Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6D6

ARFGEF1, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,849 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGEF1Q9Y6D6 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ARFGEF1Q9Y6D6 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ARFGEF1Q9Y6D6 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ARFGEF1Q9Y6D6 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ARFGEF1Q9Y6D6 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ARFGEF1Q9Y6D6 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ARFGEF1Q9Y6D6 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ARFGEF1Q9Y6D6 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ARFGEF1Q9Y6D6 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ARFGEF1Q9Y6D6 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ARFGEF1Q9Y6D6 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ARFGEF1Q9Y6D6 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ARFGEF1Q9Y6D6 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ARFGEF1Q9Y6D6 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ARFGEF1Q9Y6D6 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ARFGEF1Q9Y6D6 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ARFGEF1Q9Y6D6 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ARFGEF1Q9Y6D6 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ARFGEF1Q9Y6D6 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ARFGEF1Q9Y6D6 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ARFGEF1Q9Y6D6 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ARFGEF1Q9Y6D6 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
ARFGEF1Q9Y6D6 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ARFGEF1Q9Y6D6 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ARFGEF1Q9Y6D6 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ARFGEF1Q9Y6D6 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ARFGEF1Q9Y6D6 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ARFGEF1Q9Y6D6 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ARFGEF1Q9Y6D6 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ARFGEF1Q9Y6D6 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ARFGEF1Q9Y6D6 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
ARFGEF1Q9Y6D6 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ARFGEF1Q9Y6D6 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ARFGEF1Q9Y6D6 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ARFGEF1Q9Y6D6 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
ARFGEF1Q9Y6D6 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ARFGEF1Q9Y6D6 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
ARFGEF1Q9Y6D6 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC27.57■■■□□ 2
ARFGEF1Q9Y6D6 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ARFGEF1Q9Y6D6 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
ARFGEF1Q9Y6D6 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
ARFGEF1Q9Y6D6 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
ARFGEF1Q9Y6D6 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ARFGEF1Q9Y6D6 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ARFGEF1Q9Y6D6 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ARFGEF1Q9Y6D6 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ARFGEF1Q9Y6D6 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
ARFGEF1Q9Y6D6 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC27.56■■■□□ 2
ARFGEF1Q9Y6D6 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ARFGEF1Q9Y6D6 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ARFGEF1Q9Y6D6 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ARFGEF1Q9Y6D6 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ARFGEF1Q9Y6D6 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ARFGEF1Q9Y6D6 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
ARFGEF1Q9Y6D6 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
ARFGEF1Q9Y6D6 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ARFGEF1Q9Y6D6 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
ARFGEF1Q9Y6D6 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
ARFGEF1Q9Y6D6 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
ARFGEF1Q9Y6D6 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
ARFGEF1Q9Y6D6 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ARFGEF1Q9Y6D6 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ARFGEF1Q9Y6D6 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ARFGEF1Q9Y6D6 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
ARFGEF1Q9Y6D6 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
ARFGEF1Q9Y6D6 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ARFGEF1Q9Y6D6 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
ARFGEF1Q9Y6D6 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
ARFGEF1Q9Y6D6 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ARFGEF1Q9Y6D6 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ARFGEF1Q9Y6D6 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ARFGEF1Q9Y6D6 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC27.54■■■□□ 2
ARFGEF1Q9Y6D6 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
ARFGEF1Q9Y6D6 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
ARFGEF1Q9Y6D6 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
ARFGEF1Q9Y6D6 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
ARFGEF1Q9Y6D6 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC27.53■■■□□ 2
ARFGEF1Q9Y6D6 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
ARFGEF1Q9Y6D6 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC27.53■■■□□ 2
ARFGEF1Q9Y6D6 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
ARFGEF1Q9Y6D6 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC27.53■■■□□ 2
ARFGEF1Q9Y6D6 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ARFGEF1Q9Y6D6 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
ARFGEF1Q9Y6D6 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
ARFGEF1Q9Y6D6 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC27.52■■■□□ 2
ARFGEF1Q9Y6D6 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ARFGEF1Q9Y6D6 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ARFGEF1Q9Y6D6 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ARFGEF1Q9Y6D6 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ARFGEF1Q9Y6D6 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ARFGEF1Q9Y6D6 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ARFGEF1Q9Y6D6 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ARFGEF1Q9Y6D6 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ARFGEF1Q9Y6D6 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ARFGEF1Q9Y6D6 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
ARFGEF1Q9Y6D6 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ARFGEF1Q9Y6D6 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ARFGEF1Q9Y6D6 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ARFGEF1Q9Y6D6 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ARFGEF1Q9Y6D6 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms