Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKK3

PARP4, Poly [ADP-ribose] polymerase 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP4Q9UKK3 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
PARP4Q9UKK3 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
PARP4Q9UKK3 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
PARP4Q9UKK3 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
PARP4Q9UKK3 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
PARP4Q9UKK3 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
PARP4Q9UKK3 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC29.64■■■□□ 2.34
PARP4Q9UKK3 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
PARP4Q9UKK3 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
PARP4Q9UKK3 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
PARP4Q9UKK3 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
PARP4Q9UKK3 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
PARP4Q9UKK3 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC29.63■■■□□ 2.33
PARP4Q9UKK3 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
PARP4Q9UKK3 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
PARP4Q9UKK3 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
PARP4Q9UKK3 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PARP4Q9UKK3 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC29.62■■■□□ 2.33
PARP4Q9UKK3 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
PARP4Q9UKK3 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
PARP4Q9UKK3 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
PARP4Q9UKK3 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
PARP4Q9UKK3 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
PARP4Q9UKK3 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
PARP4Q9UKK3 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC29.61■■■□□ 2.33
PARP4Q9UKK3 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
PARP4Q9UKK3 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
PARP4Q9UKK3 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
PARP4Q9UKK3 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
PARP4Q9UKK3 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
PARP4Q9UKK3 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
PARP4Q9UKK3 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PARP4Q9UKK3 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
PARP4Q9UKK3 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
PARP4Q9UKK3 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
PARP4Q9UKK3 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
PARP4Q9UKK3 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
PARP4Q9UKK3 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PARP4Q9UKK3 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
PARP4Q9UKK3 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PARP4Q9UKK3 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
PARP4Q9UKK3 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
PARP4Q9UKK3 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
PARP4Q9UKK3 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
PARP4Q9UKK3 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
PARP4Q9UKK3 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
PARP4Q9UKK3 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC29.57■■■□□ 2.32
PARP4Q9UKK3 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
PARP4Q9UKK3 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
PARP4Q9UKK3 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
PARP4Q9UKK3 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
PARP4Q9UKK3 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
PARP4Q9UKK3 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
PARP4Q9UKK3 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
PARP4Q9UKK3 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC29.56■■■□□ 2.32
PARP4Q9UKK3 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
PARP4Q9UKK3 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
PARP4Q9UKK3 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
PARP4Q9UKK3 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
PARP4Q9UKK3 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
PARP4Q9UKK3 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
PARP4Q9UKK3 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PARP4Q9UKK3 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
PARP4Q9UKK3 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PARP4Q9UKK3 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PARP4Q9UKK3 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PARP4Q9UKK3 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
PARP4Q9UKK3 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
PARP4Q9UKK3 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
PARP4Q9UKK3 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PARP4Q9UKK3 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PARP4Q9UKK3 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
PARP4Q9UKK3 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PARP4Q9UKK3 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
PARP4Q9UKK3 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PARP4Q9UKK3 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PARP4Q9UKK3 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
PARP4Q9UKK3 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
PARP4Q9UKK3 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
PARP4Q9UKK3 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
PARP4Q9UKK3 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
PARP4Q9UKK3 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
PARP4Q9UKK3 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
PARP4Q9UKK3 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PARP4Q9UKK3 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PARP4Q9UKK3 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
PARP4Q9UKK3 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PARP4Q9UKK3 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PARP4Q9UKK3 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PARP4Q9UKK3 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
PARP4Q9UKK3 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
PARP4Q9UKK3 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PARP4Q9UKK3 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
PARP4Q9UKK3 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
PARP4Q9UKK3 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.32
PARP4Q9UKK3 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.32
PARP4Q9UKK3 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.32
PARP4Q9UKK3 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC29.51■■■□□ 2.32
PARP4Q9UKK3 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
PARP4Q9UKK3 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms