Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K3

RCOR3, REST corepressor 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCOR3Q9P2K3 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
RCOR3Q9P2K3 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RCOR3Q9P2K3 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RCOR3Q9P2K3 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RCOR3Q9P2K3 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RCOR3Q9P2K3 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RCOR3Q9P2K3 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RCOR3Q9P2K3 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RCOR3Q9P2K3 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RCOR3Q9P2K3 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RCOR3Q9P2K3 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RCOR3Q9P2K3 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RCOR3Q9P2K3 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RCOR3Q9P2K3 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RCOR3Q9P2K3 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
RCOR3Q9P2K3 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
RCOR3Q9P2K3 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RCOR3Q9P2K3 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RCOR3Q9P2K3 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RCOR3Q9P2K3 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RCOR3Q9P2K3 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RCOR3Q9P2K3 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RCOR3Q9P2K3 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RCOR3Q9P2K3 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RCOR3Q9P2K3 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RCOR3Q9P2K3 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RCOR3Q9P2K3 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RCOR3Q9P2K3 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RCOR3Q9P2K3 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RCOR3Q9P2K3 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RCOR3Q9P2K3 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RCOR3Q9P2K3 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RCOR3Q9P2K3 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RCOR3Q9P2K3 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RCOR3Q9P2K3 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RCOR3Q9P2K3 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RCOR3Q9P2K3 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RCOR3Q9P2K3 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RCOR3Q9P2K3 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RCOR3Q9P2K3 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RCOR3Q9P2K3 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RCOR3Q9P2K3 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RCOR3Q9P2K3 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RCOR3Q9P2K3 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RCOR3Q9P2K3 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RCOR3Q9P2K3 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RCOR3Q9P2K3 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RCOR3Q9P2K3 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RCOR3Q9P2K3 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RCOR3Q9P2K3 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RCOR3Q9P2K3 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RCOR3Q9P2K3 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RCOR3Q9P2K3 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RCOR3Q9P2K3 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RCOR3Q9P2K3 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RCOR3Q9P2K3 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RCOR3Q9P2K3 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RCOR3Q9P2K3 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RCOR3Q9P2K3 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RCOR3Q9P2K3 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RCOR3Q9P2K3 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RCOR3Q9P2K3 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RCOR3Q9P2K3 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RCOR3Q9P2K3 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RCOR3Q9P2K3 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RCOR3Q9P2K3 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RCOR3Q9P2K3 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RCOR3Q9P2K3 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RCOR3Q9P2K3 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RCOR3Q9P2K3 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RCOR3Q9P2K3 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RCOR3Q9P2K3 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RCOR3Q9P2K3 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RCOR3Q9P2K3 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RCOR3Q9P2K3 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RCOR3Q9P2K3 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RCOR3Q9P2K3 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RCOR3Q9P2K3 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RCOR3Q9P2K3 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RCOR3Q9P2K3 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RCOR3Q9P2K3 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RCOR3Q9P2K3 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RCOR3Q9P2K3 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
RCOR3Q9P2K3 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RCOR3Q9P2K3 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RCOR3Q9P2K3 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RCOR3Q9P2K3 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
RCOR3Q9P2K3 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RCOR3Q9P2K3 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RCOR3Q9P2K3 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RCOR3Q9P2K3 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RCOR3Q9P2K3 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RCOR3Q9P2K3 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
RCOR3Q9P2K3 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RCOR3Q9P2K3 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RCOR3Q9P2K3 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RCOR3Q9P2K3 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
RCOR3Q9P2K3 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RCOR3Q9P2K3 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RCOR3Q9P2K3 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms