Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y343

SNX24, Sorting nexin-24, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX24Q9Y343 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNX24Q9Y343 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNX24Q9Y343 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNX24Q9Y343 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNX24Q9Y343 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNX24Q9Y343 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SNX24Q9Y343 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNX24Q9Y343 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNX24Q9Y343 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNX24Q9Y343 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNX24Q9Y343 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNX24Q9Y343 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SNX24Q9Y343 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SNX24Q9Y343 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SNX24Q9Y343 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SNX24Q9Y343 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SNX24Q9Y343 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SNX24Q9Y343 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNX24Q9Y343 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNX24Q9Y343 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNX24Q9Y343 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNX24Q9Y343 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNX24Q9Y343 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNX24Q9Y343 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNX24Q9Y343 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNX24Q9Y343 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNX24Q9Y343 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNX24Q9Y343 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNX24Q9Y343 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNX24Q9Y343 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNX24Q9Y343 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNX24Q9Y343 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNX24Q9Y343 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNX24Q9Y343 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNX24Q9Y343 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNX24Q9Y343 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNX24Q9Y343 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNX24Q9Y343 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNX24Q9Y343 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNX24Q9Y343 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNX24Q9Y343 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNX24Q9Y343 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNX24Q9Y343 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SNX24Q9Y343 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNX24Q9Y343 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNX24Q9Y343 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNX24Q9Y343 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNX24Q9Y343 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNX24Q9Y343 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNX24Q9Y343 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNX24Q9Y343 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNX24Q9Y343 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SNX24Q9Y343 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SNX24Q9Y343 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNX24Q9Y343 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNX24Q9Y343 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNX24Q9Y343 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNX24Q9Y343 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNX24Q9Y343 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNX24Q9Y343 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNX24Q9Y343 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNX24Q9Y343 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNX24Q9Y343 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNX24Q9Y343 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNX24Q9Y343 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SNX24Q9Y343 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNX24Q9Y343 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNX24Q9Y343 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNX24Q9Y343 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNX24Q9Y343 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNX24Q9Y343 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNX24Q9Y343 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNX24Q9Y343 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNX24Q9Y343 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNX24Q9Y343 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNX24Q9Y343 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNX24Q9Y343 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SNX24Q9Y343 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SNX24Q9Y343 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SNX24Q9Y343 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SNX24Q9Y343 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SNX24Q9Y343 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SNX24Q9Y343 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SNX24Q9Y343 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SNX24Q9Y343 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SNX24Q9Y343 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SNX24Q9Y343 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SNX24Q9Y343 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SNX24Q9Y343 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SNX24Q9Y343 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SNX24Q9Y343 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SNX24Q9Y343 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNX24Q9Y343 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNX24Q9Y343 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SNX24Q9Y343 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SNX24Q9Y343 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNX24Q9Y343 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SNX24Q9Y343 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SNX24Q9Y343 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SNX24Q9Y343 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms