Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVS9

PNPO, Pyridoxine-5'-phosphate oxidase, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNPOQ9NVS9 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PNPOQ9NVS9 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PNPOQ9NVS9 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PNPOQ9NVS9 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
PNPOQ9NVS9 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
PNPOQ9NVS9 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PNPOQ9NVS9 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PNPOQ9NVS9 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PNPOQ9NVS9 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PNPOQ9NVS9 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PNPOQ9NVS9 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PNPOQ9NVS9 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PNPOQ9NVS9 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PNPOQ9NVS9 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PNPOQ9NVS9 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PNPOQ9NVS9 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PNPOQ9NVS9 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PNPOQ9NVS9 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PNPOQ9NVS9 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PNPOQ9NVS9 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
PNPOQ9NVS9 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PNPOQ9NVS9 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PNPOQ9NVS9 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PNPOQ9NVS9 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PNPOQ9NVS9 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
PNPOQ9NVS9 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PNPOQ9NVS9 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PNPOQ9NVS9 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
PNPOQ9NVS9 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PNPOQ9NVS9 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PNPOQ9NVS9 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PNPOQ9NVS9 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PNPOQ9NVS9 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PNPOQ9NVS9 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
PNPOQ9NVS9 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PNPOQ9NVS9 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PNPOQ9NVS9 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PNPOQ9NVS9 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PNPOQ9NVS9 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PNPOQ9NVS9 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PNPOQ9NVS9 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
PNPOQ9NVS9 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PNPOQ9NVS9 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PNPOQ9NVS9 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PNPOQ9NVS9 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PNPOQ9NVS9 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PNPOQ9NVS9 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
PNPOQ9NVS9 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PNPOQ9NVS9 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PNPOQ9NVS9 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PNPOQ9NVS9 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PNPOQ9NVS9 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PNPOQ9NVS9 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PNPOQ9NVS9 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PNPOQ9NVS9 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PNPOQ9NVS9 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PNPOQ9NVS9 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PNPOQ9NVS9 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PNPOQ9NVS9 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PNPOQ9NVS9 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PNPOQ9NVS9 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PNPOQ9NVS9 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PNPOQ9NVS9 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PNPOQ9NVS9 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PNPOQ9NVS9 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PNPOQ9NVS9 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PNPOQ9NVS9 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PNPOQ9NVS9 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PNPOQ9NVS9 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PNPOQ9NVS9 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PNPOQ9NVS9 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PNPOQ9NVS9 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
PNPOQ9NVS9 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PNPOQ9NVS9 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PNPOQ9NVS9 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PNPOQ9NVS9 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PNPOQ9NVS9 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PNPOQ9NVS9 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PNPOQ9NVS9 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PNPOQ9NVS9 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PNPOQ9NVS9 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
PNPOQ9NVS9 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PNPOQ9NVS9 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PNPOQ9NVS9 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PNPOQ9NVS9 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PNPOQ9NVS9 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PNPOQ9NVS9 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PNPOQ9NVS9 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PNPOQ9NVS9 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PNPOQ9NVS9 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PNPOQ9NVS9 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PNPOQ9NVS9 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PNPOQ9NVS9 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PNPOQ9NVS9 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PNPOQ9NVS9 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PNPOQ9NVS9 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PNPOQ9NVS9 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PNPOQ9NVS9 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PNPOQ9NVS9 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PNPOQ9NVS9 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms