Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZU1

FLRT1, Leucine-rich repeat transmembrane protein FLRT1, humanhuman

Predictions only

Length 646 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FLRT1Q9NZU1 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FLRT1Q9NZU1 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FLRT1Q9NZU1 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FLRT1Q9NZU1 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FLRT1Q9NZU1 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FLRT1Q9NZU1 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FLRT1Q9NZU1 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FLRT1Q9NZU1 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FLRT1Q9NZU1 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
FLRT1Q9NZU1 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FLRT1Q9NZU1 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FLRT1Q9NZU1 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FLRT1Q9NZU1 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
FLRT1Q9NZU1 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FLRT1Q9NZU1 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
FLRT1Q9NZU1 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
FLRT1Q9NZU1 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FLRT1Q9NZU1 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FLRT1Q9NZU1 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FLRT1Q9NZU1 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
FLRT1Q9NZU1 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
FLRT1Q9NZU1 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
FLRT1Q9NZU1 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
FLRT1Q9NZU1 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
FLRT1Q9NZU1 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
FLRT1Q9NZU1 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FLRT1Q9NZU1 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FLRT1Q9NZU1 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FLRT1Q9NZU1 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FLRT1Q9NZU1 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
FLRT1Q9NZU1 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
FLRT1Q9NZU1 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FLRT1Q9NZU1 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
FLRT1Q9NZU1 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
FLRT1Q9NZU1 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FLRT1Q9NZU1 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FLRT1Q9NZU1 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
FLRT1Q9NZU1 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FLRT1Q9NZU1 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
FLRT1Q9NZU1 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
FLRT1Q9NZU1 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
FLRT1Q9NZU1 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FLRT1Q9NZU1 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FLRT1Q9NZU1 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
FLRT1Q9NZU1 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
FLRT1Q9NZU1 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FLRT1Q9NZU1 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FLRT1Q9NZU1 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FLRT1Q9NZU1 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FLRT1Q9NZU1 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FLRT1Q9NZU1 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FLRT1Q9NZU1 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FLRT1Q9NZU1 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FLRT1Q9NZU1 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
FLRT1Q9NZU1 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FLRT1Q9NZU1 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FLRT1Q9NZU1 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FLRT1Q9NZU1 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FLRT1Q9NZU1 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FLRT1Q9NZU1 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FLRT1Q9NZU1 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FLRT1Q9NZU1 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FLRT1Q9NZU1 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
FLRT1Q9NZU1 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
FLRT1Q9NZU1 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FLRT1Q9NZU1 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
FLRT1Q9NZU1 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FLRT1Q9NZU1 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FLRT1Q9NZU1 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
FLRT1Q9NZU1 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
FLRT1Q9NZU1 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
FLRT1Q9NZU1 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
FLRT1Q9NZU1 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
FLRT1Q9NZU1 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FLRT1Q9NZU1 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FLRT1Q9NZU1 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
FLRT1Q9NZU1 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FLRT1Q9NZU1 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FLRT1Q9NZU1 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FLRT1Q9NZU1 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
FLRT1Q9NZU1 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
FLRT1Q9NZU1 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
FLRT1Q9NZU1 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
FLRT1Q9NZU1 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
FLRT1Q9NZU1 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
FLRT1Q9NZU1 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
FLRT1Q9NZU1 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
FLRT1Q9NZU1 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
FLRT1Q9NZU1 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
FLRT1Q9NZU1 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
FLRT1Q9NZU1 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
FLRT1Q9NZU1 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
FLRT1Q9NZU1 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
FLRT1Q9NZU1 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
FLRT1Q9NZU1 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
FLRT1Q9NZU1 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FLRT1Q9NZU1 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
FLRT1Q9NZU1 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
FLRT1Q9NZU1 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
FLRT1Q9NZU1 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms