Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4G8

RAPGEF2, Rap guanine nucleotide exchange factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAPGEF2Q9Y4G8 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC36.61■■■■□ 3.45
RAPGEF2Q9Y4G8 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
RAPGEF2Q9Y4G8 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC36.61■■■■□ 3.45
RAPGEF2Q9Y4G8 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
RAPGEF2Q9Y4G8 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.61■■■■□ 3.45
RAPGEF2Q9Y4G8 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC36.6■■■■□ 3.45
RAPGEF2Q9Y4G8 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
RAPGEF2Q9Y4G8 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
RAPGEF2Q9Y4G8 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
RAPGEF2Q9Y4G8 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
RAPGEF2Q9Y4G8 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.59■■■■□ 3.45
RAPGEF2Q9Y4G8 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC36.59■■■■□ 3.45
RAPGEF2Q9Y4G8 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC36.59■■■■□ 3.45
RAPGEF2Q9Y4G8 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.59■■■■□ 3.45
RAPGEF2Q9Y4G8 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC36.59■■■■□ 3.45
RAPGEF2Q9Y4G8 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC36.58■■■■□ 3.45
RAPGEF2Q9Y4G8 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
RAPGEF2Q9Y4G8 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
RAPGEF2Q9Y4G8 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
RAPGEF2Q9Y4G8 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
RAPGEF2Q9Y4G8 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
RAPGEF2Q9Y4G8 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.58■■■■□ 3.45
RAPGEF2Q9Y4G8 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
RAPGEF2Q9Y4G8 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC36.58■■■■□ 3.45
RAPGEF2Q9Y4G8 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
RAPGEF2Q9Y4G8 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
RAPGEF2Q9Y4G8 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
RAPGEF2Q9Y4G8 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
RAPGEF2Q9Y4G8 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
RAPGEF2Q9Y4G8 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
RAPGEF2Q9Y4G8 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC36.58■■■■□ 3.45
RAPGEF2Q9Y4G8 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.45
RAPGEF2Q9Y4G8 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.45
RAPGEF2Q9Y4G8 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.45
RAPGEF2Q9Y4G8 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.45
RAPGEF2Q9Y4G8 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.57■■■■□ 3.44
RAPGEF2Q9Y4G8 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
RAPGEF2Q9Y4G8 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.57■■■■□ 3.44
RAPGEF2Q9Y4G8 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
RAPGEF2Q9Y4G8 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
RAPGEF2Q9Y4G8 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
RAPGEF2Q9Y4G8 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC36.56■■■■□ 3.44
RAPGEF2Q9Y4G8 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
RAPGEF2Q9Y4G8 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
RAPGEF2Q9Y4G8 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC36.56■■■■□ 3.44
RAPGEF2Q9Y4G8 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC36.56■■■■□ 3.44
RAPGEF2Q9Y4G8 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC36.56■■■■□ 3.44
RAPGEF2Q9Y4G8 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC36.56■■■■□ 3.44
RAPGEF2Q9Y4G8 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
RAPGEF2Q9Y4G8 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
RAPGEF2Q9Y4G8 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
RAPGEF2Q9Y4G8 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
RAPGEF2Q9Y4G8 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
RAPGEF2Q9Y4G8 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.55■■■■□ 3.44
RAPGEF2Q9Y4G8 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC36.55■■■■□ 3.44
RAPGEF2Q9Y4G8 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC36.55■■■■□ 3.44
RAPGEF2Q9Y4G8 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
RAPGEF2Q9Y4G8 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC36.55■■■■□ 3.44
RAPGEF2Q9Y4G8 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC36.54■■■■□ 3.44
RAPGEF2Q9Y4G8 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
RAPGEF2Q9Y4G8 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC36.54■■■■□ 3.44
RAPGEF2Q9Y4G8 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC36.54■■■■□ 3.44
RAPGEF2Q9Y4G8 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC36.54■■■■□ 3.44
RAPGEF2Q9Y4G8 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
RAPGEF2Q9Y4G8 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
RAPGEF2Q9Y4G8 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC36.53■■■■□ 3.44
RAPGEF2Q9Y4G8 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
RAPGEF2Q9Y4G8 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.53■■■■□ 3.44
RAPGEF2Q9Y4G8 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
RAPGEF2Q9Y4G8 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
RAPGEF2Q9Y4G8 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
RAPGEF2Q9Y4G8 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC36.53■■■■□ 3.44
RAPGEF2Q9Y4G8 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC36.52■■■■□ 3.44
RAPGEF2Q9Y4G8 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
RAPGEF2Q9Y4G8 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC36.52■■■■□ 3.44
RAPGEF2Q9Y4G8 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC36.52■■■■□ 3.44
RAPGEF2Q9Y4G8 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
RAPGEF2Q9Y4G8 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC36.51■■■■□ 3.44
RAPGEF2Q9Y4G8 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
RAPGEF2Q9Y4G8 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
RAPGEF2Q9Y4G8 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.51■■■■□ 3.44
RAPGEF2Q9Y4G8 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC36.51■■■■□ 3.44
RAPGEF2Q9Y4G8 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC36.51■■■■□ 3.44
RAPGEF2Q9Y4G8 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
RAPGEF2Q9Y4G8 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.43
RAPGEF2Q9Y4G8 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.43
RAPGEF2Q9Y4G8 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC36.5■■■■□ 3.43
RAPGEF2Q9Y4G8 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.5■■■■□ 3.43
RAPGEF2Q9Y4G8 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC36.5■■■■□ 3.43
RAPGEF2Q9Y4G8 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.5■■■■□ 3.43
RAPGEF2Q9Y4G8 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.5■■■■□ 3.43
RAPGEF2Q9Y4G8 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
RAPGEF2Q9Y4G8 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
RAPGEF2Q9Y4G8 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.5■■■■□ 3.43
RAPGEF2Q9Y4G8 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
RAPGEF2Q9Y4G8 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC36.49■■■■□ 3.43
RAPGEF2Q9Y4G8 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC36.49■■■■□ 3.43
RAPGEF2Q9Y4G8 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC36.49■■■■□ 3.43
RAPGEF2Q9Y4G8 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC36.49■■■■□ 3.43
RAPGEF2Q9Y4G8 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC36.49■■■■□ 3.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms