Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH73

EBF1, Transcription factor COE1, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBF1Q9UH73 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EBF1Q9UH73 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EBF1Q9UH73 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EBF1Q9UH73 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EBF1Q9UH73 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EBF1Q9UH73 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EBF1Q9UH73 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EBF1Q9UH73 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EBF1Q9UH73 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EBF1Q9UH73 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EBF1Q9UH73 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EBF1Q9UH73 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EBF1Q9UH73 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EBF1Q9UH73 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EBF1Q9UH73 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
EBF1Q9UH73 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EBF1Q9UH73 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EBF1Q9UH73 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EBF1Q9UH73 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EBF1Q9UH73 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EBF1Q9UH73 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EBF1Q9UH73 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EBF1Q9UH73 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EBF1Q9UH73 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EBF1Q9UH73 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EBF1Q9UH73 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EBF1Q9UH73 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EBF1Q9UH73 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
EBF1Q9UH73 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EBF1Q9UH73 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EBF1Q9UH73 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EBF1Q9UH73 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
EBF1Q9UH73 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
EBF1Q9UH73 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
EBF1Q9UH73 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
EBF1Q9UH73 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
EBF1Q9UH73 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
EBF1Q9UH73 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
EBF1Q9UH73 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
EBF1Q9UH73 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
EBF1Q9UH73 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
EBF1Q9UH73 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
EBF1Q9UH73 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EBF1Q9UH73 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EBF1Q9UH73 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EBF1Q9UH73 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EBF1Q9UH73 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EBF1Q9UH73 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EBF1Q9UH73 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EBF1Q9UH73 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EBF1Q9UH73 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
EBF1Q9UH73 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EBF1Q9UH73 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EBF1Q9UH73 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EBF1Q9UH73 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EBF1Q9UH73 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EBF1Q9UH73 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EBF1Q9UH73 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EBF1Q9UH73 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EBF1Q9UH73 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EBF1Q9UH73 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EBF1Q9UH73 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
EBF1Q9UH73 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EBF1Q9UH73 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EBF1Q9UH73 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
EBF1Q9UH73 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
EBF1Q9UH73 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
EBF1Q9UH73 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EBF1Q9UH73 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
EBF1Q9UH73 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EBF1Q9UH73 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EBF1Q9UH73 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EBF1Q9UH73 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EBF1Q9UH73 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EBF1Q9UH73 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EBF1Q9UH73 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EBF1Q9UH73 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EBF1Q9UH73 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EBF1Q9UH73 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EBF1Q9UH73 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EBF1Q9UH73 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EBF1Q9UH73 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EBF1Q9UH73 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EBF1Q9UH73 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EBF1Q9UH73 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EBF1Q9UH73 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EBF1Q9UH73 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
EBF1Q9UH73 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EBF1Q9UH73 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EBF1Q9UH73 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EBF1Q9UH73 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
EBF1Q9UH73 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
EBF1Q9UH73 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
EBF1Q9UH73 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
EBF1Q9UH73 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
EBF1Q9UH73 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
EBF1Q9UH73 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
EBF1Q9UH73 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
EBF1Q9UH73 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
EBF1Q9UH73 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.1 ms