Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVP1

DDX18, ATP-dependent RNA helicase DDX18, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX18Q9NVP1 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.32■■□□□ 1
DDX18Q9NVP1 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DDX18Q9NVP1 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DDX18Q9NVP1 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DDX18Q9NVP1 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
DDX18Q9NVP1 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DDX18Q9NVP1 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
DDX18Q9NVP1 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.32■■□□□ 1
DDX18Q9NVP1 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DDX18Q9NVP1 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
DDX18Q9NVP1 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DDX18Q9NVP1 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DDX18Q9NVP1 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DDX18Q9NVP1 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DDX18Q9NVP1 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DDX18Q9NVP1 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
DDX18Q9NVP1 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
DDX18Q9NVP1 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
DDX18Q9NVP1 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DDX18Q9NVP1 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DDX18Q9NVP1 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DDX18Q9NVP1 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
DDX18Q9NVP1 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DDX18Q9NVP1 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DDX18Q9NVP1 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
DDX18Q9NVP1 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DDX18Q9NVP1 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DDX18Q9NVP1 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
DDX18Q9NVP1 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DDX18Q9NVP1 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DDX18Q9NVP1 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DDX18Q9NVP1 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DDX18Q9NVP1 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DDX18Q9NVP1 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
DDX18Q9NVP1 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC21.3■■□□□ 1
DDX18Q9NVP1 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DDX18Q9NVP1 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DDX18Q9NVP1 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DDX18Q9NVP1 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.3■■□□□ 1
DDX18Q9NVP1 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DDX18Q9NVP1 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DDX18Q9NVP1 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
DDX18Q9NVP1 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
DDX18Q9NVP1 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
DDX18Q9NVP1 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.29■■□□□ 1
DDX18Q9NVP1 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
DDX18Q9NVP1 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
DDX18Q9NVP1 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
DDX18Q9NVP1 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.29■■□□□ 1
DDX18Q9NVP1 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
DDX18Q9NVP1 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DDX18Q9NVP1 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
DDX18Q9NVP1 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DDX18Q9NVP1 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
DDX18Q9NVP1 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
DDX18Q9NVP1 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DDX18Q9NVP1 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DDX18Q9NVP1 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DDX18Q9NVP1 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DDX18Q9NVP1 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DDX18Q9NVP1 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DDX18Q9NVP1 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
DDX18Q9NVP1 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC21.28■■□□□ 1
DDX18Q9NVP1 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
DDX18Q9NVP1 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
DDX18Q9NVP1 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DDX18Q9NVP1 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
DDX18Q9NVP1 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
DDX18Q9NVP1 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DDX18Q9NVP1 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
DDX18Q9NVP1 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DDX18Q9NVP1 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DDX18Q9NVP1 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
DDX18Q9NVP1 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DDX18Q9NVP1 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
DDX18Q9NVP1 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
DDX18Q9NVP1 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DDX18Q9NVP1 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
DDX18Q9NVP1 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DDX18Q9NVP1 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DDX18Q9NVP1 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
DDX18Q9NVP1 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
DDX18Q9NVP1 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
DDX18Q9NVP1 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
DDX18Q9NVP1 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DDX18Q9NVP1 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DDX18Q9NVP1 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DDX18Q9NVP1 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DDX18Q9NVP1 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DDX18Q9NVP1 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DDX18Q9NVP1 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DDX18Q9NVP1 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DDX18Q9NVP1 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
DDX18Q9NVP1 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DDX18Q9NVP1 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DDX18Q9NVP1 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
DDX18Q9NVP1 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
DDX18Q9NVP1 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DDX18Q9NVP1 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DDX18Q9NVP1 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms