Protein–RNA interactions for Protein: Q9P219

CCDC88C, Protein Daple, humanhuman

Predictions only

Length 2,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC88CQ9P219 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC88CQ9P219 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC88CQ9P219 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC88CQ9P219 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC88CQ9P219 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC88CQ9P219 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC88CQ9P219 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC88CQ9P219 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC88CQ9P219 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC88CQ9P219 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC88CQ9P219 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC88CQ9P219 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC88CQ9P219 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC88CQ9P219 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC88CQ9P219 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC88CQ9P219 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC88CQ9P219 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC88CQ9P219 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC88CQ9P219 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC88CQ9P219 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC88CQ9P219 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC88CQ9P219 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC88CQ9P219 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC88CQ9P219 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC88CQ9P219 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
CCDC88CQ9P219 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC88CQ9P219 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC88CQ9P219 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC88CQ9P219 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC88CQ9P219 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC88CQ9P219 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC88CQ9P219 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC88CQ9P219 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC88CQ9P219 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC88CQ9P219 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC88CQ9P219 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC88CQ9P219 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC88CQ9P219 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC88CQ9P219 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC88CQ9P219 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC88CQ9P219 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC88CQ9P219 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC88CQ9P219 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC88CQ9P219 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC88CQ9P219 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC88CQ9P219 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC88CQ9P219 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC88CQ9P219 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC88CQ9P219 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC88CQ9P219 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC88CQ9P219 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC88CQ9P219 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC88CQ9P219 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC88CQ9P219 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC88CQ9P219 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC88CQ9P219 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC88CQ9P219 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC88CQ9P219 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC88CQ9P219 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC88CQ9P219 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC88CQ9P219 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC88CQ9P219 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC88CQ9P219 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC88CQ9P219 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC88CQ9P219 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC88CQ9P219 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC88CQ9P219 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC88CQ9P219 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC88CQ9P219 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC88CQ9P219 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC88CQ9P219 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC88CQ9P219 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC88CQ9P219 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC88CQ9P219 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC88CQ9P219 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC88CQ9P219 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC88CQ9P219 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC88CQ9P219 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC88CQ9P219 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC88CQ9P219 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC88CQ9P219 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC88CQ9P219 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC88CQ9P219 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC88CQ9P219 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC88CQ9P219 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC88CQ9P219 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC88CQ9P219 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC88CQ9P219 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC88CQ9P219 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC88CQ9P219 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC88CQ9P219 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC88CQ9P219 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC88CQ9P219 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC88CQ9P219 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC88CQ9P219 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC88CQ9P219 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC88CQ9P219 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC88CQ9P219 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC88CQ9P219 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC88CQ9P219 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms