Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMQ6

CAPN11, Calpain-11, humanhuman

Predictions only

Length 739 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN11Q9UMQ6 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CAPN11Q9UMQ6 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CAPN11Q9UMQ6 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CAPN11Q9UMQ6 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CAPN11Q9UMQ6 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CAPN11Q9UMQ6 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CAPN11Q9UMQ6 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CAPN11Q9UMQ6 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CAPN11Q9UMQ6 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CAPN11Q9UMQ6 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CAPN11Q9UMQ6 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CAPN11Q9UMQ6 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CAPN11Q9UMQ6 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CAPN11Q9UMQ6 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CAPN11Q9UMQ6 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CAPN11Q9UMQ6 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CAPN11Q9UMQ6 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CAPN11Q9UMQ6 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CAPN11Q9UMQ6 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CAPN11Q9UMQ6 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CAPN11Q9UMQ6 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CAPN11Q9UMQ6 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CAPN11Q9UMQ6 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CAPN11Q9UMQ6 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CAPN11Q9UMQ6 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CAPN11Q9UMQ6 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CAPN11Q9UMQ6 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CAPN11Q9UMQ6 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CAPN11Q9UMQ6 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CAPN11Q9UMQ6 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CAPN11Q9UMQ6 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CAPN11Q9UMQ6 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CAPN11Q9UMQ6 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CAPN11Q9UMQ6 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CAPN11Q9UMQ6 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CAPN11Q9UMQ6 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CAPN11Q9UMQ6 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CAPN11Q9UMQ6 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CAPN11Q9UMQ6 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CAPN11Q9UMQ6 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CAPN11Q9UMQ6 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CAPN11Q9UMQ6 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CAPN11Q9UMQ6 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CAPN11Q9UMQ6 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CAPN11Q9UMQ6 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CAPN11Q9UMQ6 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CAPN11Q9UMQ6 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CAPN11Q9UMQ6 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CAPN11Q9UMQ6 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CAPN11Q9UMQ6 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CAPN11Q9UMQ6 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CAPN11Q9UMQ6 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CAPN11Q9UMQ6 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CAPN11Q9UMQ6 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CAPN11Q9UMQ6 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CAPN11Q9UMQ6 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CAPN11Q9UMQ6 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CAPN11Q9UMQ6 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CAPN11Q9UMQ6 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CAPN11Q9UMQ6 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CAPN11Q9UMQ6 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CAPN11Q9UMQ6 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CAPN11Q9UMQ6 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CAPN11Q9UMQ6 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CAPN11Q9UMQ6 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CAPN11Q9UMQ6 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CAPN11Q9UMQ6 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CAPN11Q9UMQ6 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CAPN11Q9UMQ6 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CAPN11Q9UMQ6 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CAPN11Q9UMQ6 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CAPN11Q9UMQ6 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CAPN11Q9UMQ6 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CAPN11Q9UMQ6 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CAPN11Q9UMQ6 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CAPN11Q9UMQ6 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CAPN11Q9UMQ6 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CAPN11Q9UMQ6 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CAPN11Q9UMQ6 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CAPN11Q9UMQ6 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CAPN11Q9UMQ6 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CAPN11Q9UMQ6 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CAPN11Q9UMQ6 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CAPN11Q9UMQ6 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CAPN11Q9UMQ6 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CAPN11Q9UMQ6 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CAPN11Q9UMQ6 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CAPN11Q9UMQ6 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CAPN11Q9UMQ6 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CAPN11Q9UMQ6 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CAPN11Q9UMQ6 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CAPN11Q9UMQ6 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CAPN11Q9UMQ6 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CAPN11Q9UMQ6 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CAPN11Q9UMQ6 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CAPN11Q9UMQ6 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CAPN11Q9UMQ6 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24■■□□□ 1.43
CAPN11Q9UMQ6 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
CAPN11Q9UMQ6 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CAPN11Q9UMQ6 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms