Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYJ7

DLL3, Delta-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 618 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DLL3Q9NYJ7 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
DLL3Q9NYJ7 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
DLL3Q9NYJ7 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DLL3Q9NYJ7 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DLL3Q9NYJ7 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DLL3Q9NYJ7 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
DLL3Q9NYJ7 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
DLL3Q9NYJ7 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
DLL3Q9NYJ7 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
DLL3Q9NYJ7 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DLL3Q9NYJ7 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DLL3Q9NYJ7 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DLL3Q9NYJ7 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
DLL3Q9NYJ7 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DLL3Q9NYJ7 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DLL3Q9NYJ7 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DLL3Q9NYJ7 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
DLL3Q9NYJ7 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DLL3Q9NYJ7 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
DLL3Q9NYJ7 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
DLL3Q9NYJ7 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
DLL3Q9NYJ7 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DLL3Q9NYJ7 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
DLL3Q9NYJ7 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DLL3Q9NYJ7 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
DLL3Q9NYJ7 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DLL3Q9NYJ7 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DLL3Q9NYJ7 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DLL3Q9NYJ7 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DLL3Q9NYJ7 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DLL3Q9NYJ7 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
DLL3Q9NYJ7 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DLL3Q9NYJ7 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
DLL3Q9NYJ7 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DLL3Q9NYJ7 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DLL3Q9NYJ7 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
DLL3Q9NYJ7 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
DLL3Q9NYJ7 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
DLL3Q9NYJ7 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DLL3Q9NYJ7 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
DLL3Q9NYJ7 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DLL3Q9NYJ7 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
DLL3Q9NYJ7 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
DLL3Q9NYJ7 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
DLL3Q9NYJ7 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DLL3Q9NYJ7 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DLL3Q9NYJ7 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
DLL3Q9NYJ7 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DLL3Q9NYJ7 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
DLL3Q9NYJ7 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DLL3Q9NYJ7 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DLL3Q9NYJ7 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
DLL3Q9NYJ7 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
DLL3Q9NYJ7 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
DLL3Q9NYJ7 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
DLL3Q9NYJ7 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DLL3Q9NYJ7 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DLL3Q9NYJ7 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
DLL3Q9NYJ7 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
DLL3Q9NYJ7 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DLL3Q9NYJ7 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DLL3Q9NYJ7 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
DLL3Q9NYJ7 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DLL3Q9NYJ7 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DLL3Q9NYJ7 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
DLL3Q9NYJ7 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
DLL3Q9NYJ7 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DLL3Q9NYJ7 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
DLL3Q9NYJ7 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
DLL3Q9NYJ7 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
DLL3Q9NYJ7 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
DLL3Q9NYJ7 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
DLL3Q9NYJ7 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DLL3Q9NYJ7 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
DLL3Q9NYJ7 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DLL3Q9NYJ7 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
DLL3Q9NYJ7 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
DLL3Q9NYJ7 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
DLL3Q9NYJ7 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
DLL3Q9NYJ7 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
DLL3Q9NYJ7 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
DLL3Q9NYJ7 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
DLL3Q9NYJ7 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DLL3Q9NYJ7 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DLL3Q9NYJ7 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
DLL3Q9NYJ7 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
DLL3Q9NYJ7 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DLL3Q9NYJ7 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DLL3Q9NYJ7 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DLL3Q9NYJ7 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
DLL3Q9NYJ7 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DLL3Q9NYJ7 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DLL3Q9NYJ7 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
DLL3Q9NYJ7 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
DLL3Q9NYJ7 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
DLL3Q9NYJ7 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
DLL3Q9NYJ7 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
DLL3Q9NYJ7 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
DLL3Q9NYJ7 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
DLL3Q9NYJ7 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms