Protein–RNA interactions for Protein: P16410

CTLA4, Cytotoxic T-lymphocyte protein 4, humanhuman

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Length 223 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTLA4P16410 FAM30A-205ENST00000630242 9612 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
CTLA4P16410 FBLN1-208ENST00000442170 2531 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
CTLA4P16410 MAP2K4P1-202ENST00000602584 2539 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
CTLA4P16410 NDUFAF6-201ENST00000396111 1869 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
CTLA4P16410 AL450468.2-201ENST00000565955 1889 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
CTLA4P16410 XYLT2-201ENST00000017003 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
CTLA4P16410 DPH2-202ENST00000396758 1738 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
CTLA4P16410 LINC01922-202ENST00000567168 1704 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
CTLA4P16410 ADPRHL1-204ENST00000612156 9759 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
CTLA4P16410 SLC24A4-204ENST00000531433 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
CTLA4P16410 NOTCH1-201ENST00000277541 9371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
CTLA4P16410 OXR1-202ENST00000312046 4406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
CTLA4P16410 TMEM57-201ENST00000374343 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
CTLA4P16410 CSPG4P12-202ENST00000559989 7790 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
CTLA4P16410 ZNF771-204ENST00000566625 2415 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
CTLA4P16410 OR2V1-204ENST00000641551 2423 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
CTLA4P16410 CRYM-202ENST00000543948 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
CTLA4P16410 CASC4-202ENST00000345795 3764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
CTLA4P16410 SYDE1-201ENST00000342784 3264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
CTLA4P16410 MROH2A-208ENST00000610772 5324 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
CTLA4P16410 KCNMA1-216ENST00000457953 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
CTLA4P16410 LAIR2-201ENST00000301202 699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
CTLA4P16410 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
CTLA4P16410 MKX-201ENST00000375790 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
CTLA4P16410 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
CTLA4P16410 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
CTLA4P16410 PFN2-202ENST00000423691 911 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
CTLA4P16410 AL592076.1-201ENST00000424448 303 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
CTLA4P16410 AC013448.2-201ENST00000440341 787 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
CTLA4P16410 AL121845.1-201ENST00000447343 464 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
CTLA4P16410 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
CTLA4P16410 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC12.06□□□□□ -0.48
CTLA4P16410 FAM214B-205ENST00000488109 2999 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
CTLA4P16410 RAMP3-203ENST00000496212 543 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC12.06□□□□□ -0.48
CTLA4P16410 RN7SKP155-201ENST00000516031 288 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
CTLA4P16410 POLD4-206ENST00000530584 899 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
CTLA4P16410 POLD4-208ENST00000532830 904 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
CTLA4P16410 RTN4RL2-203ENST00000533205 637 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
CTLA4P16410 AL132994.1-201ENST00000554098 400 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
CTLA4P16410 NFATC2IP-206ENST00000568148 1157 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
CTLA4P16410 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
CTLA4P16410 MIR2392-201ENST00000584881 84 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
CTLA4P16410 DUSP22-213ENST00000605035 1231 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
CTLA4P16410 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
CTLA4P16410 CNOT7-213ENST00000628418 432 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
CTLA4P16410 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
CTLA4P16410 EPHB6-211ENST00000619012 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
CTLA4P16410 CCDC3-202ENST00000378839 3180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
CTLA4P16410 PNMA5-205ENST00000535214 3198 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
CTLA4P16410 C7orf57-202ENST00000420324 1957 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
CTLA4P16410 TRPV1-201ENST00000310522 2340 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
CTLA4P16410 SLC25A26-202ENST00000354883 2673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
CTLA4P16410 ACAP2-201ENST00000326793 7160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
CTLA4P16410 AL031587.5-201ENST00000624344 1849 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
CTLA4P16410 ZNF185-205ENST00000370270 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
CTLA4P16410 TTC4-201ENST00000371281 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
CTLA4P16410 OLAH-203ENST00000378228 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
CTLA4P16410 PTCD2-207ENST00000503868 1653 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
CTLA4P16410 SKA3-202ENST00000314759 2919 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
CTLA4P16410 CDCA7L-201ENST00000356195 2915 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
CTLA4P16410 WNK1-201ENST00000315939 10452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
CTLA4P16410 KCNIP2-203ENST00000348850 2089 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
CTLA4P16410 CDC45-205ENST00000437685 2072 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
CTLA4P16410 AL022323.5-201ENST00000624101 2059 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
CTLA4P16410 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CTLA4P16410 AC093668.2-201ENST00000481893 3569 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
CTLA4P16410 AC105052.1-201ENST00000519541 3569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
CTLA4P16410 GRIP2-204ENST00000619221 7977 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
CTLA4P16410 LINC02228-202ENST00000641261 2489 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
CTLA4P16410 RAPGEF1-202ENST00000372190 6045 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CTLA4P16410 PI4KA-201ENST00000255882 6752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CTLA4P16410 LAIR1-204ENST00000391743 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
CTLA4P16410 AL031432.4-201ENST00000641729 2190 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
CTLA4P16410 CX3CL1-204ENST00000565912 5796 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CTLA4P16410 TFR2-205ENST00000462107 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
CTLA4P16410 FAM167A-201ENST00000284486 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CTLA4P16410 TPM4-202ENST00000344824 1417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
CTLA4P16410 CHD1-212ENST00000614616 8095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
CTLA4P16410 CASP8-212ENST00000432109 1629 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
CTLA4P16410 USP5-201ENST00000229268 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CTLA4P16410 LINC01744-201ENST00000457698 2042 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
CTLA4P16410 C2-206ENST00000442278 2434 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
CTLA4P16410 SCAF4-201ENST00000286835 4193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CTLA4P16410 IKZF1-202ENST00000343574 5925 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
CTLA4P16410 ALX4-201ENST00000329255 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CTLA4P16410 MED11-201ENST00000293777 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CTLA4P16410 ZMAT5-201ENST00000344318 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CTLA4P16410 PSMB10-201ENST00000358514 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CTLA4P16410 Metazoa_SRP.4-201ENST00000366232 298 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
CTLA4P16410 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CTLA4P16410 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CTLA4P16410 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
CTLA4P16410 CDRT15L2-201ENST00000399044 1048 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
CTLA4P16410 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
CTLA4P16410 AC022113.2-201ENST00000504935 704 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
CTLA4P16410 MRPL22P1-201ENST00000505398 616 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
CTLA4P16410 AC093300.1-201ENST00000510368 1201 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
CTLA4P16410 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
CTLA4P16410 IGLV3-15-201ENST00000518356 244 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
CTLA4P16410 PIGCP1-201ENST00000527583 895 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
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