Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJA2

CRLS1, Cardiolipin synthase (CMP-forming), humanhuman

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRLS1Q9UJA2 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CRLS1Q9UJA2 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CRLS1Q9UJA2 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CRLS1Q9UJA2 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CRLS1Q9UJA2 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CRLS1Q9UJA2 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CRLS1Q9UJA2 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CRLS1Q9UJA2 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CRLS1Q9UJA2 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CRLS1Q9UJA2 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CRLS1Q9UJA2 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CRLS1Q9UJA2 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CRLS1Q9UJA2 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CRLS1Q9UJA2 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CRLS1Q9UJA2 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CRLS1Q9UJA2 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CRLS1Q9UJA2 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CRLS1Q9UJA2 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CRLS1Q9UJA2 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CRLS1Q9UJA2 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CRLS1Q9UJA2 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CRLS1Q9UJA2 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CRLS1Q9UJA2 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CRLS1Q9UJA2 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CRLS1Q9UJA2 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CRLS1Q9UJA2 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CRLS1Q9UJA2 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CRLS1Q9UJA2 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CRLS1Q9UJA2 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CRLS1Q9UJA2 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CRLS1Q9UJA2 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CRLS1Q9UJA2 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CRLS1Q9UJA2 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CRLS1Q9UJA2 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CRLS1Q9UJA2 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CRLS1Q9UJA2 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CRLS1Q9UJA2 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CRLS1Q9UJA2 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CRLS1Q9UJA2 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CRLS1Q9UJA2 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CRLS1Q9UJA2 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CRLS1Q9UJA2 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CRLS1Q9UJA2 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CRLS1Q9UJA2 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CRLS1Q9UJA2 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CRLS1Q9UJA2 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CRLS1Q9UJA2 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CRLS1Q9UJA2 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CRLS1Q9UJA2 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CRLS1Q9UJA2 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CRLS1Q9UJA2 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CRLS1Q9UJA2 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CRLS1Q9UJA2 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CRLS1Q9UJA2 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CRLS1Q9UJA2 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CRLS1Q9UJA2 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CRLS1Q9UJA2 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CRLS1Q9UJA2 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CRLS1Q9UJA2 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CRLS1Q9UJA2 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CRLS1Q9UJA2 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CRLS1Q9UJA2 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CRLS1Q9UJA2 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CRLS1Q9UJA2 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CRLS1Q9UJA2 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CRLS1Q9UJA2 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CRLS1Q9UJA2 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CRLS1Q9UJA2 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CRLS1Q9UJA2 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CRLS1Q9UJA2 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CRLS1Q9UJA2 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CRLS1Q9UJA2 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CRLS1Q9UJA2 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CRLS1Q9UJA2 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CRLS1Q9UJA2 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CRLS1Q9UJA2 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CRLS1Q9UJA2 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CRLS1Q9UJA2 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CRLS1Q9UJA2 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CRLS1Q9UJA2 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CRLS1Q9UJA2 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CRLS1Q9UJA2 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CRLS1Q9UJA2 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CRLS1Q9UJA2 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CRLS1Q9UJA2 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CRLS1Q9UJA2 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CRLS1Q9UJA2 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CRLS1Q9UJA2 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CRLS1Q9UJA2 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CRLS1Q9UJA2 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CRLS1Q9UJA2 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CRLS1Q9UJA2 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CRLS1Q9UJA2 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CRLS1Q9UJA2 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CRLS1Q9UJA2 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CRLS1Q9UJA2 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CRLS1Q9UJA2 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CRLS1Q9UJA2 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CRLS1Q9UJA2 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CRLS1Q9UJA2 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms