Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5F1

PCDHB12, Protocadherin beta-12, humanhuman

Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB12Q9Y5F1 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PCDHB12Q9Y5F1 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PCDHB12Q9Y5F1 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PCDHB12Q9Y5F1 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PCDHB12Q9Y5F1 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PCDHB12Q9Y5F1 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PCDHB12Q9Y5F1 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PCDHB12Q9Y5F1 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PCDHB12Q9Y5F1 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PCDHB12Q9Y5F1 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PCDHB12Q9Y5F1 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PCDHB12Q9Y5F1 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PCDHB12Q9Y5F1 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PCDHB12Q9Y5F1 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PCDHB12Q9Y5F1 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PCDHB12Q9Y5F1 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PCDHB12Q9Y5F1 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PCDHB12Q9Y5F1 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PCDHB12Q9Y5F1 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PCDHB12Q9Y5F1 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PCDHB12Q9Y5F1 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PCDHB12Q9Y5F1 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PCDHB12Q9Y5F1 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PCDHB12Q9Y5F1 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
PCDHB12Q9Y5F1 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PCDHB12Q9Y5F1 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PCDHB12Q9Y5F1 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PCDHB12Q9Y5F1 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PCDHB12Q9Y5F1 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PCDHB12Q9Y5F1 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PCDHB12Q9Y5F1 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PCDHB12Q9Y5F1 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PCDHB12Q9Y5F1 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PCDHB12Q9Y5F1 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PCDHB12Q9Y5F1 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PCDHB12Q9Y5F1 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PCDHB12Q9Y5F1 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PCDHB12Q9Y5F1 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PCDHB12Q9Y5F1 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PCDHB12Q9Y5F1 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PCDHB12Q9Y5F1 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PCDHB12Q9Y5F1 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PCDHB12Q9Y5F1 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
PCDHB12Q9Y5F1 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
PCDHB12Q9Y5F1 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PCDHB12Q9Y5F1 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PCDHB12Q9Y5F1 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PCDHB12Q9Y5F1 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PCDHB12Q9Y5F1 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PCDHB12Q9Y5F1 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PCDHB12Q9Y5F1 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PCDHB12Q9Y5F1 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PCDHB12Q9Y5F1 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PCDHB12Q9Y5F1 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PCDHB12Q9Y5F1 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PCDHB12Q9Y5F1 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PCDHB12Q9Y5F1 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PCDHB12Q9Y5F1 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PCDHB12Q9Y5F1 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PCDHB12Q9Y5F1 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PCDHB12Q9Y5F1 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PCDHB12Q9Y5F1 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PCDHB12Q9Y5F1 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PCDHB12Q9Y5F1 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PCDHB12Q9Y5F1 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PCDHB12Q9Y5F1 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PCDHB12Q9Y5F1 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PCDHB12Q9Y5F1 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PCDHB12Q9Y5F1 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PCDHB12Q9Y5F1 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PCDHB12Q9Y5F1 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PCDHB12Q9Y5F1 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PCDHB12Q9Y5F1 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
PCDHB12Q9Y5F1 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PCDHB12Q9Y5F1 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PCDHB12Q9Y5F1 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PCDHB12Q9Y5F1 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PCDHB12Q9Y5F1 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PCDHB12Q9Y5F1 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PCDHB12Q9Y5F1 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PCDHB12Q9Y5F1 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PCDHB12Q9Y5F1 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PCDHB12Q9Y5F1 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PCDHB12Q9Y5F1 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PCDHB12Q9Y5F1 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
PCDHB12Q9Y5F1 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PCDHB12Q9Y5F1 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PCDHB12Q9Y5F1 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PCDHB12Q9Y5F1 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PCDHB12Q9Y5F1 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PCDHB12Q9Y5F1 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PCDHB12Q9Y5F1 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PCDHB12Q9Y5F1 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
PCDHB12Q9Y5F1 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PCDHB12Q9Y5F1 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PCDHB12Q9Y5F1 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PCDHB12Q9Y5F1 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PCDHB12Q9Y5F1 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PCDHB12Q9Y5F1 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
PCDHB12Q9Y5F1 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms