Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0J7

KCMF1, E3 ubiquitin-protein ligase KCMF1, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCMF1Q9P0J7 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
KCMF1Q9P0J7 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
KCMF1Q9P0J7 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
KCMF1Q9P0J7 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
KCMF1Q9P0J7 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
KCMF1Q9P0J7 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
KCMF1Q9P0J7 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
KCMF1Q9P0J7 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
KCMF1Q9P0J7 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KCMF1Q9P0J7 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KCMF1Q9P0J7 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KCMF1Q9P0J7 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
KCMF1Q9P0J7 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
KCMF1Q9P0J7 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KCMF1Q9P0J7 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KCMF1Q9P0J7 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KCMF1Q9P0J7 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
KCMF1Q9P0J7 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KCMF1Q9P0J7 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
KCMF1Q9P0J7 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
KCMF1Q9P0J7 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KCMF1Q9P0J7 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KCMF1Q9P0J7 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
KCMF1Q9P0J7 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
KCMF1Q9P0J7 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
KCMF1Q9P0J7 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KCMF1Q9P0J7 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
KCMF1Q9P0J7 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KCMF1Q9P0J7 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
KCMF1Q9P0J7 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
KCMF1Q9P0J7 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
KCMF1Q9P0J7 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
KCMF1Q9P0J7 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
KCMF1Q9P0J7 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KCMF1Q9P0J7 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
KCMF1Q9P0J7 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
KCMF1Q9P0J7 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
KCMF1Q9P0J7 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
KCMF1Q9P0J7 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
KCMF1Q9P0J7 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
KCMF1Q9P0J7 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
KCMF1Q9P0J7 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
KCMF1Q9P0J7 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
KCMF1Q9P0J7 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
KCMF1Q9P0J7 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
KCMF1Q9P0J7 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
KCMF1Q9P0J7 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
KCMF1Q9P0J7 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
KCMF1Q9P0J7 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
KCMF1Q9P0J7 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
KCMF1Q9P0J7 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
KCMF1Q9P0J7 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
KCMF1Q9P0J7 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
KCMF1Q9P0J7 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.01■□□□□ 0.95
KCMF1Q9P0J7 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
KCMF1Q9P0J7 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
KCMF1Q9P0J7 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
KCMF1Q9P0J7 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
KCMF1Q9P0J7 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
KCMF1Q9P0J7 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
KCMF1Q9P0J7 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
KCMF1Q9P0J7 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
KCMF1Q9P0J7 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
KCMF1Q9P0J7 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
KCMF1Q9P0J7 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21■□□□□ 0.95
KCMF1Q9P0J7 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
KCMF1Q9P0J7 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
KCMF1Q9P0J7 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
KCMF1Q9P0J7 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
KCMF1Q9P0J7 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
KCMF1Q9P0J7 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
KCMF1Q9P0J7 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
KCMF1Q9P0J7 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
KCMF1Q9P0J7 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
KCMF1Q9P0J7 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
KCMF1Q9P0J7 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
KCMF1Q9P0J7 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
KCMF1Q9P0J7 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
KCMF1Q9P0J7 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
KCMF1Q9P0J7 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
KCMF1Q9P0J7 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
KCMF1Q9P0J7 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
KCMF1Q9P0J7 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
KCMF1Q9P0J7 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
KCMF1Q9P0J7 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
KCMF1Q9P0J7 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
KCMF1Q9P0J7 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
KCMF1Q9P0J7 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
KCMF1Q9P0J7 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
KCMF1Q9P0J7 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
KCMF1Q9P0J7 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
KCMF1Q9P0J7 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
KCMF1Q9P0J7 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
KCMF1Q9P0J7 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
KCMF1Q9P0J7 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
KCMF1Q9P0J7 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
KCMF1Q9P0J7 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
KCMF1Q9P0J7 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
KCMF1Q9P0J7 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
KCMF1Q9P0J7 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms