Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5B9

SUPT16H, FACT complex subunit SPT16, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,047 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUPT16HQ9Y5B9 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SUPT16HQ9Y5B9 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.32
SUPT16HQ9Y5B9 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
SUPT16HQ9Y5B9 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
SUPT16HQ9Y5B9 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
SUPT16HQ9Y5B9 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
SUPT16HQ9Y5B9 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
SUPT16HQ9Y5B9 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SUPT16HQ9Y5B9 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SUPT16HQ9Y5B9 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
SUPT16HQ9Y5B9 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SUPT16HQ9Y5B9 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SUPT16HQ9Y5B9 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC29.5■■■□□ 2.31
SUPT16HQ9Y5B9 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SUPT16HQ9Y5B9 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SUPT16HQ9Y5B9 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SUPT16HQ9Y5B9 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
SUPT16HQ9Y5B9 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
SUPT16HQ9Y5B9 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SUPT16HQ9Y5B9 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SUPT16HQ9Y5B9 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SUPT16HQ9Y5B9 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SUPT16HQ9Y5B9 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SUPT16HQ9Y5B9 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SUPT16HQ9Y5B9 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
SUPT16HQ9Y5B9 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SUPT16HQ9Y5B9 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SUPT16HQ9Y5B9 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SUPT16HQ9Y5B9 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
SUPT16HQ9Y5B9 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
SUPT16HQ9Y5B9 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
SUPT16HQ9Y5B9 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
SUPT16HQ9Y5B9 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
SUPT16HQ9Y5B9 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
SUPT16HQ9Y5B9 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
SUPT16HQ9Y5B9 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
SUPT16HQ9Y5B9 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
SUPT16HQ9Y5B9 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
SUPT16HQ9Y5B9 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
SUPT16HQ9Y5B9 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
SUPT16HQ9Y5B9 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
SUPT16HQ9Y5B9 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
SUPT16HQ9Y5B9 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
SUPT16HQ9Y5B9 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
SUPT16HQ9Y5B9 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
SUPT16HQ9Y5B9 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
SUPT16HQ9Y5B9 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SUPT16HQ9Y5B9 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC29.46■■■□□ 2.31
SUPT16HQ9Y5B9 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
SUPT16HQ9Y5B9 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
SUPT16HQ9Y5B9 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
SUPT16HQ9Y5B9 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
SUPT16HQ9Y5B9 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
SUPT16HQ9Y5B9 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
SUPT16HQ9Y5B9 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
SUPT16HQ9Y5B9 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
SUPT16HQ9Y5B9 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
SUPT16HQ9Y5B9 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
SUPT16HQ9Y5B9 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
SUPT16HQ9Y5B9 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
SUPT16HQ9Y5B9 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
SUPT16HQ9Y5B9 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
SUPT16HQ9Y5B9 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
SUPT16HQ9Y5B9 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SUPT16HQ9Y5B9 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC29.44■■■□□ 2.3
SUPT16HQ9Y5B9 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SUPT16HQ9Y5B9 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
SUPT16HQ9Y5B9 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SUPT16HQ9Y5B9 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SUPT16HQ9Y5B9 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SUPT16HQ9Y5B9 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SUPT16HQ9Y5B9 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SUPT16HQ9Y5B9 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SUPT16HQ9Y5B9 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
SUPT16HQ9Y5B9 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
SUPT16HQ9Y5B9 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SUPT16HQ9Y5B9 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SUPT16HQ9Y5B9 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SUPT16HQ9Y5B9 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SUPT16HQ9Y5B9 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SUPT16HQ9Y5B9 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
SUPT16HQ9Y5B9 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SUPT16HQ9Y5B9 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SUPT16HQ9Y5B9 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
SUPT16HQ9Y5B9 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
SUPT16HQ9Y5B9 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
SUPT16HQ9Y5B9 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
SUPT16HQ9Y5B9 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SUPT16HQ9Y5B9 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SUPT16HQ9Y5B9 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
SUPT16HQ9Y5B9 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
SUPT16HQ9Y5B9 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SUPT16HQ9Y5B9 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
SUPT16HQ9Y5B9 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SUPT16HQ9Y5B9 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SUPT16HQ9Y5B9 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SUPT16HQ9Y5B9 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SUPT16HQ9Y5B9 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SUPT16HQ9Y5B9 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SUPT16HQ9Y5B9 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms