Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX76

CMTM6, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM6Q9NX76 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CMTM6Q9NX76 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CMTM6Q9NX76 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CMTM6Q9NX76 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CMTM6Q9NX76 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CMTM6Q9NX76 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CMTM6Q9NX76 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CMTM6Q9NX76 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CMTM6Q9NX76 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CMTM6Q9NX76 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CMTM6Q9NX76 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CMTM6Q9NX76 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CMTM6Q9NX76 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CMTM6Q9NX76 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CMTM6Q9NX76 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CMTM6Q9NX76 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CMTM6Q9NX76 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CMTM6Q9NX76 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CMTM6Q9NX76 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CMTM6Q9NX76 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CMTM6Q9NX76 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CMTM6Q9NX76 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CMTM6Q9NX76 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CMTM6Q9NX76 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CMTM6Q9NX76 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CMTM6Q9NX76 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CMTM6Q9NX76 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CMTM6Q9NX76 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CMTM6Q9NX76 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CMTM6Q9NX76 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CMTM6Q9NX76 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CMTM6Q9NX76 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CMTM6Q9NX76 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CMTM6Q9NX76 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CMTM6Q9NX76 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CMTM6Q9NX76 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CMTM6Q9NX76 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CMTM6Q9NX76 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CMTM6Q9NX76 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CMTM6Q9NX76 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CMTM6Q9NX76 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CMTM6Q9NX76 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CMTM6Q9NX76 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CMTM6Q9NX76 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CMTM6Q9NX76 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CMTM6Q9NX76 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CMTM6Q9NX76 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CMTM6Q9NX76 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CMTM6Q9NX76 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CMTM6Q9NX76 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CMTM6Q9NX76 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CMTM6Q9NX76 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CMTM6Q9NX76 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CMTM6Q9NX76 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CMTM6Q9NX76 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CMTM6Q9NX76 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CMTM6Q9NX76 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CMTM6Q9NX76 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CMTM6Q9NX76 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CMTM6Q9NX76 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CMTM6Q9NX76 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CMTM6Q9NX76 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CMTM6Q9NX76 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CMTM6Q9NX76 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CMTM6Q9NX76 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CMTM6Q9NX76 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CMTM6Q9NX76 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CMTM6Q9NX76 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CMTM6Q9NX76 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CMTM6Q9NX76 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CMTM6Q9NX76 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CMTM6Q9NX76 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CMTM6Q9NX76 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CMTM6Q9NX76 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CMTM6Q9NX76 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CMTM6Q9NX76 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CMTM6Q9NX76 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CMTM6Q9NX76 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CMTM6Q9NX76 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CMTM6Q9NX76 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
CMTM6Q9NX76 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CMTM6Q9NX76 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CMTM6Q9NX76 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
CMTM6Q9NX76 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CMTM6Q9NX76 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CMTM6Q9NX76 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CMTM6Q9NX76 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CMTM6Q9NX76 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CMTM6Q9NX76 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CMTM6Q9NX76 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CMTM6Q9NX76 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CMTM6Q9NX76 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CMTM6Q9NX76 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CMTM6Q9NX76 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CMTM6Q9NX76 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CMTM6Q9NX76 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CMTM6Q9NX76 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CMTM6Q9NX76 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CMTM6Q9NX76 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CMTM6Q9NX76 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms