Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W9

SNX11, Sorting nexin-11, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX11Q9Y5W9 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNX11Q9Y5W9 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNX11Q9Y5W9 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNX11Q9Y5W9 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNX11Q9Y5W9 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNX11Q9Y5W9 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNX11Q9Y5W9 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNX11Q9Y5W9 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNX11Q9Y5W9 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNX11Q9Y5W9 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNX11Q9Y5W9 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNX11Q9Y5W9 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNX11Q9Y5W9 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNX11Q9Y5W9 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNX11Q9Y5W9 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNX11Q9Y5W9 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNX11Q9Y5W9 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SNX11Q9Y5W9 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNX11Q9Y5W9 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNX11Q9Y5W9 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNX11Q9Y5W9 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNX11Q9Y5W9 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNX11Q9Y5W9 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNX11Q9Y5W9 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNX11Q9Y5W9 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNX11Q9Y5W9 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNX11Q9Y5W9 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNX11Q9Y5W9 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNX11Q9Y5W9 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNX11Q9Y5W9 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNX11Q9Y5W9 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNX11Q9Y5W9 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SNX11Q9Y5W9 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNX11Q9Y5W9 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNX11Q9Y5W9 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNX11Q9Y5W9 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNX11Q9Y5W9 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNX11Q9Y5W9 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNX11Q9Y5W9 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNX11Q9Y5W9 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNX11Q9Y5W9 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNX11Q9Y5W9 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNX11Q9Y5W9 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNX11Q9Y5W9 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNX11Q9Y5W9 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNX11Q9Y5W9 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNX11Q9Y5W9 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SNX11Q9Y5W9 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNX11Q9Y5W9 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNX11Q9Y5W9 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SNX11Q9Y5W9 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNX11Q9Y5W9 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNX11Q9Y5W9 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNX11Q9Y5W9 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNX11Q9Y5W9 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNX11Q9Y5W9 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNX11Q9Y5W9 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNX11Q9Y5W9 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNX11Q9Y5W9 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNX11Q9Y5W9 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNX11Q9Y5W9 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SNX11Q9Y5W9 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNX11Q9Y5W9 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNX11Q9Y5W9 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNX11Q9Y5W9 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNX11Q9Y5W9 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNX11Q9Y5W9 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNX11Q9Y5W9 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNX11Q9Y5W9 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNX11Q9Y5W9 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNX11Q9Y5W9 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNX11Q9Y5W9 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNX11Q9Y5W9 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNX11Q9Y5W9 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNX11Q9Y5W9 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNX11Q9Y5W9 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNX11Q9Y5W9 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNX11Q9Y5W9 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNX11Q9Y5W9 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SNX11Q9Y5W9 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SNX11Q9Y5W9 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SNX11Q9Y5W9 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SNX11Q9Y5W9 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNX11Q9Y5W9 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNX11Q9Y5W9 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNX11Q9Y5W9 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SNX11Q9Y5W9 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNX11Q9Y5W9 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SNX11Q9Y5W9 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SNX11Q9Y5W9 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SNX11Q9Y5W9 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
SNX11Q9Y5W9 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SNX11Q9Y5W9 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SNX11Q9Y5W9 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SNX11Q9Y5W9 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SNX11Q9Y5W9 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SNX11Q9Y5W9 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SNX11Q9Y5W9 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SNX11Q9Y5W9 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SNX11Q9Y5W9 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms