Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K6

KLHL42, Kelch-like protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL42Q9P2K6 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KLHL42Q9P2K6 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KLHL42Q9P2K6 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
KLHL42Q9P2K6 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KLHL42Q9P2K6 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KLHL42Q9P2K6 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KLHL42Q9P2K6 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
KLHL42Q9P2K6 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
KLHL42Q9P2K6 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
KLHL42Q9P2K6 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
KLHL42Q9P2K6 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KLHL42Q9P2K6 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KLHL42Q9P2K6 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
KLHL42Q9P2K6 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KLHL42Q9P2K6 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
KLHL42Q9P2K6 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
KLHL42Q9P2K6 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
KLHL42Q9P2K6 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
KLHL42Q9P2K6 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KLHL42Q9P2K6 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
KLHL42Q9P2K6 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KLHL42Q9P2K6 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
KLHL42Q9P2K6 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
KLHL42Q9P2K6 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KLHL42Q9P2K6 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KLHL42Q9P2K6 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KLHL42Q9P2K6 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
KLHL42Q9P2K6 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KLHL42Q9P2K6 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KLHL42Q9P2K6 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
KLHL42Q9P2K6 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
KLHL42Q9P2K6 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
KLHL42Q9P2K6 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
KLHL42Q9P2K6 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KLHL42Q9P2K6 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KLHL42Q9P2K6 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KLHL42Q9P2K6 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
KLHL42Q9P2K6 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
KLHL42Q9P2K6 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KLHL42Q9P2K6 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
KLHL42Q9P2K6 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
KLHL42Q9P2K6 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
KLHL42Q9P2K6 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KLHL42Q9P2K6 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
KLHL42Q9P2K6 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KLHL42Q9P2K6 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
KLHL42Q9P2K6 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KLHL42Q9P2K6 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
KLHL42Q9P2K6 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KLHL42Q9P2K6 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KLHL42Q9P2K6 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
KLHL42Q9P2K6 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
KLHL42Q9P2K6 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
KLHL42Q9P2K6 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
KLHL42Q9P2K6 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KLHL42Q9P2K6 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KLHL42Q9P2K6 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
KLHL42Q9P2K6 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
KLHL42Q9P2K6 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
KLHL42Q9P2K6 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
KLHL42Q9P2K6 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
KLHL42Q9P2K6 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KLHL42Q9P2K6 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KLHL42Q9P2K6 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KLHL42Q9P2K6 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
KLHL42Q9P2K6 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KLHL42Q9P2K6 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KLHL42Q9P2K6 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KLHL42Q9P2K6 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KLHL42Q9P2K6 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KLHL42Q9P2K6 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KLHL42Q9P2K6 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
KLHL42Q9P2K6 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
KLHL42Q9P2K6 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KLHL42Q9P2K6 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
KLHL42Q9P2K6 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KLHL42Q9P2K6 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
KLHL42Q9P2K6 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
KLHL42Q9P2K6 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KLHL42Q9P2K6 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KLHL42Q9P2K6 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KLHL42Q9P2K6 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
KLHL42Q9P2K6 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KLHL42Q9P2K6 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KLHL42Q9P2K6 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KLHL42Q9P2K6 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KLHL42Q9P2K6 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
KLHL42Q9P2K6 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
KLHL42Q9P2K6 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
KLHL42Q9P2K6 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KLHL42Q9P2K6 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KLHL42Q9P2K6 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
KLHL42Q9P2K6 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
KLHL42Q9P2K6 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
KLHL42Q9P2K6 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
KLHL42Q9P2K6 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KLHL42Q9P2K6 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
KLHL42Q9P2K6 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KLHL42Q9P2K6 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
KLHL42Q9P2K6 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms