Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULG1

INO80, DNA helicase INO80, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INO80Q9ULG1 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
INO80Q9ULG1 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC33.56■■■□□ 2.96
INO80Q9ULG1 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC33.56■■■□□ 2.96
INO80Q9ULG1 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
INO80Q9ULG1 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
INO80Q9ULG1 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
INO80Q9ULG1 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
INO80Q9ULG1 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
INO80Q9ULG1 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
INO80Q9ULG1 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
INO80Q9ULG1 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
INO80Q9ULG1 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC33.55■■■□□ 2.96
INO80Q9ULG1 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
INO80Q9ULG1 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
INO80Q9ULG1 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
INO80Q9ULG1 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC33.55■■■□□ 2.96
INO80Q9ULG1 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
INO80Q9ULG1 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
INO80Q9ULG1 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.55■■■□□ 2.96
INO80Q9ULG1 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
INO80Q9ULG1 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC33.55■■■□□ 2.96
INO80Q9ULG1 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC33.55■■■□□ 2.96
INO80Q9ULG1 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC33.55■■■□□ 2.96
INO80Q9ULG1 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
INO80Q9ULG1 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
INO80Q9ULG1 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
INO80Q9ULG1 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC33.54■■■□□ 2.96
INO80Q9ULG1 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
INO80Q9ULG1 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
INO80Q9ULG1 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
INO80Q9ULG1 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
INO80Q9ULG1 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC33.54■■■□□ 2.96
INO80Q9ULG1 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
INO80Q9ULG1 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
INO80Q9ULG1 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
INO80Q9ULG1 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
INO80Q9ULG1 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
INO80Q9ULG1 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC33.53■■■□□ 2.96
INO80Q9ULG1 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
INO80Q9ULG1 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
INO80Q9ULG1 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
INO80Q9ULG1 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
INO80Q9ULG1 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
INO80Q9ULG1 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
INO80Q9ULG1 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
INO80Q9ULG1 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.96
INO80Q9ULG1 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.96
INO80Q9ULG1 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC33.51■■■□□ 2.95
INO80Q9ULG1 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC33.51■■■□□ 2.95
INO80Q9ULG1 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.95
INO80Q9ULG1 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.95
INO80Q9ULG1 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
INO80Q9ULG1 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
INO80Q9ULG1 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
INO80Q9ULG1 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
INO80Q9ULG1 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
INO80Q9ULG1 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.49■■■□□ 2.95
INO80Q9ULG1 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
INO80Q9ULG1 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
INO80Q9ULG1 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
INO80Q9ULG1 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
INO80Q9ULG1 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC33.48■■■□□ 2.95
INO80Q9ULG1 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
INO80Q9ULG1 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
INO80Q9ULG1 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC33.48■■■□□ 2.95
INO80Q9ULG1 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
INO80Q9ULG1 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
INO80Q9ULG1 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
INO80Q9ULG1 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
INO80Q9ULG1 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
INO80Q9ULG1 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
INO80Q9ULG1 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
INO80Q9ULG1 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
INO80Q9ULG1 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
INO80Q9ULG1 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
INO80Q9ULG1 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
INO80Q9ULG1 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
INO80Q9ULG1 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
INO80Q9ULG1 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
INO80Q9ULG1 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
INO80Q9ULG1 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
INO80Q9ULG1 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
INO80Q9ULG1 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
INO80Q9ULG1 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.95
INO80Q9ULG1 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC33.45■■■□□ 2.95
INO80Q9ULG1 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.95
INO80Q9ULG1 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
INO80Q9ULG1 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
INO80Q9ULG1 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC33.44■■■□□ 2.94
INO80Q9ULG1 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC33.44■■■□□ 2.94
INO80Q9ULG1 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
INO80Q9ULG1 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
INO80Q9ULG1 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
INO80Q9ULG1 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
INO80Q9ULG1 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
INO80Q9ULG1 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
INO80Q9ULG1 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
INO80Q9ULG1 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC33.43■■■□□ 2.94
INO80Q9ULG1 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC33.43■■■□□ 2.94
INO80Q9ULG1 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC33.43■■■□□ 2.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms