Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN81

L1RE1, LINE-1 retrotransposable element ORF1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
L1RE1Q9UN81 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
L1RE1Q9UN81 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
L1RE1Q9UN81 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
L1RE1Q9UN81 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
L1RE1Q9UN81 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
L1RE1Q9UN81 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
L1RE1Q9UN81 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
L1RE1Q9UN81 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
L1RE1Q9UN81 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
L1RE1Q9UN81 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
L1RE1Q9UN81 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
L1RE1Q9UN81 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
L1RE1Q9UN81 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
L1RE1Q9UN81 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
L1RE1Q9UN81 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
L1RE1Q9UN81 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
L1RE1Q9UN81 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
L1RE1Q9UN81 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
L1RE1Q9UN81 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
L1RE1Q9UN81 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
L1RE1Q9UN81 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
L1RE1Q9UN81 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
L1RE1Q9UN81 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
L1RE1Q9UN81 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
L1RE1Q9UN81 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
L1RE1Q9UN81 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
L1RE1Q9UN81 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
L1RE1Q9UN81 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
L1RE1Q9UN81 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
L1RE1Q9UN81 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
L1RE1Q9UN81 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
L1RE1Q9UN81 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
L1RE1Q9UN81 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
L1RE1Q9UN81 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
L1RE1Q9UN81 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
L1RE1Q9UN81 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
L1RE1Q9UN81 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
L1RE1Q9UN81 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
L1RE1Q9UN81 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
L1RE1Q9UN81 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
L1RE1Q9UN81 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
L1RE1Q9UN81 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
L1RE1Q9UN81 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
L1RE1Q9UN81 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
L1RE1Q9UN81 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
L1RE1Q9UN81 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
L1RE1Q9UN81 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
L1RE1Q9UN81 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
L1RE1Q9UN81 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
L1RE1Q9UN81 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
L1RE1Q9UN81 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
L1RE1Q9UN81 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
L1RE1Q9UN81 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
L1RE1Q9UN81 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
L1RE1Q9UN81 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
L1RE1Q9UN81 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
L1RE1Q9UN81 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
L1RE1Q9UN81 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
L1RE1Q9UN81 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
L1RE1Q9UN81 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
L1RE1Q9UN81 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
L1RE1Q9UN81 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
L1RE1Q9UN81 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
L1RE1Q9UN81 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
L1RE1Q9UN81 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
L1RE1Q9UN81 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
L1RE1Q9UN81 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
L1RE1Q9UN81 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
L1RE1Q9UN81 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
L1RE1Q9UN81 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
L1RE1Q9UN81 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
L1RE1Q9UN81 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
L1RE1Q9UN81 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
L1RE1Q9UN81 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
L1RE1Q9UN81 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
L1RE1Q9UN81 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
L1RE1Q9UN81 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
L1RE1Q9UN81 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
L1RE1Q9UN81 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
L1RE1Q9UN81 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
L1RE1Q9UN81 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
L1RE1Q9UN81 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
L1RE1Q9UN81 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
L1RE1Q9UN81 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
L1RE1Q9UN81 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
L1RE1Q9UN81 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
L1RE1Q9UN81 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
L1RE1Q9UN81 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
L1RE1Q9UN81 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
L1RE1Q9UN81 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
L1RE1Q9UN81 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
L1RE1Q9UN81 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
L1RE1Q9UN81 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
L1RE1Q9UN81 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
L1RE1Q9UN81 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
L1RE1Q9UN81 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
L1RE1Q9UN81 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
L1RE1Q9UN81 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
L1RE1Q9UN81 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
L1RE1Q9UN81 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms