Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W0

IFNK, Interferon kappa, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNKQ9P0W0 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
IFNKQ9P0W0 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
IFNKQ9P0W0 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
IFNKQ9P0W0 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
IFNKQ9P0W0 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
IFNKQ9P0W0 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
IFNKQ9P0W0 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
IFNKQ9P0W0 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
IFNKQ9P0W0 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
IFNKQ9P0W0 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
IFNKQ9P0W0 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
IFNKQ9P0W0 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
IFNKQ9P0W0 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
IFNKQ9P0W0 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
IFNKQ9P0W0 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
IFNKQ9P0W0 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
IFNKQ9P0W0 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
IFNKQ9P0W0 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
IFNKQ9P0W0 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
IFNKQ9P0W0 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
IFNKQ9P0W0 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
IFNKQ9P0W0 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
IFNKQ9P0W0 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
IFNKQ9P0W0 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
IFNKQ9P0W0 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
IFNKQ9P0W0 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
IFNKQ9P0W0 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
IFNKQ9P0W0 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
IFNKQ9P0W0 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
IFNKQ9P0W0 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
IFNKQ9P0W0 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
IFNKQ9P0W0 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
IFNKQ9P0W0 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
IFNKQ9P0W0 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
IFNKQ9P0W0 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
IFNKQ9P0W0 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
IFNKQ9P0W0 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
IFNKQ9P0W0 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
IFNKQ9P0W0 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
IFNKQ9P0W0 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
IFNKQ9P0W0 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
IFNKQ9P0W0 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
IFNKQ9P0W0 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
IFNKQ9P0W0 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
IFNKQ9P0W0 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
IFNKQ9P0W0 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
IFNKQ9P0W0 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
IFNKQ9P0W0 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
IFNKQ9P0W0 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
IFNKQ9P0W0 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
IFNKQ9P0W0 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
IFNKQ9P0W0 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
IFNKQ9P0W0 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
IFNKQ9P0W0 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
IFNKQ9P0W0 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
IFNKQ9P0W0 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
IFNKQ9P0W0 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
IFNKQ9P0W0 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
IFNKQ9P0W0 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
IFNKQ9P0W0 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
IFNKQ9P0W0 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
IFNKQ9P0W0 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
IFNKQ9P0W0 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
IFNKQ9P0W0 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
IFNKQ9P0W0 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
IFNKQ9P0W0 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
IFNKQ9P0W0 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
IFNKQ9P0W0 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
IFNKQ9P0W0 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
IFNKQ9P0W0 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
IFNKQ9P0W0 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
IFNKQ9P0W0 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
IFNKQ9P0W0 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
IFNKQ9P0W0 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
IFNKQ9P0W0 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
IFNKQ9P0W0 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
IFNKQ9P0W0 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
IFNKQ9P0W0 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
IFNKQ9P0W0 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
IFNKQ9P0W0 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
IFNKQ9P0W0 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
IFNKQ9P0W0 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
IFNKQ9P0W0 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
IFNKQ9P0W0 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
IFNKQ9P0W0 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
IFNKQ9P0W0 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
IFNKQ9P0W0 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
IFNKQ9P0W0 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
IFNKQ9P0W0 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
IFNKQ9P0W0 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
IFNKQ9P0W0 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
IFNKQ9P0W0 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
IFNKQ9P0W0 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
IFNKQ9P0W0 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
IFNKQ9P0W0 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
IFNKQ9P0W0 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
IFNKQ9P0W0 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
IFNKQ9P0W0 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
IFNKQ9P0W0 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
IFNKQ9P0W0 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms