Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3Q4

HCN4, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN4Q9Y3Q4 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HCN4Q9Y3Q4 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HCN4Q9Y3Q4 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
HCN4Q9Y3Q4 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HCN4Q9Y3Q4 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HCN4Q9Y3Q4 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HCN4Q9Y3Q4 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HCN4Q9Y3Q4 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HCN4Q9Y3Q4 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HCN4Q9Y3Q4 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HCN4Q9Y3Q4 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HCN4Q9Y3Q4 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HCN4Q9Y3Q4 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HCN4Q9Y3Q4 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HCN4Q9Y3Q4 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HCN4Q9Y3Q4 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HCN4Q9Y3Q4 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HCN4Q9Y3Q4 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HCN4Q9Y3Q4 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HCN4Q9Y3Q4 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HCN4Q9Y3Q4 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HCN4Q9Y3Q4 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HCN4Q9Y3Q4 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HCN4Q9Y3Q4 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HCN4Q9Y3Q4 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HCN4Q9Y3Q4 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HCN4Q9Y3Q4 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
HCN4Q9Y3Q4 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
HCN4Q9Y3Q4 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
HCN4Q9Y3Q4 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HCN4Q9Y3Q4 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HCN4Q9Y3Q4 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HCN4Q9Y3Q4 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HCN4Q9Y3Q4 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HCN4Q9Y3Q4 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HCN4Q9Y3Q4 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HCN4Q9Y3Q4 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HCN4Q9Y3Q4 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HCN4Q9Y3Q4 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HCN4Q9Y3Q4 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HCN4Q9Y3Q4 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
HCN4Q9Y3Q4 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HCN4Q9Y3Q4 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HCN4Q9Y3Q4 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HCN4Q9Y3Q4 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HCN4Q9Y3Q4 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HCN4Q9Y3Q4 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
HCN4Q9Y3Q4 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
HCN4Q9Y3Q4 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HCN4Q9Y3Q4 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
HCN4Q9Y3Q4 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HCN4Q9Y3Q4 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HCN4Q9Y3Q4 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HCN4Q9Y3Q4 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HCN4Q9Y3Q4 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HCN4Q9Y3Q4 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HCN4Q9Y3Q4 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HCN4Q9Y3Q4 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HCN4Q9Y3Q4 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HCN4Q9Y3Q4 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HCN4Q9Y3Q4 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HCN4Q9Y3Q4 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HCN4Q9Y3Q4 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HCN4Q9Y3Q4 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HCN4Q9Y3Q4 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HCN4Q9Y3Q4 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HCN4Q9Y3Q4 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HCN4Q9Y3Q4 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HCN4Q9Y3Q4 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
HCN4Q9Y3Q4 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HCN4Q9Y3Q4 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HCN4Q9Y3Q4 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HCN4Q9Y3Q4 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HCN4Q9Y3Q4 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HCN4Q9Y3Q4 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
HCN4Q9Y3Q4 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HCN4Q9Y3Q4 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HCN4Q9Y3Q4 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
HCN4Q9Y3Q4 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HCN4Q9Y3Q4 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HCN4Q9Y3Q4 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HCN4Q9Y3Q4 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HCN4Q9Y3Q4 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HCN4Q9Y3Q4 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HCN4Q9Y3Q4 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HCN4Q9Y3Q4 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
HCN4Q9Y3Q4 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HCN4Q9Y3Q4 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HCN4Q9Y3Q4 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HCN4Q9Y3Q4 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HCN4Q9Y3Q4 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HCN4Q9Y3Q4 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HCN4Q9Y3Q4 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HCN4Q9Y3Q4 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
HCN4Q9Y3Q4 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HCN4Q9Y3Q4 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
HCN4Q9Y3Q4 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HCN4Q9Y3Q4 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HCN4Q9Y3Q4 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HCN4Q9Y3Q4 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms