Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5P4

COL4A3BP, Collagen type IV alpha-3-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A3BPQ9Y5P4 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
COL4A3BPQ9Y5P4 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
COL4A3BPQ9Y5P4 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
COL4A3BPQ9Y5P4 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
COL4A3BPQ9Y5P4 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
COL4A3BPQ9Y5P4 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
COL4A3BPQ9Y5P4 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
COL4A3BPQ9Y5P4 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
COL4A3BPQ9Y5P4 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
COL4A3BPQ9Y5P4 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
COL4A3BPQ9Y5P4 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
COL4A3BPQ9Y5P4 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
COL4A3BPQ9Y5P4 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
COL4A3BPQ9Y5P4 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
COL4A3BPQ9Y5P4 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
COL4A3BPQ9Y5P4 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
COL4A3BPQ9Y5P4 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
COL4A3BPQ9Y5P4 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
COL4A3BPQ9Y5P4 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
COL4A3BPQ9Y5P4 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
COL4A3BPQ9Y5P4 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
COL4A3BPQ9Y5P4 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
COL4A3BPQ9Y5P4 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
COL4A3BPQ9Y5P4 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
COL4A3BPQ9Y5P4 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
COL4A3BPQ9Y5P4 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
COL4A3BPQ9Y5P4 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
COL4A3BPQ9Y5P4 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
COL4A3BPQ9Y5P4 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
COL4A3BPQ9Y5P4 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
COL4A3BPQ9Y5P4 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
COL4A3BPQ9Y5P4 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
COL4A3BPQ9Y5P4 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
COL4A3BPQ9Y5P4 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
COL4A3BPQ9Y5P4 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
COL4A3BPQ9Y5P4 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
COL4A3BPQ9Y5P4 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
COL4A3BPQ9Y5P4 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
COL4A3BPQ9Y5P4 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
COL4A3BPQ9Y5P4 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
COL4A3BPQ9Y5P4 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
COL4A3BPQ9Y5P4 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
COL4A3BPQ9Y5P4 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
COL4A3BPQ9Y5P4 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
COL4A3BPQ9Y5P4 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
COL4A3BPQ9Y5P4 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
COL4A3BPQ9Y5P4 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
COL4A3BPQ9Y5P4 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
COL4A3BPQ9Y5P4 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
COL4A3BPQ9Y5P4 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
COL4A3BPQ9Y5P4 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
COL4A3BPQ9Y5P4 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.56
COL4A3BPQ9Y5P4 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
COL4A3BPQ9Y5P4 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
COL4A3BPQ9Y5P4 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
COL4A3BPQ9Y5P4 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
COL4A3BPQ9Y5P4 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
COL4A3BPQ9Y5P4 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
COL4A3BPQ9Y5P4 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
COL4A3BPQ9Y5P4 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
COL4A3BPQ9Y5P4 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
COL4A3BPQ9Y5P4 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
COL4A3BPQ9Y5P4 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
COL4A3BPQ9Y5P4 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
COL4A3BPQ9Y5P4 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
COL4A3BPQ9Y5P4 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
COL4A3BPQ9Y5P4 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
COL4A3BPQ9Y5P4 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
COL4A3BPQ9Y5P4 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
COL4A3BPQ9Y5P4 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
COL4A3BPQ9Y5P4 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
COL4A3BPQ9Y5P4 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
COL4A3BPQ9Y5P4 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
COL4A3BPQ9Y5P4 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
COL4A3BPQ9Y5P4 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
COL4A3BPQ9Y5P4 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
COL4A3BPQ9Y5P4 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
COL4A3BPQ9Y5P4 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
COL4A3BPQ9Y5P4 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
COL4A3BPQ9Y5P4 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
COL4A3BPQ9Y5P4 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
COL4A3BPQ9Y5P4 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
COL4A3BPQ9Y5P4 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
COL4A3BPQ9Y5P4 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
COL4A3BPQ9Y5P4 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
COL4A3BPQ9Y5P4 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
COL4A3BPQ9Y5P4 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
COL4A3BPQ9Y5P4 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
COL4A3BPQ9Y5P4 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
COL4A3BPQ9Y5P4 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
COL4A3BPQ9Y5P4 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
COL4A3BPQ9Y5P4 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
COL4A3BPQ9Y5P4 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
COL4A3BPQ9Y5P4 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
COL4A3BPQ9Y5P4 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
COL4A3BPQ9Y5P4 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
COL4A3BPQ9Y5P4 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
COL4A3BPQ9Y5P4 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
COL4A3BPQ9Y5P4 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
COL4A3BPQ9Y5P4 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms