Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Q9

GTF3C3, General transcription factor 3C polypeptide 3, humanhuman

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C3Q9Y5Q9 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
GTF3C3Q9Y5Q9 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
GTF3C3Q9Y5Q9 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
GTF3C3Q9Y5Q9 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
GTF3C3Q9Y5Q9 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
GTF3C3Q9Y5Q9 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
GTF3C3Q9Y5Q9 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
GTF3C3Q9Y5Q9 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
GTF3C3Q9Y5Q9 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
GTF3C3Q9Y5Q9 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
GTF3C3Q9Y5Q9 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
GTF3C3Q9Y5Q9 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
GTF3C3Q9Y5Q9 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
GTF3C3Q9Y5Q9 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
GTF3C3Q9Y5Q9 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
GTF3C3Q9Y5Q9 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
GTF3C3Q9Y5Q9 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
GTF3C3Q9Y5Q9 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
GTF3C3Q9Y5Q9 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
GTF3C3Q9Y5Q9 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
GTF3C3Q9Y5Q9 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
GTF3C3Q9Y5Q9 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
GTF3C3Q9Y5Q9 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
GTF3C3Q9Y5Q9 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
GTF3C3Q9Y5Q9 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
GTF3C3Q9Y5Q9 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
GTF3C3Q9Y5Q9 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
GTF3C3Q9Y5Q9 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
GTF3C3Q9Y5Q9 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
GTF3C3Q9Y5Q9 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
GTF3C3Q9Y5Q9 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
GTF3C3Q9Y5Q9 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
GTF3C3Q9Y5Q9 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
GTF3C3Q9Y5Q9 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
GTF3C3Q9Y5Q9 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
GTF3C3Q9Y5Q9 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
GTF3C3Q9Y5Q9 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
GTF3C3Q9Y5Q9 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
GTF3C3Q9Y5Q9 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
GTF3C3Q9Y5Q9 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
GTF3C3Q9Y5Q9 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC29.79■■■□□ 2.36
GTF3C3Q9Y5Q9 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
GTF3C3Q9Y5Q9 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
GTF3C3Q9Y5Q9 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
GTF3C3Q9Y5Q9 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
GTF3C3Q9Y5Q9 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
GTF3C3Q9Y5Q9 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
GTF3C3Q9Y5Q9 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
GTF3C3Q9Y5Q9 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
GTF3C3Q9Y5Q9 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
GTF3C3Q9Y5Q9 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
GTF3C3Q9Y5Q9 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
GTF3C3Q9Y5Q9 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
GTF3C3Q9Y5Q9 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
GTF3C3Q9Y5Q9 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
GTF3C3Q9Y5Q9 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
GTF3C3Q9Y5Q9 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
GTF3C3Q9Y5Q9 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
GTF3C3Q9Y5Q9 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
GTF3C3Q9Y5Q9 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
GTF3C3Q9Y5Q9 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
GTF3C3Q9Y5Q9 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC29.76■■■□□ 2.36
GTF3C3Q9Y5Q9 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
GTF3C3Q9Y5Q9 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.36
GTF3C3Q9Y5Q9 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.36
GTF3C3Q9Y5Q9 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
GTF3C3Q9Y5Q9 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
GTF3C3Q9Y5Q9 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
GTF3C3Q9Y5Q9 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
GTF3C3Q9Y5Q9 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
GTF3C3Q9Y5Q9 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
GTF3C3Q9Y5Q9 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
GTF3C3Q9Y5Q9 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
GTF3C3Q9Y5Q9 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
GTF3C3Q9Y5Q9 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
GTF3C3Q9Y5Q9 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
GTF3C3Q9Y5Q9 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
GTF3C3Q9Y5Q9 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
GTF3C3Q9Y5Q9 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
GTF3C3Q9Y5Q9 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
GTF3C3Q9Y5Q9 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
GTF3C3Q9Y5Q9 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
GTF3C3Q9Y5Q9 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
GTF3C3Q9Y5Q9 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
GTF3C3Q9Y5Q9 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
GTF3C3Q9Y5Q9 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
GTF3C3Q9Y5Q9 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
GTF3C3Q9Y5Q9 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
GTF3C3Q9Y5Q9 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
GTF3C3Q9Y5Q9 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
GTF3C3Q9Y5Q9 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
GTF3C3Q9Y5Q9 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
GTF3C3Q9Y5Q9 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
GTF3C3Q9Y5Q9 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
GTF3C3Q9Y5Q9 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
GTF3C3Q9Y5Q9 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
GTF3C3Q9Y5Q9 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
GTF3C3Q9Y5Q9 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
GTF3C3Q9Y5Q9 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
GTF3C3Q9Y5Q9 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms