Protein–RNA interactions for Protein: P53803

POLR2K, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 58 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2KP53803 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
POLR2KP53803 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC9.63□□□□□ -0.87
POLR2KP53803 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
POLR2KP53803 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
POLR2KP53803 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
POLR2KP53803 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
POLR2KP53803 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
POLR2KP53803 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
POLR2KP53803 CICP2-201ENST00000420675 2328 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
POLR2KP53803 DRD2-204ENST00000538967 1493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
POLR2KP53803 APOBR-201ENST00000431282 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
POLR2KP53803 TJAP1-201ENST00000259751 2720 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
POLR2KP53803 SLC26A6-203ENST00000358747 2729 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
POLR2KP53803 ANKRD36B-204ENST00000438709 6067 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
POLR2KP53803 DSG1-202ENST00000462981 1857 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
POLR2KP53803 SCN8A-202ENST00000355133 5820 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
POLR2KP53803 ATAT1-202ENST00000319027 2061 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
POLR2KP53803 ERN2-201ENST00000256797 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
POLR2KP53803 NECTIN2-201ENST00000252483 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
POLR2KP53803 HEY2-202ENST00000368365 2461 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
POLR2KP53803 PYGL-206ENST00000544180 2696 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
POLR2KP53803 BAIAP2-202ENST00000321300 2879 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
POLR2KP53803 BFAR-203ENST00000562442 1414 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
POLR2KP53803 ZCCHC17-201ENST00000344147 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
POLR2KP53803 DDC-206ENST00000431062 1620 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
POLR2KP53803 ZNF287-202ENST00000395825 3208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
POLR2KP53803 CLINT1-201ENST00000411809 3440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
POLR2KP53803 BAIAP2L1-201ENST00000005260 3622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
POLR2KP53803 KCND1-201ENST00000218176 4437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
POLR2KP53803 ZHX2-201ENST00000314393 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
POLR2KP53803 PARD6B-201ENST00000371610 4615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
POLR2KP53803 PLCB3-201ENST00000279230 4197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
POLR2KP53803 MCFD2-212ENST00000444761 4169 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
POLR2KP53803 ZBTB44-202ENST00000397753 3951 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
POLR2KP53803 SYNJ2-208ENST00000640338 3959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
POLR2KP53803 AC134772.2-202ENST00000634384 3585 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
POLR2KP53803 GRM4-209ENST00000609222 3176 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
POLR2KP53803 ALPL-203ENST00000374832 2193 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
POLR2KP53803 SHMT2-205ENST00000553474 1765 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
POLR2KP53803 EDNRB-204ENST00000626030 1571 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
POLR2KP53803 HERPUD1-202ENST00000344114 1388 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
POLR2KP53803 CCDC88A-204ENST00000413716 9586 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
POLR2KP53803 SLC13A2-201ENST00000314669 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
POLR2KP53803 UBR7-201ENST00000013070 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
POLR2KP53803 SHC1-210ENST00000448116 3481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
POLR2KP53803 SRC-204ENST00000373578 4630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
POLR2KP53803 LINC01134-202ENST00000439488 1940 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
POLR2KP53803 TMEM185A-210ENST00000613273 1913 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
POLR2KP53803 MSH5-204ENST00000375755 3094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
POLR2KP53803 NFIX-201ENST00000358552 1727 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
POLR2KP53803 SRGAP3-201ENST00000360413 8415 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
POLR2KP53803 ZNF275-201ENST00000370249 5920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
POLR2KP53803 CCDC60-201ENST00000327554 2450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
POLR2KP53803 BCL2L11-217ENST00000610735 5120 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
POLR2KP53803 TRIM56-201ENST00000306085 10952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
POLR2KP53803 MYT1-202ENST00000360149 2061 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
POLR2KP53803 DAND5-201ENST00000317060 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
POLR2KP53803 MAGEA11-202ENST00000355220 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
POLR2KP53803 C12orf74-201ENST00000397833 1856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
POLR2KP53803 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
POLR2KP53803 PERM1-202ENST00000433179 3340 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
POLR2KP53803 LILRA2-203ENST00000391737 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
POLR2KP53803 CELF4-217ENST00000591282 1461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
POLR2KP53803 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
POLR2KP53803 CCT8-201ENST00000286788 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
POLR2KP53803 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
POLR2KP53803 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
POLR2KP53803 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
POLR2KP53803 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC9.62□□□□□ -0.87
POLR2KP53803 MRPL36-201ENST00000382647 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.62□□□□□ -0.87
POLR2KP53803 IGHV1-3-201ENST00000390595 395 ntAPPRIS P1 BASIC9.62□□□□□ -0.87
POLR2KP53803 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
POLR2KP53803 LINC00265-2P-201ENST00000413372 782 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
POLR2KP53803 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC9.62□□□□□ -0.87
POLR2KP53803 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC9.62□□□□□ -0.87
POLR2KP53803 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
POLR2KP53803 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
POLR2KP53803 FRMD4A-204ENST00000475141 1233 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
POLR2KP53803 ALG1L13P-202ENST00000519320 584 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
POLR2KP53803 ENDOV-229ENST00000523999 864 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
POLR2KP53803 LINC01154-201ENST00000548617 454 ntTSL 3 BASIC9.62□□□□□ -0.87
POLR2KP53803 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
POLR2KP53803 TCL1A-205ENST00000555202 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
POLR2KP53803 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
POLR2KP53803 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
POLR2KP53803 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
POLR2KP53803 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
POLR2KP53803 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
POLR2KP53803 FILIP1L-203ENST00000383694 3280 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
POLR2KP53803 CNTNAP5-202ENST00000431078 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
POLR2KP53803 ADAMTSL4-202ENST00000369038 4167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
POLR2KP53803 TFIP11-201ENST00000405938 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
POLR2KP53803 NCBP2L-202ENST00000639756 1953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
POLR2KP53803 TCF12-201ENST00000267811 6061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
POLR2KP53803 SLC38A5-210ENST00000595796 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
POLR2KP53803 REST-208ENST00000619101 7114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
POLR2KP53803 SNX1-201ENST00000261889 3373 ntTSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
POLR2KP53803 CHAT-202ENST00000339797 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
POLR2KP53803 CHAT-204ENST00000395559 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
POLR2KP53803 MGAT4EP-201ENST00000330493 2810 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms