Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK00

C3orf18, Uncharacterized protein C3orf18, humanhuman

Predictions only

Length 162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C3orf18Q9UK00 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
C3orf18Q9UK00 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
C3orf18Q9UK00 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
C3orf18Q9UK00 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
C3orf18Q9UK00 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
C3orf18Q9UK00 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C3orf18Q9UK00 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C3orf18Q9UK00 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
C3orf18Q9UK00 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C3orf18Q9UK00 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
C3orf18Q9UK00 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
C3orf18Q9UK00 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C3orf18Q9UK00 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
C3orf18Q9UK00 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
C3orf18Q9UK00 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
C3orf18Q9UK00 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
C3orf18Q9UK00 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C3orf18Q9UK00 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C3orf18Q9UK00 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C3orf18Q9UK00 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C3orf18Q9UK00 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C3orf18Q9UK00 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C3orf18Q9UK00 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
C3orf18Q9UK00 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
C3orf18Q9UK00 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C3orf18Q9UK00 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C3orf18Q9UK00 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C3orf18Q9UK00 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
C3orf18Q9UK00 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C3orf18Q9UK00 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
C3orf18Q9UK00 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
C3orf18Q9UK00 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C3orf18Q9UK00 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
C3orf18Q9UK00 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
C3orf18Q9UK00 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C3orf18Q9UK00 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C3orf18Q9UK00 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C3orf18Q9UK00 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C3orf18Q9UK00 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C3orf18Q9UK00 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C3orf18Q9UK00 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
C3orf18Q9UK00 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C3orf18Q9UK00 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
C3orf18Q9UK00 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C3orf18Q9UK00 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C3orf18Q9UK00 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C3orf18Q9UK00 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C3orf18Q9UK00 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
C3orf18Q9UK00 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
C3orf18Q9UK00 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C3orf18Q9UK00 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
C3orf18Q9UK00 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
C3orf18Q9UK00 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C3orf18Q9UK00 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C3orf18Q9UK00 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C3orf18Q9UK00 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
C3orf18Q9UK00 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C3orf18Q9UK00 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
C3orf18Q9UK00 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
C3orf18Q9UK00 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
C3orf18Q9UK00 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
C3orf18Q9UK00 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C3orf18Q9UK00 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C3orf18Q9UK00 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C3orf18Q9UK00 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
C3orf18Q9UK00 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
C3orf18Q9UK00 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C3orf18Q9UK00 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
C3orf18Q9UK00 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
C3orf18Q9UK00 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
C3orf18Q9UK00 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
C3orf18Q9UK00 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
C3orf18Q9UK00 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
C3orf18Q9UK00 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
C3orf18Q9UK00 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
C3orf18Q9UK00 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
C3orf18Q9UK00 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
C3orf18Q9UK00 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
C3orf18Q9UK00 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
C3orf18Q9UK00 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
C3orf18Q9UK00 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C3orf18Q9UK00 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C3orf18Q9UK00 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.32■■□□□ 1
C3orf18Q9UK00 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C3orf18Q9UK00 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C3orf18Q9UK00 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C3orf18Q9UK00 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
C3orf18Q9UK00 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
C3orf18Q9UK00 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C3orf18Q9UK00 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
C3orf18Q9UK00 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C3orf18Q9UK00 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C3orf18Q9UK00 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C3orf18Q9UK00 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C3orf18Q9UK00 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
C3orf18Q9UK00 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C3orf18Q9UK00 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C3orf18Q9UK00 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
C3orf18Q9UK00 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C3orf18Q9UK00 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms