Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6D2

RNF182, E3 ubiquitin-protein ligase RNF182, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF182Q8N6D2 AC022400.8-201ENST00000623453 3599 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 ZNF667-201ENST00000292069 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 UBE2I-202ENST00000355803 3253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 ERBB2-202ENST00000406381 4564 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 PCDHGB1-201ENST00000523390 4590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 PCF11-201ENST00000298281 7677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 AL513327.1-206ENST00000587696 1432 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 UNK-205ENST00000589666 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 SLC37A4-202ENST00000357590 2356 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 ARRDC5-201ENST00000381781 1638 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 TBX4-202ENST00000393853 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 NFAT5-209ENST00000567239 6376 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 AGPAT3-202ENST00000327505 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 AGPAT3-204ENST00000398061 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 MALL-201ENST00000272462 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 AC009123.1-202ENST00000565643 2551 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 LINC00324-201ENST00000315707 2082 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 POTEB3-201ENST00000611217 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 KIR2DL3-201ENST00000342376 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 AC011287.1-201ENST00000639998 1349 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 PLOD2-201ENST00000282903 3732 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 GDA-203ENST00000376986 1771 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 TBC1D2-204ENST00000375066 3198 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 ADRA2B-201ENST00000620793 3371 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 TJAP1-204ENST00000372449 2695 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 PDE9A-202ENST00000328862 1956 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 MIR645-201ENST00000385283 94 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 TUBB2BP1-201ENST00000404155 871 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 BX276092.5-201ENST00000439926 886 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 UPK1A-AS1-201ENST00000443196 795 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 NAGK-204ENST00000443872 878 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 ESRRAP2-203ENST00000453309 822 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 MYL7-209ENST00000458240 791 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC10.4□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 TMEM223-202ENST00000525631 736 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 SERGEF-208ENST00000528200 1264 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 PMFBP1-208ENST00000537792 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC10.4□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 AC087741.1-205ENST00000572730 750 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 AC132825.4-202ENST00000578792 434 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 LINC00969-294ENST00000627609 992 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 C1orf232-202ENST00000635463 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 DPAGT1-217ENST00000639704 1719 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 NPNT-211ENST00000506666 2187 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 EBF2-203ENST00000520164 5145 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 LILRA2-203ENST00000391737 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 LINC00969-231ENST00000597482 1476 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 DLEC1-201ENST00000308059 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 FANCA-202ENST00000389301 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 RBM4-201ENST00000310092 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 PHF10-206ENST00000621772 1651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
RNF182Q8N6D2 HNF1B-204ENST00000617811 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
RNF182Q8N6D2 PTPRN2-203ENST00000389418 4706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
RNF182Q8N6D2 MOGAT2-201ENST00000198801 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
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RNF182Q8N6D2 PNMA5-205ENST00000535214 3198 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.75
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RNF182Q8N6D2 ETNPPL-202ENST00000411864 2028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
RNF182Q8N6D2 FAM120B-205ENST00000630384 3721 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.75
RNF182Q8N6D2 AGPAT1-203ENST00000375107 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
RNF182Q8N6D2 POLR1C-203ENST00000372389 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
RNF182Q8N6D2 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
RNF182Q8N6D2 CYTH1-215ENST00000591455 3286 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
RNF182Q8N6D2 FCRL1-207ENST00000491942 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
RNF182Q8N6D2 AL845472.1-202ENST00000624675 4080 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
RNF182Q8N6D2 GPN1-211ENST00000610189 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
RNF182Q8N6D2 LRRN2-201ENST00000367175 5036 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
RNF182Q8N6D2 LEPROTL1-201ENST00000321250 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
RNF182Q8N6D2 FBRSL1-205ENST00000542061 3175 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
RNF182Q8N6D2 KRT15-202ENST00000393974 3758 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
RNF182Q8N6D2 FAM153C-201ENST00000398106 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
RNF182Q8N6D2 ADARB1-214ENST00000629643 4583 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
RNF182Q8N6D2 DNMT3B-206ENST00000456297 2315 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
RNF182Q8N6D2 HCN3-201ENST00000368358 3718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
RNF182Q8N6D2 MKL1-210ENST00000614754 3917 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
RNF182Q8N6D2 AL031708.1-201ENST00000454337 5326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
RNF182Q8N6D2 BCAS4-202ENST00000371608 6680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
RNF182Q8N6D2 FAM237B-201ENST00000637645 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
RNF182Q8N6D2 PCID2-205ENST00000375477 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
RNF182Q8N6D2 DDC-212ENST00000615193 1674 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
RNF182Q8N6D2 GRIN1-205ENST00000371555 4003 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
RNF182Q8N6D2 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
RNF182Q8N6D2 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
RNF182Q8N6D2 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
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