Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKI2

CDC42EP3, Cdc42 effector protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP3Q9UKI2 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDC42EP3Q9UKI2 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDC42EP3Q9UKI2 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDC42EP3Q9UKI2 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDC42EP3Q9UKI2 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDC42EP3Q9UKI2 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDC42EP3Q9UKI2 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDC42EP3Q9UKI2 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDC42EP3Q9UKI2 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDC42EP3Q9UKI2 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDC42EP3Q9UKI2 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDC42EP3Q9UKI2 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDC42EP3Q9UKI2 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDC42EP3Q9UKI2 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDC42EP3Q9UKI2 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDC42EP3Q9UKI2 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDC42EP3Q9UKI2 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDC42EP3Q9UKI2 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDC42EP3Q9UKI2 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDC42EP3Q9UKI2 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDC42EP3Q9UKI2 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDC42EP3Q9UKI2 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CDC42EP3Q9UKI2 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDC42EP3Q9UKI2 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDC42EP3Q9UKI2 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDC42EP3Q9UKI2 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CDC42EP3Q9UKI2 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CDC42EP3Q9UKI2 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CDC42EP3Q9UKI2 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CDC42EP3Q9UKI2 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDC42EP3Q9UKI2 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDC42EP3Q9UKI2 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDC42EP3Q9UKI2 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDC42EP3Q9UKI2 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
CDC42EP3Q9UKI2 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDC42EP3Q9UKI2 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDC42EP3Q9UKI2 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDC42EP3Q9UKI2 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDC42EP3Q9UKI2 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDC42EP3Q9UKI2 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDC42EP3Q9UKI2 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CDC42EP3Q9UKI2 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDC42EP3Q9UKI2 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDC42EP3Q9UKI2 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDC42EP3Q9UKI2 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDC42EP3Q9UKI2 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDC42EP3Q9UKI2 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDC42EP3Q9UKI2 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CDC42EP3Q9UKI2 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDC42EP3Q9UKI2 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CDC42EP3Q9UKI2 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDC42EP3Q9UKI2 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDC42EP3Q9UKI2 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDC42EP3Q9UKI2 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDC42EP3Q9UKI2 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDC42EP3Q9UKI2 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDC42EP3Q9UKI2 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDC42EP3Q9UKI2 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDC42EP3Q9UKI2 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDC42EP3Q9UKI2 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDC42EP3Q9UKI2 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDC42EP3Q9UKI2 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDC42EP3Q9UKI2 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDC42EP3Q9UKI2 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDC42EP3Q9UKI2 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDC42EP3Q9UKI2 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDC42EP3Q9UKI2 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDC42EP3Q9UKI2 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDC42EP3Q9UKI2 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDC42EP3Q9UKI2 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDC42EP3Q9UKI2 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDC42EP3Q9UKI2 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CDC42EP3Q9UKI2 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDC42EP3Q9UKI2 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDC42EP3Q9UKI2 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDC42EP3Q9UKI2 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDC42EP3Q9UKI2 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDC42EP3Q9UKI2 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDC42EP3Q9UKI2 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDC42EP3Q9UKI2 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDC42EP3Q9UKI2 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDC42EP3Q9UKI2 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDC42EP3Q9UKI2 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDC42EP3Q9UKI2 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDC42EP3Q9UKI2 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDC42EP3Q9UKI2 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDC42EP3Q9UKI2 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDC42EP3Q9UKI2 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDC42EP3Q9UKI2 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDC42EP3Q9UKI2 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDC42EP3Q9UKI2 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDC42EP3Q9UKI2 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDC42EP3Q9UKI2 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CDC42EP3Q9UKI2 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDC42EP3Q9UKI2 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDC42EP3Q9UKI2 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDC42EP3Q9UKI2 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDC42EP3Q9UKI2 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDC42EP3Q9UKI2 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CDC42EP3Q9UKI2 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms