Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5T5

USP16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, humanhuman

Predictions only

Length 823 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP16Q9Y5T5 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
USP16Q9Y5T5 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
USP16Q9Y5T5 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
USP16Q9Y5T5 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
USP16Q9Y5T5 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
USP16Q9Y5T5 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
USP16Q9Y5T5 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
USP16Q9Y5T5 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
USP16Q9Y5T5 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
USP16Q9Y5T5 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
USP16Q9Y5T5 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
USP16Q9Y5T5 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
USP16Q9Y5T5 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
USP16Q9Y5T5 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
USP16Q9Y5T5 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
USP16Q9Y5T5 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
USP16Q9Y5T5 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
USP16Q9Y5T5 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
USP16Q9Y5T5 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
USP16Q9Y5T5 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
USP16Q9Y5T5 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
USP16Q9Y5T5 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
USP16Q9Y5T5 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
USP16Q9Y5T5 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
USP16Q9Y5T5 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
USP16Q9Y5T5 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
USP16Q9Y5T5 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
USP16Q9Y5T5 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
USP16Q9Y5T5 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
USP16Q9Y5T5 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
USP16Q9Y5T5 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
USP16Q9Y5T5 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
USP16Q9Y5T5 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
USP16Q9Y5T5 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
USP16Q9Y5T5 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
USP16Q9Y5T5 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
USP16Q9Y5T5 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC28.57■■■□□ 2.16
USP16Q9Y5T5 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
USP16Q9Y5T5 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
USP16Q9Y5T5 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
USP16Q9Y5T5 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
USP16Q9Y5T5 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
USP16Q9Y5T5 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
USP16Q9Y5T5 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
USP16Q9Y5T5 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
USP16Q9Y5T5 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
USP16Q9Y5T5 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
USP16Q9Y5T5 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
USP16Q9Y5T5 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC28.56■■■□□ 2.16
USP16Q9Y5T5 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
USP16Q9Y5T5 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
USP16Q9Y5T5 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
USP16Q9Y5T5 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
USP16Q9Y5T5 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
USP16Q9Y5T5 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
USP16Q9Y5T5 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
USP16Q9Y5T5 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
USP16Q9Y5T5 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
USP16Q9Y5T5 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC28.56■■■□□ 2.16
USP16Q9Y5T5 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
USP16Q9Y5T5 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
USP16Q9Y5T5 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
USP16Q9Y5T5 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
USP16Q9Y5T5 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
USP16Q9Y5T5 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
USP16Q9Y5T5 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
USP16Q9Y5T5 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
USP16Q9Y5T5 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
USP16Q9Y5T5 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
USP16Q9Y5T5 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
USP16Q9Y5T5 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
USP16Q9Y5T5 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
USP16Q9Y5T5 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
USP16Q9Y5T5 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
USP16Q9Y5T5 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
USP16Q9Y5T5 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
USP16Q9Y5T5 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
USP16Q9Y5T5 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
USP16Q9Y5T5 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
USP16Q9Y5T5 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
USP16Q9Y5T5 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
USP16Q9Y5T5 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
USP16Q9Y5T5 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
USP16Q9Y5T5 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
USP16Q9Y5T5 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
USP16Q9Y5T5 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
USP16Q9Y5T5 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
USP16Q9Y5T5 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
USP16Q9Y5T5 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
USP16Q9Y5T5 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
USP16Q9Y5T5 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
USP16Q9Y5T5 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
USP16Q9Y5T5 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
USP16Q9Y5T5 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
USP16Q9Y5T5 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
USP16Q9Y5T5 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC28.52■■■□□ 2.16
USP16Q9Y5T5 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC28.52■■■□□ 2.16
USP16Q9Y5T5 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
USP16Q9Y5T5 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
USP16Q9Y5T5 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms