Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ53

PODXL2, Podocalyxin-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PODXL2Q9NZ53 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PODXL2Q9NZ53 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PODXL2Q9NZ53 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PODXL2Q9NZ53 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
PODXL2Q9NZ53 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PODXL2Q9NZ53 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PODXL2Q9NZ53 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
PODXL2Q9NZ53 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PODXL2Q9NZ53 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PODXL2Q9NZ53 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PODXL2Q9NZ53 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PODXL2Q9NZ53 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PODXL2Q9NZ53 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PODXL2Q9NZ53 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PODXL2Q9NZ53 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PODXL2Q9NZ53 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PODXL2Q9NZ53 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PODXL2Q9NZ53 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
PODXL2Q9NZ53 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PODXL2Q9NZ53 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PODXL2Q9NZ53 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PODXL2Q9NZ53 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PODXL2Q9NZ53 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
PODXL2Q9NZ53 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
PODXL2Q9NZ53 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PODXL2Q9NZ53 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PODXL2Q9NZ53 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PODXL2Q9NZ53 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PODXL2Q9NZ53 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PODXL2Q9NZ53 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PODXL2Q9NZ53 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PODXL2Q9NZ53 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PODXL2Q9NZ53 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PODXL2Q9NZ53 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PODXL2Q9NZ53 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PODXL2Q9NZ53 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PODXL2Q9NZ53 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PODXL2Q9NZ53 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PODXL2Q9NZ53 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PODXL2Q9NZ53 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PODXL2Q9NZ53 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PODXL2Q9NZ53 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
PODXL2Q9NZ53 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PODXL2Q9NZ53 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
PODXL2Q9NZ53 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PODXL2Q9NZ53 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PODXL2Q9NZ53 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PODXL2Q9NZ53 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PODXL2Q9NZ53 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PODXL2Q9NZ53 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PODXL2Q9NZ53 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PODXL2Q9NZ53 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PODXL2Q9NZ53 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PODXL2Q9NZ53 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PODXL2Q9NZ53 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PODXL2Q9NZ53 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PODXL2Q9NZ53 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PODXL2Q9NZ53 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PODXL2Q9NZ53 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PODXL2Q9NZ53 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PODXL2Q9NZ53 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PODXL2Q9NZ53 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PODXL2Q9NZ53 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
PODXL2Q9NZ53 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PODXL2Q9NZ53 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PODXL2Q9NZ53 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PODXL2Q9NZ53 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PODXL2Q9NZ53 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PODXL2Q9NZ53 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PODXL2Q9NZ53 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PODXL2Q9NZ53 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PODXL2Q9NZ53 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PODXL2Q9NZ53 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PODXL2Q9NZ53 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PODXL2Q9NZ53 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PODXL2Q9NZ53 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PODXL2Q9NZ53 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PODXL2Q9NZ53 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PODXL2Q9NZ53 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
PODXL2Q9NZ53 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PODXL2Q9NZ53 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PODXL2Q9NZ53 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PODXL2Q9NZ53 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PODXL2Q9NZ53 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PODXL2Q9NZ53 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PODXL2Q9NZ53 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PODXL2Q9NZ53 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
PODXL2Q9NZ53 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PODXL2Q9NZ53 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PODXL2Q9NZ53 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PODXL2Q9NZ53 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PODXL2Q9NZ53 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PODXL2Q9NZ53 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PODXL2Q9NZ53 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PODXL2Q9NZ53 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PODXL2Q9NZ53 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PODXL2Q9NZ53 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PODXL2Q9NZ53 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PODXL2Q9NZ53 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PODXL2Q9NZ53 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms