Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT7

CTNNAL1, Alpha-catulin, humanhuman

Predictions only

Length 734 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNAL1Q9UBT7 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTNNAL1Q9UBT7 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTNNAL1Q9UBT7 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTNNAL1Q9UBT7 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTNNAL1Q9UBT7 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTNNAL1Q9UBT7 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTNNAL1Q9UBT7 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTNNAL1Q9UBT7 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTNNAL1Q9UBT7 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTNNAL1Q9UBT7 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CTNNAL1Q9UBT7 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CTNNAL1Q9UBT7 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CTNNAL1Q9UBT7 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CTNNAL1Q9UBT7 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CTNNAL1Q9UBT7 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CTNNAL1Q9UBT7 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CTNNAL1Q9UBT7 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CTNNAL1Q9UBT7 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CTNNAL1Q9UBT7 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CTNNAL1Q9UBT7 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CTNNAL1Q9UBT7 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CTNNAL1Q9UBT7 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CTNNAL1Q9UBT7 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CTNNAL1Q9UBT7 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
CTNNAL1Q9UBT7 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTNNAL1Q9UBT7 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTNNAL1Q9UBT7 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTNNAL1Q9UBT7 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTNNAL1Q9UBT7 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CTNNAL1Q9UBT7 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CTNNAL1Q9UBT7 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTNNAL1Q9UBT7 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTNNAL1Q9UBT7 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CTNNAL1Q9UBT7 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTNNAL1Q9UBT7 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTNNAL1Q9UBT7 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTNNAL1Q9UBT7 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTNNAL1Q9UBT7 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CTNNAL1Q9UBT7 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTNNAL1Q9UBT7 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CTNNAL1Q9UBT7 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CTNNAL1Q9UBT7 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CTNNAL1Q9UBT7 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CTNNAL1Q9UBT7 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CTNNAL1Q9UBT7 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CTNNAL1Q9UBT7 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CTNNAL1Q9UBT7 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CTNNAL1Q9UBT7 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTNNAL1Q9UBT7 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTNNAL1Q9UBT7 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTNNAL1Q9UBT7 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTNNAL1Q9UBT7 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTNNAL1Q9UBT7 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTNNAL1Q9UBT7 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTNNAL1Q9UBT7 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTNNAL1Q9UBT7 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTNNAL1Q9UBT7 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CTNNAL1Q9UBT7 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTNNAL1Q9UBT7 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTNNAL1Q9UBT7 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CTNNAL1Q9UBT7 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTNNAL1Q9UBT7 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CTNNAL1Q9UBT7 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTNNAL1Q9UBT7 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTNNAL1Q9UBT7 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTNNAL1Q9UBT7 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTNNAL1Q9UBT7 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTNNAL1Q9UBT7 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CTNNAL1Q9UBT7 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTNNAL1Q9UBT7 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTNNAL1Q9UBT7 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTNNAL1Q9UBT7 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTNNAL1Q9UBT7 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CTNNAL1Q9UBT7 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTNNAL1Q9UBT7 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTNNAL1Q9UBT7 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CTNNAL1Q9UBT7 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTNNAL1Q9UBT7 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTNNAL1Q9UBT7 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTNNAL1Q9UBT7 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTNNAL1Q9UBT7 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTNNAL1Q9UBT7 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CTNNAL1Q9UBT7 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
CTNNAL1Q9UBT7 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
CTNNAL1Q9UBT7 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTNNAL1Q9UBT7 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTNNAL1Q9UBT7 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTNNAL1Q9UBT7 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTNNAL1Q9UBT7 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTNNAL1Q9UBT7 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTNNAL1Q9UBT7 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CTNNAL1Q9UBT7 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTNNAL1Q9UBT7 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTNNAL1Q9UBT7 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTNNAL1Q9UBT7 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTNNAL1Q9UBT7 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTNNAL1Q9UBT7 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTNNAL1Q9UBT7 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTNNAL1Q9UBT7 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CTNNAL1Q9UBT7 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms