Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K6

USP20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, humanhuman

Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP20Q9Y2K6 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP20Q9Y2K6 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP20Q9Y2K6 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP20Q9Y2K6 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP20Q9Y2K6 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP20Q9Y2K6 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP20Q9Y2K6 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP20Q9Y2K6 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP20Q9Y2K6 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
USP20Q9Y2K6 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
USP20Q9Y2K6 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP20Q9Y2K6 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP20Q9Y2K6 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
USP20Q9Y2K6 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
USP20Q9Y2K6 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
USP20Q9Y2K6 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
USP20Q9Y2K6 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
USP20Q9Y2K6 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
USP20Q9Y2K6 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
USP20Q9Y2K6 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
USP20Q9Y2K6 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
USP20Q9Y2K6 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
USP20Q9Y2K6 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
USP20Q9Y2K6 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
USP20Q9Y2K6 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
USP20Q9Y2K6 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP20Q9Y2K6 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP20Q9Y2K6 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
USP20Q9Y2K6 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP20Q9Y2K6 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP20Q9Y2K6 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP20Q9Y2K6 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP20Q9Y2K6 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
USP20Q9Y2K6 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP20Q9Y2K6 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP20Q9Y2K6 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP20Q9Y2K6 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP20Q9Y2K6 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP20Q9Y2K6 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
USP20Q9Y2K6 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP20Q9Y2K6 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP20Q9Y2K6 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
USP20Q9Y2K6 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP20Q9Y2K6 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP20Q9Y2K6 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP20Q9Y2K6 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
USP20Q9Y2K6 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
USP20Q9Y2K6 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
USP20Q9Y2K6 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP20Q9Y2K6 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP20Q9Y2K6 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP20Q9Y2K6 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP20Q9Y2K6 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP20Q9Y2K6 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP20Q9Y2K6 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP20Q9Y2K6 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP20Q9Y2K6 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP20Q9Y2K6 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP20Q9Y2K6 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP20Q9Y2K6 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP20Q9Y2K6 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP20Q9Y2K6 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP20Q9Y2K6 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
USP20Q9Y2K6 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
USP20Q9Y2K6 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP20Q9Y2K6 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP20Q9Y2K6 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP20Q9Y2K6 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP20Q9Y2K6 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP20Q9Y2K6 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP20Q9Y2K6 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP20Q9Y2K6 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP20Q9Y2K6 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP20Q9Y2K6 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
USP20Q9Y2K6 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP20Q9Y2K6 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP20Q9Y2K6 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP20Q9Y2K6 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP20Q9Y2K6 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
USP20Q9Y2K6 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP20Q9Y2K6 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP20Q9Y2K6 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP20Q9Y2K6 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP20Q9Y2K6 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP20Q9Y2K6 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
USP20Q9Y2K6 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP20Q9Y2K6 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP20Q9Y2K6 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP20Q9Y2K6 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP20Q9Y2K6 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP20Q9Y2K6 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP20Q9Y2K6 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
USP20Q9Y2K6 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
USP20Q9Y2K6 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
USP20Q9Y2K6 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
USP20Q9Y2K6 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
USP20Q9Y2K6 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
USP20Q9Y2K6 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
USP20Q9Y2K6 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
USP20Q9Y2K6 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 157.5 ms