 MST1-202ENST00000449682 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZCCHC17Q9NP64 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZCCHC17Q9NP64 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZCCHC17Q9NP64 TUBA1B-202ENST00000336023 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZCCHC17Q9NP64 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZCCHC17Q9NP64 SAP18-201ENST00000382533 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZCCHC17Q9NP64 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZCCHC17Q9NP64 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZCCHC17Q9NP64 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZCCHC17Q9NP64 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZCCHC17Q9NP64 KRT37-201ENST00000225550 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZCCHC17Q9NP64 CHRNA1-205ENST00000409542 1460 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZCCHC17Q9NP64 KRT8P25-201ENST00000473150 1456 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ZCCHC17Q9NP64 S100B-201ENST00000291700 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZCCHC17Q9NP64 HAX1-201ENST00000328703 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZCCHC17Q9NP64 UBIAD1-201ENST00000376804 825 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZCCHC17Q9NP64 MIR632-201ENST00000385193 94 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ZCCHC17Q9NP64 CPSF4L-202ENST00000397671 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZCCHC17Q9NP64 PPP1R7-205ENST00000404405 1009 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZCCHC17Q9NP64 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZCCHC17Q9NP64 SDCBP2P1-201ENST00000416115 614 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ZCCHC17Q9NP64 AL356000.1-201ENST00000441073 1238 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ZCCHC17Q9NP64 TONSL-AS1-201ENST00000442850 428 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZCCHC17Q9NP64 AC098820.2-201ENST00000457694 666 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZCCHC17Q9NP64 RNA5SP420-201ENST00000516997 137 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ZCCHC17Q9NP64 AP003040.1-201ENST00000532044 1024 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ZCCHC17Q9NP64 SLC13A2-205ENST00000545060 1276 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZCCHC17Q9NP64 RN7SL440P-201ENST00000577855 343 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ZCCHC17Q9NP64 KRT17P4-203ENST00000579355 621 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZCCHC17Q9NP64 AL353997.6-201ENST00000583394 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZCCHC17Q9NP64 AC091132.6-201ENST00000586411 826 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZCCHC17Q9NP64 KRTAP10-4-202ENST00000616689 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZCCHC17Q9NP64 LINC01726-201ENST00000624692 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZCCHC17Q9NP64 AL590094.1-208ENST00000636917 627 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZCCHC17Q9NP64 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZCCHC17Q9NP64 TMPRSS2-201ENST00000332149 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZCCHC17Q9NP64 GJB4-201ENST00000339480 2840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZCCHC17Q9NP64 KIF3A-201ENST00000378735 3266 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZCCHC17Q9NP64 CPNE2-204ENST00000565874 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZCCHC17Q9NP64 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZCCHC17Q9NP64 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZCCHC17Q9NP64 TIGD6-201ENST00000296736 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZCCHC17Q9NP64 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZCCHC17Q9NP64 CAMSAP3-201ENST00000160298 3889 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZCCHC17Q9NP64 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZCCHC17Q9NP64 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZCCHC17Q9NP64 IL18BP-201ENST00000260049 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZCCHC17Q9NP64 POLR1C-203ENST00000372389 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZCCHC17Q9NP64 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZCCHC17Q9NP64 TTK-201ENST00000230510 3477 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZCCHC17Q9NP64 ATG9B-203ENST00000469530 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZCCHC17Q9NP64 CILP2-201ENST00000291495 4199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZCCHC17Q9NP64 PDE2A-206ENST00000444035 4193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZCCHC17Q9NP64 SEC13-209ENST00000397117 1603 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZCCHC17Q9NP64 RGS8-204ENST00000483095 1432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZCCHC17Q9NP64 MKNK1-203ENST00000371945 2618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZCCHC17Q9NP64 ABCC6P1-201ENST00000546162 2943 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZCCHC17Q9NP64 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZCCHC17Q9NP64 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZCCHC17Q9NP64 OLFML3-203ENST00000393300 1961 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZCCHC17Q9NP64 ZNF570-202ENST00000586475 1985 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZCCHC17Q9NP64 AL117190.1-201ENST00000637474 1985 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZCCHC17Q9NP64 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZCCHC17Q9NP64 ZFYVE27-202ENST00000357540 2765 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZCCHC17Q9NP64 ZFYVE27-204ENST00000370610 2769 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZCCHC17Q9NP64 MINDY1-205ENST00000493834 1546 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZCCHC17Q9NP64 CSHL1-201ENST00000259003 739 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZCCHC17Q9NP64 RNF181-201ENST00000306368 569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZCCHC17Q9NP64 CCL25-202ENST00000315626 450 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZCCHC17Q9NP64 DPPA5-201ENST00000370370 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZCCHC17Q9NP64 SH3BGR-202ENST00000380631 780 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZCCHC17Q9NP64 TXNL4B-203ENST00000426362 965 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZCCHC17Q9NP64 FDPSP7-201ENST00000429043 1054 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ZCCHC17Q9NP64 RNF181-203ENST00000441634 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZCCHC17Q9NP64 CSHL1-206ENST00000450719 973 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZCCHC17Q9NP64 TPT1P6-201ENST00000458298 514 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ZCCHC17Q9NP64 AC004893.2-203ENST00000482799 796 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZCCHC17Q9NP64 TGFBI-207ENST00000508076 1034 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.9 ms