Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ71

RTEL1, Regulator of telomere elongation helicase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1Q9NZ71 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RTEL1Q9NZ71 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RTEL1Q9NZ71 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RTEL1Q9NZ71 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
RTEL1Q9NZ71 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
RTEL1Q9NZ71 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
RTEL1Q9NZ71 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
RTEL1Q9NZ71 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.72
RTEL1Q9NZ71 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC25.83■■□□□ 1.72
RTEL1Q9NZ71 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RTEL1Q9NZ71 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RTEL1Q9NZ71 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RTEL1Q9NZ71 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RTEL1Q9NZ71 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RTEL1Q9NZ71 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RTEL1Q9NZ71 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RTEL1Q9NZ71 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RTEL1Q9NZ71 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RTEL1Q9NZ71 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RTEL1Q9NZ71 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RTEL1Q9NZ71 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RTEL1Q9NZ71 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RTEL1Q9NZ71 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RTEL1Q9NZ71 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RTEL1Q9NZ71 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RTEL1Q9NZ71 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RTEL1Q9NZ71 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RTEL1Q9NZ71 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RTEL1Q9NZ71 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RTEL1Q9NZ71 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RTEL1Q9NZ71 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
RTEL1Q9NZ71 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RTEL1Q9NZ71 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RTEL1Q9NZ71 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RTEL1Q9NZ71 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RTEL1Q9NZ71 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RTEL1Q9NZ71 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RTEL1Q9NZ71 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RTEL1Q9NZ71 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RTEL1Q9NZ71 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
RTEL1Q9NZ71 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RTEL1Q9NZ71 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RTEL1Q9NZ71 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RTEL1Q9NZ71 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
RTEL1Q9NZ71 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RTEL1Q9NZ71 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RTEL1Q9NZ71 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RTEL1Q9NZ71 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RTEL1Q9NZ71 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RTEL1Q9NZ71 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RTEL1Q9NZ71 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RTEL1Q9NZ71 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RTEL1Q9NZ71 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RTEL1Q9NZ71 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
RTEL1Q9NZ71 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RTEL1Q9NZ71 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RTEL1Q9NZ71 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RTEL1Q9NZ71 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RTEL1Q9NZ71 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RTEL1Q9NZ71 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
RTEL1Q9NZ71 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RTEL1Q9NZ71 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
RTEL1Q9NZ71 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RTEL1Q9NZ71 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RTEL1Q9NZ71 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RTEL1Q9NZ71 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RTEL1Q9NZ71 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
RTEL1Q9NZ71 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
RTEL1Q9NZ71 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RTEL1Q9NZ71 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RTEL1Q9NZ71 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RTEL1Q9NZ71 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RTEL1Q9NZ71 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RTEL1Q9NZ71 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RTEL1Q9NZ71 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RTEL1Q9NZ71 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RTEL1Q9NZ71 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RTEL1Q9NZ71 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RTEL1Q9NZ71 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RTEL1Q9NZ71 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RTEL1Q9NZ71 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RTEL1Q9NZ71 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RTEL1Q9NZ71 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RTEL1Q9NZ71 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RTEL1Q9NZ71 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RTEL1Q9NZ71 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RTEL1Q9NZ71 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RTEL1Q9NZ71 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RTEL1Q9NZ71 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RTEL1Q9NZ71 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RTEL1Q9NZ71 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
RTEL1Q9NZ71 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RTEL1Q9NZ71 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RTEL1Q9NZ71 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RTEL1Q9NZ71 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RTEL1Q9NZ71 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RTEL1Q9NZ71 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RTEL1Q9NZ71 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RTEL1Q9NZ71 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RTEL1Q9NZ71 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms